| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_4 | 245808 = | 119 (0.590) | 111 (0.690) +AACCTAAGGAATCGTTAATTCG |
37/214 | 1.8 | 69.3% | intergenic (‑7/–) | rasttk_feature_creation_tool=tRNAscan‑SE/– | tRNA‑Asn‑GTT/– |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_6 | = 156776 | 0 (0.000) | intergenic (‑82/–) | rasttk_feature_creation_tool=tRNAscan‑SE/– | tRNA‑Thr‑GGT/– | |||||
Only 100 of 459 total aligned reads displayed.
CTAAGCCGGCATGATATAAAAATAGATGTTAACACAATTGCCAACATCTATGTCACTCCGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_4/245674‑245870 | aagtgctctacctgctgagctaaaacggcgttaattgaccctatccagtataccaaaagcatgtttaaattcaaactgtactggttgacattcaacgtaaaaaaaaggaaccgaattaacgattccttaggttGCa < 2:377820‑M1/3‑1 (MQ=255) aagtgctctacctgctgagctaaaacggcgttaattgaccctatccagtataccaaaagcatgtttaaattcaaactgtactggttgacattcaacgtaaaaaaaaggaaccgaattaacgattccttaggttGCa < 1:1165127‑M1/3‑1 (MQ=255) aaatgcgctgatgagtaccgggattcctaataatccgacccgccgtttgaatttcaaaatttagtcttagttcgcccagtaggctaatttttggcaacaaaaaaaggaatcgaattaacgattccttaggttGCAt < 1:1796378‑M2/4‑1 (MQ=255) aaatgcgctgatgagtaccgggattcctaataatccgacccgccgtttgaatttcaaaatttagtcttagttcgcccagtaggctaatttttggcaacaaaaaaaggaatcgaattaacgattccttaggttGCAt < 1:419574‑M2/4‑1 (MQ=255) aaatgcgctgatgaggaccgggattcctaagaatccgacccgccgtttgaatttcaaaatttagtcttagttcgcccagtaggctaatttttggcaacaaaaaaaggaatcgaattaacgattccttgggttGCAt < 2:3421‑M2/4‑1 (MQ=255) aaGCCGGCATGATATAAAAATAGATGTTAACACAATTGCCAACATCTATGTCACTCCGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCAt < 1:514758/136‑1 (MQ=255) aaGCCGGCATGATATAAAAATAGATGTTAACACAATTGCCAACATCTATGTCACTCCGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCAt > 2:53663/1‑136 (MQ=255) aaGCCGGCATGATATAAAAATAGATGTTAACACAATTGCCAACATCTATGTCACTCCGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCAt > 1:1478284/1‑136 (MQ=255) aaGCCGGCATGATATAAAAATAGATGTTAACACAATTGCCAACATCTATGTCACTCCGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCAt > 2:1419133/1‑136 (MQ=255) gtgctctacctgctgagctaaaacggcgttaattgaccctatccagtataccaaaagcatgtttaaattcaaactgtactggttgacattcaacgtaaaaaaaaggaaccgaattaacgattccttaggttGCATg < 1:16728‑M1/5‑1 (MQ=255) aGCCGGCATGATATAAAAATAGATGTTAACACAATTGCCAACATCTATGTCACTCCGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTACCAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATg < 1:1354189/136‑1 (MQ=255) aGCCGGCATGATATAAAAATAGATGTTAACACAATTGCCAACATCTATGTCACTCCGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATg < 2:832253/136‑1 (MQ=255) tacctgctgagctaaaacggcgttaattgaccctatccagtataccaaaagcatgtttaaattcaaactgtactggttgacattcaacgtaaaaaaaaggaaccgaattaacgattccttaggttGCATg < 1:1282607‑M1/5‑1 (MQ=255) cATGATATAAAAATAGATGTTAACACAATTGCCAACATCTATGTCACTCCGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAAc < 2:1279985/135‑1 (MQ=255) tGATATAAAAATAGATGTTAACACAATTGCCAACATCTATGTCACTCCGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGt > 1:1372199/1‑135 (MQ=255) tGATATAAAAATAGATGTTAACACAATTGCCAACATCTATGTCACTCCGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGt > 2:511927/1‑135 (MQ=255) gatgagtaccgggattcctaataatccgacccgccgtttgaatttcaaaatttagtcttagttcgcccagtaggctaatttttggcaacaaaaaaaggaatcgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTc < 2:1006057‑M2/13‑1 (MQ=255) tgctgagctaaaacggcgttaattgaccctatccagtataccaaaagcatgtttaaattcaaactgtactggttgacattcaacgtaaaaaaaaggaaccgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCt > 1:2131484‑M1/122‑136 (MQ=255) tgctgagctaaaacggcgttaattgaccctatccagtataccaaaagcatgtttaaattcaaactgtactggttgacattcaacgtaaaaaaaaggaaccgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCt > 1:922212‑M1/122‑136 (MQ=255) tgctgagctaaaacggcgttaattgaccctatccagtataccaaaagcatgtttaaattcaaactgtactggttgacatacaacgtaaaaaaaaggaaccgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCt > 2:2256691‑M1/122‑136 (MQ=255) gctgagctaaaacggcgttaattgaccctatccagtataccaaaagcatgtttaaattcaaactgtactggttgacattcaacgtaaaaaaaaggaaccgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCt < 1:52863‑M1/15‑1 (MQ=255) gctaaaacggcgttaattgaccctatccagtataccaaaagcatgtttaaattcaaactgtactggttgacattcaacgtaaaaaaaaggaaccgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTc < 2:869251‑M1/21‑1 (MQ=255) gctaaaacggcgttaattgaccctatccagtataccaaaagcatgtttaaattcaaactgtactggttgacattcaacgtaaaaaaaaggaaccgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTc < 1:769939‑M1/21‑1 (MQ=255) gctaaaacggcgttaattgaccctatccagtataccaaaagcatgtttaaattcaaactgtactggttgacattcaacgtaaaaaaaaggaaccgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTc < 2:590598‑M1/21‑1 (MQ=255) cgggattcctaataatccgacccgccgtttgaatttcaaaatttagtcttagttcgcccagtaggctaatttttggcaacacaaaaaggaatcgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTc > 2:1898462‑M2/115‑135 (MQ=255) cgggattcctaataatccgacccgccgtttgaatttcaaaatttagtcttagttcgcccagtaggctaatttttggcaacaaaaaaaggaatcgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTc > 1:857633‑M2/115‑135 (MQ=255) cgggattcctaataatccgacccgccgtttgaatttcaaaatttagtcttagttcgcccagtaggctaatttttggcaacaaaaaaaggaatcgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTc > 1:2245684‑M2/115‑135 (MQ=255) cgggattcctaataatccgacccgccgtttgaatttcaaaatttagtcttagttcgcccagtaggctaatttttggcaacaaaaaaaggaatcgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTc > 2:1459341‑M2/115‑135 (MQ=255) gattcctaataatccgacccgccgtttgaatttcaaaatttagtcttagttcgcccagtaggctaatttttggcaacaaaaaaaggaatcgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAg > 2:433946‑M2/112‑136 (MQ=255) ttcctaataatccgacccgccgtttgaatttcaaaatttagtcttagttcgcccagtaggctaatttttggcaacaaaaaaaggaatcgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAggg < 2:902072‑M2/27‑1 (MQ=255) ttcctaataatccgacccgccgtttgaatttcaaaatttagtcttagttcgcccagtaggctaatttttggcaacaaaaaaaggaatcgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAggg < 1:655693‑M2/27‑1 (MQ=255) ttcctaataatccgacccgccgtttgaatttcaaaatttagtcttagttcgcccagtaggctaatttttggcaacaaaaaaaggaatcgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAggg < 1:1199995‑M2/27‑1 (MQ=255) ttcctaataatccgacccgccgtttgaatttcaaaatttagtcttagttcgcccagtaggctaatttttggcaacaaaaaaaggaatcgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAggg > 2:1922464‑M2/110‑136 (MQ=255) ttcctaataatccgacccgccgtttgaatttcaaaatttagtcttagttcgcccagtaggctaatttttggcaacaaaaaaaggaatcgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAggg > 2:1142327‑M2/110‑136 (MQ=255) aTGTTAACACAATTGCCAACATCTATGTCACTCCGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAggg > 2:729276/1‑136 (MQ=255) tGTTAACACAATTGCCAACATCTATGTCACTCCGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAggg < 2:1835937/135‑1 (MQ=255) cggcgttaattgaccctatccagtataccaaaagcatgtttaaattcaaactgtactggttgacattcaacgtaaaaaaaaggaaccgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGa > 2:1751500‑M1/109‑136 (MQ=255) ttAACACAATTGCCAACATCTATGTCACTCCGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGc > 2:1213294/1‑136 (MQ=255) ctaataatccgacccgccgtttgaatttcaaaatttagtcttagttcgcccagtaggctaatttttggcaccaaaaaaaggaatcgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGc < 2:667100‑M2/30‑1 (MQ=255) tAACACAATTGCCAACATCTATGTCACTCCGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGc < 1:1743944/135‑1 (MQ=255) aataatccgacccgccgtttgaatttcaaaatttagtcttagttcgcccagtaggctaatttttggcaacaaaaaaaggaatcgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGa > 2:1178312‑M2/105‑136 (MQ=255) aataatccgacccgccgtttgaatttcaaaatttagtcttagttcgcccagtaggctaatttttggcaacaaaaaaaggaatcgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGa > 2:151717‑M2/105‑136 (MQ=255) taatccgacccgccgtttgaatttcaaaatttagtcttagttcgcccagtaggctaatttttggcaacaaaaaaaggaatcgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATc < 1:2041674‑M2/34‑1 (MQ=255) acaATTGCCAACATCTATGTCACTCCGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATc > 2:1736254/1‑135 (MQ=255) aattgaccctatccagtataccaaaagcatgtttaaattcaaactgtactggttgacattcaacgtaaaaaaaaggaaccgaattaacgattccttaggttGCATg > 2:2070205‑M1/102‑106 (MQ=255) aaTTGCCAACATCTATGTCACTCCGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATcccc < 2:497376/136‑1 (MQ=255) aaTTGCCAACATCTATGTCACTCCGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGATATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATcccc < 2:27727/136‑1 (MQ=255) tGCCAACATCTATGTCACTCCGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCaa < 1:1061824/136‑1 (MQ=255) ccAACATCTATGTCACTCCGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCAt > 1:1536947/1‑98 (MQ=255) ccAACATCTATGTCACTCCGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATg < 1:1021178/99‑1 (MQ=255) tatccagtataccaaaagcatgtttaaattcaaactgtactggttgacattcaacgtaaaaaaaaggaaccgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAact < 2:1552011‑M1/42‑1 (MQ=255) cgccgtttgaatttcaaaatttagtcttagttcgcccagtaggctaatttttggcaacaaaaaaaggaatcgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAactac < 2:617048‑M2/44‑1 (MQ=255) agtataccaaaagcatgtttaaattcaaactgtactggttgacattcaacgtaaaaaaaaggaaccgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCg < 2:311490‑M1/49‑1 (MQ=255) agtataccaaaagcatgtttaaattcaaactgtactggttgacattcaacgtaaaaaaaaggaaccgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCg < 1:384776‑M1/49‑1 (MQ=255) accaaaagcatgtttaaattcaaactgtactggttgacattcaacgtaaaaaaaaggaaccgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCggcgct < 1:956392‑M1/54‑2 (MQ=255) cACTCCGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCa > 2:1797289/1‑136 (MQ=255) cACTCCGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCa < 2:1571188/136‑1 (MQ=255) cACTCCGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCa > 1:1869616/1‑136 (MQ=255) tcaaaatttagtcttagttcgcccagtaggctaatttttggcaacaaaaaaaggaatcgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCTaag < 1:672045‑M2/57‑1 (MQ=255) aaaagcatgtttaaattcaaactgtactggttgacattcaacgtaaaaaaaaggaaccgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCTaag < 2:1375589‑M1/57‑1 (MQ=255) atgcatgtttaaaatcaaactgtactggttgacattcaacgtaaaaaaaatgaaccgaaaaaacgattccttaggttGCATGGCAAAGTCCTACCCTCGCAGCGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCAaagaa < 1:22076‑M1/59‑1 (MQ=255) aagcatgtttaaattcaaactgtactggttgacattcaacgtaaaaaaaaggaaccgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCTaagaa < 2:41696‑M1/59‑1 (MQ=255) cGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCaagaa > 1:563667/1‑135 (MQ=255) cGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCaagaa > 1:1771534/1‑135 (MQ=255) cGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCaagaa > 2:1695149/1‑135 (MQ=255) cGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCaagaa > 2:2184637/1‑135 (MQ=255) cGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCaagaa > 1:471855/1‑135 (MQ=255) cGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCaagaa > 2:1885001/1‑135 (MQ=255) aaatttagtcttagttcgcccagtaggctaatttttggcaacaaaaaaaggaatcgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCTaagaag < 2:2399454‑M2/60‑1 (MQ=255) tgtttaaattcaaactgtactggttgacattcaacgtaaaaaaaaggaaccgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCTAAGAAGctta < 1:2183495‑M1/64‑2 (MQ=255) ggCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTa < 1:1837565‑M2/135‑2 (MQ=255) cGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcga > 2:1995517‑M2/1‑121 (MQ=255) cGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcga > 2:1151442‑M2/1‑121 (MQ=255) gTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgac < 1:1652213‑M2/136‑17 (MQ=255) aCATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgg < 2:2453555‑M2/136‑21 (MQ=255) cATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCCACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgg > 2:228969‑M2/1‑115 (MQ=255) cATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgg > 2:1037813‑M2/1‑115 (MQ=255) cATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgg > 1:1986305‑M2/1‑115 (MQ=255) tGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgggaacag > 1:2369275‑M2/1‑110 (MQ=255) ttAACAGTCAAGCGCTCGACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTCCTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgggaacaggt > 2:1978998‑M2/1‑107 (MQ=255) attcaacgtaaaaaaaaggaaccgaattaacgattccttaggttGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGa > 1:312132‑M1/45‑72 (MQ=255) tAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgggaacaggtgt < 2:2349106‑M2/136‑31 (MQ=255) aaGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgg > 2:1107202‑M2/1‑98 (MQ=255) tctACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgggaacaggtgtatccttctcgccat > 1:1441090‑M2/1‑92 (MQ=255) tACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgggaacaggtgtatccttctcgccatcg < 1:2445104‑M2/136‑47 (MQ=255) tACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgggaacaggtgtatccttctcgccatcg > 1:2432510‑M2/1‑90 (MQ=255) cAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCCACTCCTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgggaacaggtgtatccttctcgccatcgtca > 2:1498964‑M2/1‑87 (MQ=255) cAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgggaacaggtgtatccttctcgccatcgtc < 2:1399950‑M2/135‑49 (MQ=255) cAACTGAGCTATGTCGAAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgggaacaggtgtatccttctcgccatcgtc < 1:254402‑M2/135‑49 (MQ=255) gAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgggaacaggtgtatccttctcgccatcgtcaccac < 1:79706‑M2/135‑54 (MQ=255) aTGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgggaacaggtgtatccttctcgccatcgtcaccacactatt < 1:1952556‑M2/136‑60 (MQ=255) aTGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgggaacaggtgtatccttctcgccatcgtcaccacactatt < 2:1598218‑M2/136‑60 (MQ=255) aTGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgggaacaggtgtatccttctcgccatcgtcaccacactatt < 1:27373‑M2/136‑60 (MQ=255) aTGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgggaacaggtgtatccttctcgccatcgtcaccacactatt < 1:2097330‑M2/136‑60 (MQ=255) taatCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGTGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgggaacaggtgtatccttctcgccatcgtcacaacactattgagaaacta < 1:1113134‑M2/136‑69 (MQ=255) taatCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgggaacaggtgtatccttctcgccatcgtcaccacactattgagaaactt < 1:230311‑M2/136‑69 (MQ=255) atttcgcATGGCGACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCTAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgggaacaggtgtatccttctcgccatcgtcaccacactattgagaaactt > 1:1146325‑M2/4‑68 (MQ=255) atttcgcATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCTAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgggaacaggtgtatccttctcgccatcgtcaccacactattgagaaactt < 2:2160434‑M2/133‑69 (MQ=255) cGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgggaacaggtgtatccttctcgccatcgtcaccacactattgagaaacttgtgc > 2:2097330‑M2/1‑64 (MQ=255) gCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgggaacaggtgtatccttctcgccatcgtcaccacactattgagaaacttgtgc < 1:2024916‑M2/135‑73 (MQ=255) | CTAAGCCGGCATGATATAAAAATAGATGTTAACACAATTGCCAACATCTATGTCACTCCGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_4/245674‑245870 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |