| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 455 total aligned reads displayed.
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aatgcgctgatgagtaccgggattcctaataatccgacccgccgtttgaatttcaaaatttagtcttagttcgcccagtaggctaatttttggcaacaaaaaaaggaatcgaattaacgattccttaggttGCATg < 2:1640690‑M2/5‑1 (MQ=255) aatgcgctgatgagtaccgggattcctaataatccgacccgccgtttgaatttcaaaatttagtcttagttcgcccagtaggctaatttttggcaacaaaaaaaggaatcgaattaacgattccttaggttGCATg < 1:1825100‑M2/5‑1 (MQ=255) aatgcgctgatgagtaccgggattcctaataatccgacccgccgtttgaatttcaaaatttagtcttagttcgcccagtaggctaatttttggcaacaaaaaaaggaatcgaattaacgattccttaggttGCATg < 1:1107716‑M2/5‑1 (MQ=255) atgcgctgatgagtaccgggattcctaataatccgacccgccgtttgaatttcaaaatttagtcttagttcgcccagtaggctaatttttggcaacaaaaaaaggaatcgaattaacgattccttaggttGCATgg < 1:596383‑M2/6‑1 (MQ=255) atgcgctgatgagtaccgggattcctaataatccgacccgccgtttgaatttcaaaatttagtcttagttcgcccagtaggctaatttttggcaacaaaaaaaggaatcgaattaacgattccttaggttGCATgg < 1:174838‑M2/6‑1 (MQ=255) gctctacctgctgagctacaccggcgttaattgaccctctccagtataccaaacgcctgtttaaattcaaactgtactggttgacattcaacgtaaaaaaaaggaaccgaattcacgattccttaggttGCATg > 2:155736‑M1/130‑134 (MQ=255) 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atttcgcATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCTAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgggaacaggtgtatccttctcgccatcatcaccacactatgtgaaactaa < 2:717413‑M2/133‑69 (MQ=255) atttcgcATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCTAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgggaacaggtgtatccttctcgccatcatcaccacactatgtgaaactaa > 1:1094034‑M2/4‑68 (MQ=255) cGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgtgaacaggtgtatccttctcgccatcgtcaccacactattgagaaacttgtgc > 2:1350920‑M2/1‑64 (MQ=255) cGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgggaacaggtgtatccttctcgccatcgtcaccacactattgagaaacttgtgc > 1:2470996‑M2/1‑64 (MQ=255) cGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTTaacttctgtgttcgacatgggaacaggtgtatccttctcgccatcgtcaccacactattgagaaacttgtgc > 2:1126245‑M2/1‑64 (MQ=255) | CTAAGCCGGCATGATATAAAAATAGATGTTAACACAATTGCCAACATCTATGTCACTCCGACAGGCGGGCTCGAACCGTCGACATCTTGATTAACAGTCAAGCGCTCTACCAACTGAGCTATGTCGGAATAATCGCATGGCAACGTCCTACCCTCGCAGGGAGCGATCCCCCAACTACTCTCGGCGCCAAGAAGCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_4/245674‑245870 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |