New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_20 | 16208 = | 70 (0.420) | 75 (0.550) | 33/212 | 1.9 | 54.5% | intergenic (‑66/‑80) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | TrimmedAssembly_T66_contig_20 | 16359 = | 68 (0.500) | coding (72/117 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein |
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
TGCGAGTGAAACGTTGACTTAATTGAGGTCGTCAAGGATACGGTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGCCGTCTAT > TrimmedAssembly_T66_contig_20/16232‑16490 | gcgaattgattcctgttaaatcaatatttttgatacgattcgtcattgccgctcgataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAattatt < 1:539670‑M2/9‑1 (MQ=255) gaattgattcctgttaaatcaatatttttgatacgattcgtcattgccgctcgataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAg < 1:1511372‑M2/12‑1 (MQ=255) gAGTGAAACGTTGACTTAATTGAGGTCGTCAAGGATACGGTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAg < 1:2291100/136‑1 (MQ=255) tGACTTAATTGAGGTCGTCAAGGATACGGTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGtt < 1:1230022/135‑1 (MQ=255) aaatcaataattttgatacgattcgtcattgccgctcgataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAATACGAATAGTTATAtt > 1:1259071‑M2/110‑136 (MQ=255) caatatttttgatacgattcgtcattgccgctcgataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatatttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGtt > 2:227013‑M2/106‑136 (MQ=255) gAGGTCGTCAAGGATACGGTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCGAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTa > 2:1766344/1‑135 (MQ=255) gAGGTCGTCAAGGATACGGTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTa > 2:73037/1‑135 (MQ=255) atatttttgatacgattcgtcagtgccgctcgataaccggatccttgactacctcaattaagtcaacgtgtcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTaa < 1:1876421‑M2/33‑1 (MQ=255) gtcAAGGATACGGTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGa > 2:1318954/1‑110 (MQ=255) gtcAAGGATACGGTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGa < 1:1318954/110‑1 (MQ=255) gatacgattcgtcattgccgctcgataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACttt < 2:2045285‑M2/41‑1 (MQ=255) aTACGGTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTttatt < 1:1952941/134‑1 (MQ=255) ggTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAat > 1:2137754/1‑136 (MQ=255) ttATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAatat > 1:415201/1‑136 (MQ=255) tATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTATAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAAtatt > 2:521920/1‑136 (MQ=255) aGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGTCGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTGTATTAACAAtattattat > 2:2006768/1‑136 (MQ=255) aGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAAtattattat > 2:1858247/1‑136 (MQ=255) aGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAAtattattat > 2:438503/1‑136 (MQ=255) aGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAAtattattat > 2:2071841/1‑136 (MQ=255) cgctcgataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATattattatt > 1:617795‑M2/78‑136 (MQ=255) cgctcgataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATattattatt > 2:1356133‑M2/78‑136 (MQ=255) ggCAATGACGTATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGTAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTg < 1:94103/135‑1 (MQ=255) ggCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCCCTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTAGTAACAATATTATTATTg < 2:715098/135‑1 (MQ=255) cAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTttat > 1:722216/1‑116 (MQ=255) cAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCAt > 1:151382/1‑136 (MQ=255) cAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCAt > 1:2379323/1‑136 (MQ=255) gataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATa > 1:947691‑M2/73‑136 (MQ=255) gataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATa > 2:1973733‑M2/73‑136 (MQ=255) gataaccgtatccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATa > 1:2069794‑M2/73‑136 (MQ=255) aTGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATaa > 2:1619779/1‑136 (MQ=255) taaccgtctccttgacgacctcaattaagtaaacgttacactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTACCAATATTATTATTGCATAAt < 1:1021999‑M2/66‑1 (MQ=255) cGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAAt < 1:1784623/136‑1 (MQ=255) gTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAAtt < 2:2256870/136‑1 (MQ=255) ccttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAAtt < 1:1911754‑M2/75‑1 (MQ=255) ttgacgacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAAttt > 1:19529‑M2/60‑135 (MQ=255) aaaaaTATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTacac < 2:107388/136‑1 (MQ=255) aaaaTATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACaa < 1:615664/104‑1 (MQ=255) gacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACaa > 1:904158‑M2/55‑136 (MQ=255) gacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACaa > 2:259345‑M2/55‑136 (MQ=255) gacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACaa > 2:2332843‑M2/55‑136 (MQ=255) gacctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACaa > 2:1761114‑M2/55‑136 (MQ=255) acctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACaaa > 2:658491‑M2/54‑136 (MQ=255) acctcaattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACaaa > 1:1550769‑M2/54‑136 (MQ=255) caattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATa > 2:197556‑M2/50‑134 (MQ=255) caattaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATa > 1:2266394‑M2/50‑134 (MQ=255) gATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCACTTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTCACAAACTTTATTAACAAGATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACCCAAATAACtt < 2:295366/136‑1 (MQ=255) gATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACtt < 1:143640/136‑1 (MQ=255) gATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACtt < 2:26453/136‑1 (MQ=255) attaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACtt < 1:1056210‑M2/89‑1 (MQ=255) attaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACtt < 2:947605‑M2/89‑1 (MQ=255) ttaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAAt > 2:607364‑M2/47‑112 (MQ=255) ttaagtcaacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAAt < 1:607364‑M2/66‑1 (MQ=255) tttAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTg < 1:1160331/136‑1 (MQ=255) atgAATAAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATAATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTTTTAACAAACTTTCTTAACAATATTATTATAGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 2:614532/134‑1 (MQ=255) aacttttcactctcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 1:1276837‑M2/97‑1 (MQ=255) aacttttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 1:1726568‑M2/97‑1 (MQ=255) aacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 2:1072080‑M2/97‑1 (MQ=255) aacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 1:1761114‑M2/97‑1 (MQ=255) aacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 1:1356133‑M2/97‑1 (MQ=255) aacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 2:1003044‑M2/97‑1 (MQ=255) aacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 2:947963‑M2/97‑1 (MQ=255) aacgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 2:472607‑M2/97‑1 (MQ=255) acgtttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTacac < 2:537833‑M2/80‑1 (MQ=255) aaTCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 1:98658/133‑1 (MQ=255) aaTCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 2:475880/133‑1 (MQ=255) aaTCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 2:2137754/133‑1 (MQ=255) aaTCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 2:739734/133‑1 (MQ=255) aaTCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 2:2381440/133‑1 (MQ=255) aaTCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 2:1576354/133‑1 (MQ=255) aaTCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 1:2071841/133‑1 (MQ=255) aaTCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 2:1511/133‑1 (MQ=255) aaTCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 1:369843/133‑1 (MQ=255) aaTCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 1:553200/133‑1 (MQ=255) aaTCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 1:1206064/133‑1 (MQ=255) aaTCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTAcc < 2:1159529/133‑1 (MQ=255) tttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTttat > 2:476902‑M2/36‑78 (MQ=255) tttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTttat < 1:476902‑M2/43‑1 (MQ=255) tttcactcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTc > 1:831350‑M2/36‑136 (MQ=255) cAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACttt < 1:215691/74‑1 (MQ=255) cAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTcac > 2:1529924/1‑136 (MQ=255) aTTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAg > 1:354029/1‑136 (MQ=255) tcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGtt < 2:904158‑M2/107‑1 (MQ=255) tcgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGtt > 1:1116413‑M2/30‑136 (MQ=255) cgcaatatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGttt > 2:2148106‑M2/29‑136 (MQ=255) atatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTa > 2:1425302‑M2/25‑133 (MQ=255) tatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAg > 1:2003000‑M2/24‑35 (MQ=255) tatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTacac < 2:672840‑M2/80‑1 (MQ=255) tatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTacac > 1:672840‑M2/24‑103 (MQ=255) tatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTg > 1:1000468‑M2/24‑136 (MQ=255) tatttttttaaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTg > 1:1000396‑M2/24‑136 (MQ=255) taaaaatcattcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCaaaaa < 2:815804‑M2/121‑1 (MQ=255) taaaaatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCaaaaa < 1:2328086‑M2/121‑1 (MQ=255) aatcatgctaaTCAATTATTTAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTAAAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCTCAGTTTAGATGGTCAAAAATAGc < 2:2167127‑M2/125‑1 (MQ=255) aatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGc < 1:401547‑M2/125‑1 (MQ=255) aatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGc < 1:1619779‑M2/125‑1 (MQ=255) aatcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGc < 2:1234629‑M2/125‑1 (MQ=255) atcatgcgaaTCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGcc < 1:1703022‑M2/126‑1 (MQ=255) atcatgcgaaTAAATTATTAAGACTAATAGTTATATTTGTTAACAAAATTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGcc < 2:1259071‑M2/126‑1 (MQ=255) gaaTCACTTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACCGTTTAGCTGGTCAAAAATAGCCGTCTAt < 2:1714839‑M2/132‑1 (MQ=255) | TGCGAGTGAAACGTTGACTTAATTGAGGTCGTCAAGGATACGGTTATCGAGCGGCAATGACGAATCGTATCAAAAATATTGATTTAACAGGAATCAATTCGCACTATTTTTTTAAAAATCATGCGAATCAATTATTAAGACGAATAGTTATATTTGTTAACAAACTTTATTAACAATATTATTATTGCATAATTACAAAATTTACACAAATAACTTTGACTACCGGTCACAGTTTAGCTGGTCAAAAATAGCCGTCTAT > TrimmedAssembly_T66_contig_20/16232‑16490 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |