New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
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taTGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAA > 1:891351/3‑125 taTGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAA < 2:891351/123‑1 TGCATTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGTA > 1:1358123/1‑136 aTTTACACAAGATATTTTACGCTCTCTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGTATA < 2:1168001/134‑1 CAAGATATTTTACGCTCTCTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGTATAGCAAATAT > 1:1854883/1‑136 AGATATTTTACGCTCTCTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGTATAGCAAATATGT < 2:2461481/136‑1 AGATATTTTACGCTCTCTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGTATAGCAAATATGT < 1:491717/136‑1 ATTTTACGCTCTCTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGTATAGCAAATATGTGT > 2:324437/1‑134 ATTTTACGCTCTCTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGTATAGCAAATATGTGT > 2:2454150/1‑134 ATTTTACGCTCTCTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGTATAGCAAATATGTGT > 1:908740/1‑134 ATTTTACGCTCTCTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGTATAGCAAATATGTGT > 1:1915881/1‑134 ATTTTACGCTCTCTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGTATAGCAAATATGTGT > 1:1228087/1‑134 TTTTACGCTCTCTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGTATAGCAAATATGTGTTCT < 2:1970998/136‑1 CTCTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGTATAGCAAATATGTGTTCTAATTAACTC > 2:2520411/1‑136 GGTAAGTTCATTCATGGGGAATGCCTCCTGTGATGTTTTCTGTGGTTACTAAATATCATAAGGGAAGGCATTCCCTATTTCTATACAATTTAGAAATCTTTTGTGCGTTTACACAAGATATTTTACGCTCTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_1/88482‑88613 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGTATAGCAAATATGTGTTCTAATTAACTC > TrimmedAssembly_T66_contig_14/1‑133 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |