| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_26 | = 3462 | 0 (0.000) | 182 (1.080) | 52/258 | 0.5 | 100% | coding (1/702 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Mobile element protein |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_29 | 1 = | NA (NA) | coding (228/228 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Mobile element protein | |||||
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
CATGTTCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_26/3333‑3462 | cATGTTCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGTCCATCTTAGACGTCAATGGTTTAGaatggt > 2:2030904‑M1/1‑130 (MQ=255) tCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgct > 1:775074‑M1/1‑125 (MQ=255) tCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgct > 2:1660470‑M1/1‑125 (MQ=255) tCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAAGGGTTTAGaatggtttgct > 2:1795925‑M1/1‑125 (MQ=255) aGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatt > 2:1584364‑M1/1‑119 (MQ=255) gTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaattt > 2:713489‑M1/1‑118 (MQ=255) aCTCAGTGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggca > 2:856968‑M1/1‑114 (MQ=255) aCTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggca > 1:604516‑M1/1‑114 (MQ=255) aCTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggca > 2:1239660‑M1/1‑114 (MQ=255) aCTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggca > 2:1823627‑M1/1‑114 (MQ=255) agaATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagttt > 2:497087‑M1/1‑106 (MQ=255) ttCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtt < 2:731751‑M1/136‑35 (MQ=255) ttCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtt < 2:33850‑M1/136‑35 (MQ=255) tacaaTTTTCCCCTGATATTGCCACTTATACATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCTTGCGCAATCACTGCTGGTGACCCTCTTAGACGTAAATGGTTTAGactggtttgctttaatttggcattcagtttagtt < 1:1939844‑M1/134‑35 (MQ=255) tCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagttt > 1:1106964‑M1/1‑101 (MQ=255) tCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagttt > 1:2009197‑M1/1‑101 (MQ=255) aaTTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttt > 1:1540543‑M1/1‑99 (MQ=255) aaTTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttt > 1:24803‑M1/1‑99 (MQ=255) aaTTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttt > 1:1073728‑M1/1‑99 (MQ=255) aTTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttc < 2:1246596‑M1/136‑39 (MQ=255) ttCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcgg > 2:1781072‑M1/1‑95 (MQ=255) ccTGATATAGCCAATTATAAATAGATATAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccaca > 1:2224812‑M1/1‑91 (MQ=255) tGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaat < 2:775074‑M1/136‑48 (MQ=255) tataGCCCATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtatttcggccacaatgc < 1:1910539‑M1/135‑50 (MQ=255) tataGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgc < 2:2009197‑M1/135‑50 (MQ=255) tataGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgc < 2:1460830‑M1/135‑50 (MQ=255) cAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccg < 1:1838886‑M1/134‑55 (MQ=255) aaTTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgttt > 2:102439‑M1/1‑79 (MQ=255) ttATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttat < 1:558379‑M1/136‑60 (MQ=255) ttATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttat < 1:7276‑M1/136‑60 (MQ=255) ttATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttat < 1:1351804‑M1/136‑60 (MQ=255) ttATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttat < 1:2143866‑M1/136‑60 (MQ=255) ttATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttat < 2:646534‑M1/136‑60 (MQ=255) ttATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagttttgcggccacaatgcgcccgtttat < 2:1279987‑M1/136‑60 (MQ=255) taAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatat > 1:998761‑M1/1‑74 (MQ=255) taAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatat > 1:1406061‑M1/1‑74 (MQ=255) taAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatat > 1:2307655‑M1/1‑74 (MQ=255) taAATAGATTTAATGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatat > 1:449814‑M1/1‑74 (MQ=255) aaTAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattca < 2:1589829‑M1/136‑65 (MQ=255) tttAGTGGCTAGTTTAATCTCATGCGAAATCACTTCTTGTGACCTACTTATACGTATATGGTTTAGtatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttctgccacaatgcgcccgtttatattcagcgttg < 2:220707‑M1/136‑71 (MQ=255) tttAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTATATGGTTTCGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtgttacggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttg < 2:296176‑M1/136‑71 (MQ=255) tttAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttg < 1:497087‑M1/136‑71 (MQ=255) tttAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttg < 1:1267290‑M1/136‑71 (MQ=255) tttAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttg < 1:1737050‑M1/136‑71 (MQ=255) tttAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttg < 2:1651612‑M1/136‑71 (MQ=255) tttAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttg < 1:1823627‑M1/136‑71 (MQ=255) tttAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttg < 1:856968‑M1/136‑71 (MQ=255) tAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttat < 2:1515810‑M1/123‑60 (MQ=255) ggCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcct < 2:2224812‑M1/134‑75 (MQ=255) tttAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaat > 1:1226290‑M1/1‑54 (MQ=255) ttAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaatt < 1:365959‑M1/136‑84 (MQ=255) ttAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaatt < 2:2403812‑M1/136‑84 (MQ=255) aaGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattca > 1:778492‑M1/1‑51 (MQ=255) tCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagctt < 1:2035986‑M1/136‑90 (MQ=255) tCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagc < 1:1142437‑M1/134‑88 (MQ=255) cATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttg < 1:1552361‑M1/136‑91 (MQ=255) cgcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataa > 1:2077036‑M1/1‑42 (MQ=255) cgcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataa > 1:691285‑M1/1‑42 (MQ=255) cgcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataa > 2:1271433‑M1/1‑42 (MQ=255) cgcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataa > 2:1836011‑M1/1‑42 (MQ=255) cgcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataa > 1:814295‑M1/1‑42 (MQ=255) cgcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagctt > 1:62831‑M1/1‑42 (MQ=255) cgcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttg < 2:144101‑M1/112‑71 (MQ=255) cgcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttg < 1:1501426‑M1/112‑71 (MQ=255) cgcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttg > 2:1501426‑M1/1‑42 (MQ=255) cgcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttg > 1:144101‑M1/1‑42 (MQ=255) cgcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcgg < 2:474935‑M1/82‑41 (MQ=255) cgcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcgg > 1:474910‑M1/1‑42 (MQ=255) gcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttgggattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataag > 2:1921039‑M1/1‑41 (MQ=255) gcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataag > 1:83277‑M1/1‑41 (MQ=255) gcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataag > 2:2129388‑M1/1‑41 (MQ=255) gcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataag < 2:469725‑M1/136‑96 (MQ=255) gcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataag > 1:1788238‑M1/1‑41 (MQ=255) gcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataag > 2:1336108‑M1/1‑41 (MQ=255) gcAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataag > 1:216566‑M1/1‑41 (MQ=255) cACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttga < 1:812754‑M1/136‑101 (MQ=255) cACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttga < 2:604516‑M1/136‑101 (MQ=255) cTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcatgcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgaca > 2:1962090‑M1/1‑34 (MQ=255) gTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgaga > 1:1861483‑M1/1‑28 (MQ=255) gACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagata > 1:1609656‑M1/1‑26 (MQ=255) gACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagata < 1:1660470‑M1/136‑111 (MQ=255) ccATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttg < 1:1206793‑M1/94‑71 (MQ=255) ccATCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttg > 2:1206793‑M1/1‑24 (MQ=255) aTCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattc > 2:2082957‑M1/1‑22 (MQ=255) aTCTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattc > 1:23290‑M1/1‑22 (MQ=255) cTTAGACGTAAATGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtgtagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcat > 2:987986‑M1/1‑20 (MQ=255) aTGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcataagaaatcgta > 2:694371‑M1/1‑9 (MQ=255) tGGTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcataagaaatcgtag > 1:543290‑M1/1‑8 (MQ=255) ggTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcataagaaatcgtag > 2:391341‑M1/1‑7 (MQ=255) ggTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcataagaaatcgtag > 1:566025‑M1/1‑7 (MQ=255) ggTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcataagaaatcgtag > 2:519408‑M1/1‑7 (MQ=255) ggTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcataagaaatcgtag > 1:1378714‑M1/1‑7 (MQ=255) ggTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcataagaaatcgtag > 1:238749‑M1/1‑7 (MQ=255) ggTTTAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcataagaaatcgtag > 2:881120‑M1/1‑7 (MQ=255) ggTTTAGaagggtatgctttaatttggcatgcgggttagtttttcggccacaatgcgcccggttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgaca > 2:266263‑M1/1‑7 (MQ=255) ttAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcataagaaatcgtagacg < 2:449814‑M1/135‑132 (MQ=255) ttAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcataagaaatcgtagacg < 2:1082744‑M1/135‑132 (MQ=255) ttAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcataagaaatcgtagacg < 2:2389286‑M1/135‑132 (MQ=255) ttAGaatggtttgctttaatttggcattcagtttagtttttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcataagaaatcgtagacg < 1:391341‑M1/135‑132 (MQ=255) ttAGaatggtttgctttaatttggcatacagtttagattttcggccacaatgcgcccgtttatattcagcgttggcctgtgctaattcagcttgataaggttgacaacgagataattcataagaaatcgtagacg < 2:2409845‑M1/135‑132 (MQ=255) | CATGTTCAGGTAGTTCACTCAGGGAGAATTCAATTTTCCCCTGATATAGCCAATTATAAATAGATTTAGTGGCTAGTTTAAGCTCATGCGCAATCACTTCTGGTGACCATCTTAGACGTAAATGGTTTAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_26/3333‑3462 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |