| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_4 | 245808 = | 111 (0.520) | 96 (0.570) +AACCTAAGGAATCGTTAATTCG |
34/216 | 2.3 | 67.5% | intergenic (‑7/–) | rasttk_feature_creation_tool=tRNAscan‑SE/– | tRNA‑Asn‑GTT/– |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_6 | = 156776 | 0 (0.000) | intergenic (‑82/–) | rasttk_feature_creation_tool=tRNAscan‑SE/– | tRNA‑Thr‑GGT/– | |||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
AGCTTCTTGGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < TrimmedAssembly_T66_contig_4/245869‑245808‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGTCGGCAG < TrimmedAssembly_T66_contig_6/156776‑156642 |||||||||||||||||||||| AGCTTCTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATG < 1:361999/136‑1 CTTCTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCT > 1:1149173/1‑136 CTTCTTAGCGCCGAGAGGAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGCCGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTGTACGTTGAAGGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTATTCATGgt > 2:573884/1‑134 TTCTTAGCGCCGAGAGTAGTTTGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTT < 1:694181/136‑1 TTCTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTTAATTTAAACATGCTT < 2:1111122/136‑1 TTCTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTT < 1:2000028/136‑1 TTCTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTT < 1:1910899/136‑1 TTCTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTT < 2:2244376/136‑1 TTCTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTT < 2:120451/136‑1 TTCTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTT < 1:1583097/136‑1 TTCTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGC < 1:2205223/134‑1 aGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATTCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGT < 2:2317691/135‑1 aGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGT < 2:1029712/135‑1 aGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGT < 2:126699/135‑1 aGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGT < 2:1963778/135‑1 aGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGT < 2:189123/135‑1 aGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGT < 2:1727369/135‑1 aGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGT < 1:939100/135‑1 aGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGT < 1:1126193/135‑1 aGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGT < 1:1034405/135‑1 aGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGT < 1:1034264/135‑1 GCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTA > 2:2533218/1‑136 CGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGTTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAATCATGCTTTTGGTATACT < 1:2401891/136‑1 CGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACT < 1:2368195/136‑1 GAGAGTAGTTGGGGTATCGCTCCCTGCGAGGGTATGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTG < 2:908914/136‑1 GAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTG < 1:1530607/136‑1 GAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGG < 1:2311029/135‑1 GTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATA > 1:571285/1‑136 GTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATA > 2:914135/1‑136 AGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATA < 1:2242409/134‑1 GATCGCTCCCTGCGAGGGTCGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATT < 2:1535818/135‑1 GATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCATCATATGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTTATCATGCTTTTGTTATACTGTATTGGGTCAATT < 2:183341/135‑1 GATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATT < 1:315676/135‑1 GATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATT < 2:108939/135‑1 TCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAATCATGCTTTTGGTATCCTGGATAGGGTCAATTAAC > 1:809587/1‑136 TCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAAC > 2:1229626/1‑136 TCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAAC > 2:392278/1‑136 GCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACG > 2:2052357/1‑135 GCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTC > 1:2144944/1‑77 GCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTC < 2:2144944/77‑1 TCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAATCATGCTTTTGGTATACTGGTTAGGGTCTGTTTACGCCG > 2:2491744/1‑136 TCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCG < 2:998836/136‑1 GAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCTGTTACTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGC < 1:958060/136‑1 GAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGC < 1:572443/136‑1 GAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGC < 2:1308096/136‑1 GAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTA > 1:454632/1‑134 GAGGGTAGGACGATGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTA > 1:1749303/1‑134 GTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTC < 2:2224709/134‑1 GTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTC < 2:622090/134‑1 AGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATT < 1:608612/116‑1 AGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATT > 2:608612/1‑116 AGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGAGAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGC < 2:2192347/135‑1 GACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGG > 1:2375202/1‑136 CGTTGCCATGCAACCTTAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTA < 1:412638/136‑1 CGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTTTACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTA < 1:953793/136‑1 CGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCACTTAACGCCGTTGTAGCTCAGCAGGTA > 2:883628/1‑136 CGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTA < 1:915770/136‑1 CGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTA < 1:2533218/136‑1 CGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTA > 1:267020/1‑136 CGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTA > 2:883624/1‑136 CATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGC > 2:1306442/1‑134 CATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGC > 1:2424067/1‑134 CATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGC > 2:787533/1‑134 CATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGC > 1:1398019/1‑134 CATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGC > 2:2494406/1‑134 CATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGC > 1:2424051/1‑134 CATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTC < 1:919707/122‑1 CATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTC > 2:919707/1‑122 CATGCAACCTAAGGAATCGTGAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACAGGCGTTTGGTATACTGGAGAGGGTCAATTAACGCCGGTGTAGCTCAGCAGGTAGAGC > 2:155736/1‑134 ATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACT > 2:1771008/1‑136 ATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACT > 1:1343761/1‑136 ATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACT > 2:1297019/1‑136 ATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACT > 2:206897/1‑136 ATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACT > 2:2146773/1‑136 ATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGA > 1:1016260/1‑46 ATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGA < 2:1016260/46‑1 TGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTT < 1:2052357/136‑1 TGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTT < 1:231836/136‑1 TGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTT < 2:1761326/136‑1 AACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCC < 2:2424051/135‑1 ACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCAT < 1:2074042/136‑1 ACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCAT < 1:1366258/136‑1 AAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTA > 2:2339389/1‑136 GGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGAGAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAG > 2:2049415/1‑136 ATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAA > 1:592125/1‑136 ATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAA < 2:1757874/136‑1 ATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAA > 2:2532193/1‑136 TAATTCTGTTTATTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGATTGAAATTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTATCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGT < 2:988939/136‑1 TAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGT < 1:1049112/136‑1 TAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGT < 2:988955/136‑1 TAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGG > 1:1019245/1‑135 TAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGG > 1:792070/1‑135 TAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGG > 1:1307463/1‑135 TAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTT < 2:1756011/97‑1 TAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTT > 1:1756011/1‑97 TAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGAGAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGG > 2:1799444/1‑135 TAATGCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGT < 1:75815/136‑1 TAATACGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGAGAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGG > 2:2458016/1‑135 TCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGTCGGC > 2:1729445/1‑136 GGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGTCGGCAG > 2:709037/1‑136 |||||||||||||||||||||| AGCTTCTTGGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < TrimmedAssembly_T66_contig_4/245869‑245808‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGTCGGCAG < TrimmedAssembly_T66_contig_6/156776‑156642 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |