| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_36 | = 864 | 0 (0.000) | 70 (0.170) +AGTTAGATACATATTATATGTACGAAGGCATTTCATTTACACAAGATTCTTGACGCTACC |
25/138 | 0.9 | 100% | intergenic (+2/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Transposase/– |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_7 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+104) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/SAM‑dependent methyltransferase | |||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATCACGACGAGCCAGTTTACGAGCGATAA > TrimmedAssembly_T66_contig_7/1‑136 | aacgagaagtctctgaagcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccaa < 1:1110425‑M2/2‑1 (MQ=255)aacgagaagtctctgaagcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccaa < 1:608516‑M2/2‑1 (MQ=255) acgagaagtctctgaagcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAAt > 1:1850044‑M2/134‑136 (MQ=255) acgagaagtctctgaagcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAAt > 2:2254563‑M2/134‑136 (MQ=255) acgagaagtctctgaagcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAAt > 1:1903466‑M2/134‑136 (MQ=255) agtctctgaagcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAg < 1:67887‑M2/7‑1 (MQ=255) agtctctgaagcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAg < 2:270043‑M2/7‑1 (MQ=255) agtctctgaagcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAg < 2:1049302‑M2/7‑1 (MQ=255) ctctgaagcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACaa < 2:2125996‑M2/12‑1 (MQ=255) ctctgaagcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACa < 2:1850044‑M2/11‑1 (MQ=255) gaagcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctacca < 2:1722654‑M2/1‑1 (MQ=255) gaagcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctacca > 1:1722654‑M2/121‑121 (MQ=255) agcggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGctct < 1:1234765‑M2/17‑1 (MQ=255) ggatccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAAt > 2:1216808‑M2/116‑136 (MQ=255) atccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATa < 1:869790‑M2/22‑1 (MQ=255) atccaccgagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATa < 1:869781‑M2/22‑1 (MQ=255) accgagggttcaaaggactccaggacaccttggtagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCaa < 1:1406781‑M2/27‑1 (MQ=255) gagggttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAAt > 1:335920‑M2/107‑135 (MQ=255) ttcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAAc < 1:2158408‑M2/34‑1 (MQ=255) tcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACaa > 2:2233404‑M2/101‑112 (MQ=255) tcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACaa < 1:2233404‑M2/12‑1 (MQ=255) tcaaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGt > 2:227671‑M2/101‑136 (MQ=255) aaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACaa < 2:2164446‑M2/12‑1 (MQ=255) aaaggactccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACaa > 1:2164446‑M2/99‑110 (MQ=255) actccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAg < 2:1059277‑M2/41‑1 (MQ=255) actccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAg < 1:498864‑M2/41‑1 (MQ=255) actccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAg < 2:335920‑M2/41‑1 (MQ=255) actccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagataaatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAg < 2:110661‑M2/41‑1 (MQ=255) ctccaggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCt < 1:385104‑M2/43‑1 (MQ=255) aggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAAt > 2:2263612‑M2/89‑136 (MQ=255) aggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAAt > 1:200056‑M2/89‑136 (MQ=255) aggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAAt > 1:888412‑M2/89‑136 (MQ=255) aggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAAt > 1:888344‑M2/89‑136 (MQ=255) aggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAAt > 1:738059‑M2/89‑136 (MQ=255) aggacaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAAt > 2:642598‑M2/89‑136 (MQ=255) acaccttggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTc < 1:681775‑M2/50‑1 (MQ=255) ggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGa > 1:2016088‑M2/79‑136 (MQ=255) ggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGa > 2:1280960‑M2/79‑136 (MQ=255) ggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGa > 2:1551300‑M2/79‑136 (MQ=255) ggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGa > 2:358330‑M2/79‑136 (MQ=255) ggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGa > 1:1928702‑M2/79‑136 (MQ=255) ggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatatacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGa > 1:1216994‑M2/79‑136 (MQ=255) ggaagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcagttaatatacacaagattatttacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACACAAATCAAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGa > 2:1744424‑M2/79‑136 (MQ=255) aagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAATCTACAATTCATAACCGAtt > 1:1898581‑M2/77‑136 (MQ=255) aagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGAtt > 2:794728‑M2/77‑136 (MQ=255) aagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGAtt > 2:1809032‑M2/77‑136 (MQ=255) aagcatcatttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGAtt > 2:794812‑M2/77‑136 (MQ=255) aagcatcatttatataagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctacaAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGAtt > 1:1337623‑M2/77‑136 (MQ=255) catttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGttt < 2:2374354‑M2/66‑1 (MQ=255) catttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGttt < 2:1723554‑M2/66‑1 (MQ=255) tttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAg > 2:1696982‑M2/69‑75 (MQ=255) tttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAg < 1:1095909‑M2/7‑1 (MQ=255) tttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAg > 2:1095909‑M2/69‑75 (MQ=255) tttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGt > 2:1565685‑M2/69‑136 (MQ=255) tttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGt > 2:2323848‑M2/69‑136 (MQ=255) tttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGt > 2:1013657‑M2/69‑136 (MQ=255) tttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGt > 1:1428903‑M2/69‑136 (MQ=255) tttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGt > 1:833896‑M2/69‑136 (MQ=255) tttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGt > 1:674991‑M2/69‑136 (MQ=255) tttatttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctacaCATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTATAAGATACACTTCAAAACCGAATAAGTTTGt > 1:417064‑M2/69‑136 (MQ=255) tttaagttagatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAg < 1:1809032‑M2/72‑1 (MQ=255) agatacatattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATc < 2:447561‑M2/80‑1 (MQ=255) catattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGATTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTCTTAAGTGACAATCAGAtt > 2:662851‑M2/52‑136 (MQ=255) atattatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTa < 2:1862837‑M2/86‑1 (MQ=255) ttatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAata < 1:358330‑M2/89‑1 (MQ=255) tatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAatat < 2:833896‑M2/90‑1 (MQ=255) tatatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAatat < 1:227671‑M2/90‑1 (MQ=255) atatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAatat > 2:2239980‑M2/46‑135 (MQ=255) atatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAatat > 1:1401548‑M2/46‑135 (MQ=255) atatgtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATg < 1:1551300‑M2/91‑1 (MQ=255) gtacgaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGccc > 1:2447150‑M2/42‑135 (MQ=255) gaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCGACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTc > 1:2201794‑M2/38‑135 (MQ=255) gaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTc > 1:813814‑M2/38‑135 (MQ=255) gaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTc > 2:348201‑M2/38‑135 (MQ=255) gaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTc > 2:27777‑M2/38‑135 (MQ=255) gaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTc > 1:1948083‑M2/38‑135 (MQ=255) gaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTc > 2:1703996‑M2/38‑135 (MQ=255) gaaggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCACCCTc > 2:877985‑M2/38‑135 (MQ=255) aggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGc < 1:1205132‑M2/100‑1 (MQ=255) aggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGc < 1:427187‑M2/100‑1 (MQ=255) aggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCa > 2:1088309‑M2/36‑136 (MQ=255) aggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCa > 2:1829024‑M2/36‑136 (MQ=255) aggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCa > 2:2330741‑M2/36‑136 (MQ=255) aggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCa > 2:552689‑M2/36‑136 (MQ=255) aggcatttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCa > 1:88415‑M2/36‑136 (MQ=255) ttcatttacacaagattcttgacgctaccAATTAAg < 2:1262191‑M2/7‑1 (MQ=255) ttacacaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCGTAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATCac < 1:2121560‑M2/112‑1 (MQ=255) acaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCACTCacgacg < 1:412313‑M2/116‑1 (MQ=255) acaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATCacgacg < 1:2254563‑M2/116‑1 (MQ=255) acaagattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATCacgacg < 2:674015‑M2/116‑1 (MQ=255) gattcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGaa > 1:1262191‑M2/17‑36 (MQ=255) tcttgacgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATCACGACGAGCCAGt > 2:568252‑M2/14‑136 (MQ=255) acgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACCATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATCACGACGAGCCAGTTTAc > 1:1092229‑M2/9‑135 (MQ=255) acgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAata < 1:1934379‑M2/89‑1 (MQ=255) acgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAata > 2:1934379‑M2/9‑97 (MQ=255) acgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATCACGACGAGCCAGTTTACg > 1:230550‑M2/9‑136 (MQ=255) acgctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATCACGACGAGCCAGTTTACg > 2:2112466‑M2/9‑136 (MQ=255) gctaccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATCACGACGAGCCAGTTTACGAg < 2:1428903‑M2/130‑1 (MQ=255) taccAATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATCACGACGAGCCAGTTTACGAGc < 2:1903466‑M2/131‑1 (MQ=255) aaTTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATCACGACGAGCCAGTTTACGAGCGATaa > 2:922069/1‑136 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AATTAAGTACAAGCTCTGAATACTCAAATCCAACGTTTAAGCTACAATTCATAACCGATTACGTTTGTTAAGTGCCAATCCGATTAATATGCCCCCTCGCAACCTCAATCACGACGAGCCAGTTTACGAGCGATAA > TrimmedAssembly_T66_contig_7/1‑136 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |