| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_20 | 16208 = | 70 (0.420) | 75 (0.550) | 33/212 | 1.9 | 54.5% | intergenic (‑66/‑80) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_20 | 16359 = | 68 (0.500) | coding (72/117 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
TTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < TrimmedAssembly_T66_contig_20/16358‑16208‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGCCGTCTAT > TrimmedAssembly_T66_contig_20/16359‑16490 CGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTA > 2:861510/1‑136 CATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCCATATTTTTGATACGATTCGTCATGGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAA > 1:2169485/1‑136 CATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAA > 2:1511360/1‑136 CATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAA > 2:1511372/1‑136 CATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAA > 2:1911754/1‑136 CATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAA > 2:196848/1‑136 TTTAAAAAAATAGTTCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATG < 1:414145/136‑1 TTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATG < 1:1576354/136‑1 TTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATG < 1:1291453/136‑1 TTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGC < 1:1310438/136‑1 TAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCG < 1:2381440/136‑1 TAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCG > 1:1212765/1‑136 AAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGA < 2:1008971/136‑1 AAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGA < 1:1993765/136‑1 AAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAA > 2:170315/1‑136 GCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATT < 1:539670/135‑1 GAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAG < 1:1511360/136‑1 GAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAG < 1:1511372/136‑1 ATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGAC < 1:1650814/136‑1 TTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACG < 2:962784/136‑1 TAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATA < 2:1914717/135‑1 AAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATT > 2:1056210/1‑136 AAATCAATAATTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAATACGAATAGTTATATT > 1:1259071/1‑136 CAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATATTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTT > 2:227013/1‑136 ATATTTTTGATACGATTCGTCAGTGCCGCTCGATAACCGGATCCTTGACTACCTCAATTAAGTCAACGTGTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAA < 1:1876421/136‑1 GATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTT < 2:2045285/136‑1 TACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTAT < 2:868919/136‑1 CGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATT > 1:1914046/1‑136 CGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATT > 2:1356133/1‑136 CGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATT > 1:617795/1‑136 CGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATT > 1:1219290/1‑136 GATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATA > 2:1973733/1‑136 GATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATA > 1:947691/1‑136 GATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATA > 2:401547/1‑136 GATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATA > 1:2069794/1‑136 TAACCGTCTCCTTGACGACCTCAATTAAGTAAACGTTACACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTACCAATATTATTATTGCATAAT < 1:1021999/136‑1 CCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATT > 1:1072080/1‑136 CCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATT < 1:1911754/136‑1 TTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTT > 1:19529/1‑135 TTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTT > 1:947963/1‑135 GACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAA > 2:259345/1‑136 GACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAA > 2:2452361/1‑136 GACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAA > 1:579094/1‑136 GACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAA > 2:1761114/1‑136 GACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAA > 1:610423/1‑136 GACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAA > 2:2332843/1‑136 GACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAA > 2:792042/1‑136 GACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAA > 1:904158/1‑136 ACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAA > 2:1502887/1‑136 ACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAA > 2:658491/1‑136 ACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAA > 1:1550769/1‑136 CAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATA > 1:2266394/1‑134 AATTAAGTCAACGTTTCAATCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATAAATAATAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTTCATAATTACAAAATTTACACAAATAAat > 1:2167127/1‑134 ATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTT < 1:1056210/136‑1 ATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTT < 2:947605/136‑1 ATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTT < 2:947691/136‑1 TTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAAT > 2:607364/1‑112 TTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAAT < 1:607364/112‑1 AACTTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACC < 1:1726568/136‑1 AACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACC < 1:1722359/136‑1 AACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACC < 1:1356133/136‑1 AACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACC < 2:947963/136‑1 AACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACC < 1:1761114/136‑1 AACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACC < 2:472607/136‑1 AACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACC < 2:1072080/136‑1 AACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACC < 2:1003044/136‑1 AACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACC < 1:670734/136‑1 ACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCG > 2:2328086/1‑136 ACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACAC < 2:537833/118‑1 CGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGG < 1:1276056/136‑1 TTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTC > 1:2284319/1‑136 TTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTC > 1:831350/1‑136 TTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTC > 1:877770/1‑136 TTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGT > 1:1280153/1‑135 TTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTAT < 1:476757/78‑1 TTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTAT < 1:476902/78‑1 TTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTAT > 2:476902/1‑78 TTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTAT > 2:476757/1‑78 TCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTT < 2:904158/136‑1 TCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTT > 1:1116413/1‑136 CGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTT > 2:2148106/1‑136 AATATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGC < 2:579094/136‑1 TATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTG > 1:1000468/1‑136 TATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTG > 1:1000396/1‑136 TATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACAC < 2:672840/103‑1 TATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACAC > 1:672840/1‑103 TATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAG > 1:2003000/1‑35 TATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAG < 2:2003000/35‑1 TAAAAATCATTCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAA < 2:815804/136‑1 TAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAA < 2:2216079/136‑1 TAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAA < 1:2328086/136‑1 AAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAAT > 2:468484/1‑136 AAAATCATGCGAATCAATTATTAAGTCGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTCCCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATA > 2:1159442/1‑136 AAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATA > 2:52367/1‑135 AATCATGCTAATCAATTATTTAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTAAAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCTCAGTTTAGATGGTCAAAAATAGC < 2:2167127/136‑1 AATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGC < 2:1234629/136‑1 AATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGC < 1:1619779/136‑1 AATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGC < 1:401547/136‑1 ATCATGCGAATAAATTATTAAGACTAATAGTTATATTTGTTAACAAAATTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGCC < 2:1259071/136‑1 GAATCACTTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACCGTTTAGCTGGTCAAAAATAGCCGTCTAT < 2:1714839/135‑1 TTCGCATGATTTTTAAAAAAATAGTGCGAATTGATTCCTGTTAAATCAATATTTTTGATACGATTCGTCATTGCCGCTCGATAACCGTATCCTTGACGACCTCAATTAAGTCAACGTTTCACTCGCAATATTTTTTTAAAAATCATGCGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < TrimmedAssembly_T66_contig_20/16358‑16208‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGCCGTCTAT > TrimmedAssembly_T66_contig_20/16359‑16490 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |