| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_26 | = 3462 | 0 (0.000) | 182 (1.080) | 52/258 | 0.5 | 100% | coding (1/702 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Mobile element protein |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_29 | 1 = | NA (NA) | coding (228/228 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Mobile element protein | |||||
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
CATGTTCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_26/3333‑3462‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCATAAGAAATCGTAGACGGAG > TrimmedAssembly_T66_contig_29/1‑134 CATGTTCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGTCCATCTTAGACGTCAATGGTTTAGAATGGT > 2:2030904/1‑136 TCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCT > 1:775074/1‑136 TCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCT > 2:1660470/1‑136 TCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAAGGGTTTAGAATGGTTTGCT > 2:1795925/1‑136 AGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATT > 2:1584364/1‑136 GTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTT > 2:713489/1‑136 ACTCAGTGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCA > 2:856968/1‑136 ACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCA > 1:604516/1‑136 ACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCA > 2:1239660/1‑136 ACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCA > 2:1823627/1‑136 AGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTT > 2:497087/1‑136 taCAATTTTCCCCTGATATTGCCACTTATACATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCTTGCGCAATCACTGCTGGTGACCCTCTTAGACGTAAATGGTTTAGACTGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTT < 1:1939844/134‑1 TTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTT < 2:731751/136‑1 TTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTT < 2:33850/136‑1 TCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTT > 1:1106964/1‑136 TCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTT > 1:2009197/1‑136 AATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTT > 1:1540543/1‑135 AATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTT > 1:24803/1‑135 AATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTT > 1:1073728/1‑135 ATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTC < 2:1246596/136‑1 TTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGG > 2:1781072/1‑135 CCTGATATAGCCAATTATAAATAGATATAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACA > 1:2224812/1‑136 TGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAAT < 2:775074/136‑1 TATAGCCCATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTATTTCGGCCACAATGC < 1:1910539/135‑1 TATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGC < 2:2009197/135‑1 TATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGC < 2:1460830/135‑1 CAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCG < 1:1838886/134‑1 AATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTT > 2:102439/1‑136 TTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTAT < 1:558379/136‑1 TTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTAT < 1:7276/136‑1 TTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTAT < 1:1351804/136‑1 TTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTAT < 1:2143866/136‑1 TTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTAT < 2:646534/136‑1 TTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTGCGGCCACAATGCGCCCGTTTAT < 2:1279987/136‑1 TAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATAT > 1:998761/1‑135 TAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATAT > 1:1406061/1‑135 TAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATAT > 1:2307655/1‑135 TAAATAGATTTAATGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATAT > 1:449814/1‑135 AATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCA < 2:1589829/136‑1 TTTAGTGGCTAGTTTAATCTCATGCGAAATCACTTCTTGTGACCTACTTATACGTATATGGTTTAGTATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCTGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTG < 2:220707/136‑1 TTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTATATGGTTTCGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTGTTACGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTG < 2:296176/136‑1 TTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTG < 1:497087/136‑1 TTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTG < 1:1267290/136‑1 TTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTG < 1:1737050/136‑1 TTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTG < 2:1651612/136‑1 TTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTG < 1:1823627/136‑1 TTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTG < 1:856968/136‑1 TAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTAT < 2:1515810/123‑1 GGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCT < 2:2224812/134‑1 TTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAAT > 1:1226290/1‑136 TTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATT < 1:365959/136‑1 TTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATT < 2:2403812/136‑1 AAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCA > 1:778492/1‑136 TCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTT < 1:2035986/136‑1 TCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGC < 1:1142437/134‑1 CATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTG < 1:1552361/136‑1 CGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAA > 1:2077036/1‑136 CGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAA > 1:691285/1‑136 CGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAA > 2:1271433/1‑136 CGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAA > 2:1836011/1‑136 CGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAA > 1:814295/1‑136 CGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTT > 1:62831/1‑131 CGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTG < 2:144101/112‑1 CGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTG < 1:1501426/112‑1 CGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTG > 2:1501426/1‑112 CGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTG > 1:144101/1‑112 CGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGG < 2:474935/82‑1 CGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGG > 1:474910/1‑82 GCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGGATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAG > 2:1921039/1‑136 GCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAG > 1:83277/1‑136 GCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAG > 2:2129388/1‑136 GCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAG < 2:469725/136‑1 GCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAG > 1:1788238/1‑136 GCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAG > 2:1336108/1‑136 GCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAG > 1:216566/1‑136 CACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGA < 1:812754/136‑1 CACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGA < 2:604516/136‑1 CTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATGCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACA > 2:1962090/1‑136 GTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGA > 1:1861483/1‑136 GACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATA > 1:1609656/1‑136 GACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATA < 1:1660470/136‑1 CCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTG < 1:1206793/94‑1 CCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTG > 2:1206793/1‑94 ATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTC > 2:2082957/1‑136 ATCTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTC > 1:23290/1‑136 CTTAGACGTAAATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTGTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCAT > 2:987986/1‑136 ATGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCATAAGAAATCGTA > 2:694371/1‑136 TGGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCATAAGAAATCGTAG > 1:543290/1‑136 GGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCATAAGAAATCGTAG > 2:391341/1‑135 GGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCATAAGAAATCGTAG > 1:566025/1‑135 GGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCATAAGAAATCGTAG > 2:519408/1‑135 GGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCATAAGAAATCGTAG > 1:1378714/1‑135 GGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCATAAGAAATCGTAG > 1:238749/1‑135 GGTTTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCATAAGAAATCGTAG > 2:881120/1‑135 GGTTTAGAAGGGTATGCTTTAATTTGGCATGCGGGTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGGTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACA > 2:266263/1‑109 TTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCATAAGAAATCGTAGACG < 2:449814/135‑1 TTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCATAAGAAATCGTAGACG < 2:1082744/135‑1 TTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCATAAGAAATCGTAGACG < 2:2389286/135‑1 TTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCATAAGAAATCGTAGACG < 1:391341/135‑1 TTAGAATGGTTTGCTTTAATTTGGCATACAGTTTAGATTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCATAAGAAATCGTAGACG < 2:2409845/135‑1 CATGTTCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_26/3333‑3462‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AATGGTTTGCTTTAATTTGGCATTCAGTTTAGTTTTTCGGCCACAATGCGCCCGTTTATATTCAGCGTTGGCCTGTGCTAATTCAGCTTGATAAGGTTGACAACGAGATAATTCATAAGAAATCGTAGACGGAG > TrimmedAssembly_T66_contig_29/1‑134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |