New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_1 | = 88613 | 152 (0.970) | 210 (1.080) | 68/260 | 0.1 | 73.4% | coding (224/300 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein |
? | TrimmedAssembly_T66_contig_14 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+1) | –/rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | –/hypothetical protein |
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGTATAGCAAATATGTGTTCTAATTAACTC > TrimmedAssembly_T66_contig_14/1‑133 | ggtaagttcattcatggggaatgcctcctgtgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGAt > 2:127588‑M2/133‑136 (MQ=255) taagttcattcatggggaatgcctcctgtgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGAtt > 1:1714706‑M2/131‑135 (MQ=255) tcattcatggggaatgcctcctgtgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCa > 1:744779‑M2/126‑133 (MQ=255) tcattcatggggaatgcctcctgtgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCt < 1:480108‑M2/11‑1 (MQ=255) cttggggtatgcctcctgtgttgttttctgtggttactaaatatcataagggtaggcattccctttttatatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTg < 1:1506295‑M2/16‑1 (MQ=255) catggggaatgcctcctgtgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTg < 2:2408836‑M2/16‑1 (MQ=255) catggggaatgcctcctgtgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTg < 1:649578‑M2/16‑1 (MQ=255) catggggaatgcctcctgtgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTg < 2:1242695‑M2/16‑1 (MQ=255) catggggaatgcctcctgtgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTg < 1:2328484‑M2/16‑1 (MQ=255) catggggaatgcctcctgtgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTg < 1:70688‑M2/16‑1 (MQ=255) catggggaatgcctcctgtgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTg < 2:1837047‑M2/16‑1 (MQ=255) catggggaatgcctcctgtgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTg < 1:212887‑M2/16‑1 (MQ=255) catggggaatgcctcctgtgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTg < 1:1977151‑M2/16‑1 (MQ=255) catggggaatgcctcctgtgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTg < 1:1635398‑M2/16‑1 (MQ=255) catggggaatgcctcctgtgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTg < 1:511734‑M2/16‑1 (MQ=255) catggggaatgcctcctgtgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTg < 2:744779‑M2/16‑1 (MQ=255) catggggaatgcctcctgtgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTg < 2:1044546‑M2/16‑1 (MQ=255) catggggaatgcctcctgtgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcagtccctatttctatacaattcagaaatctttgatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTg < 2:2120442‑M2/16‑1 (MQ=255) gaatgcctcctgtgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCa < 1:2564128‑M2/21‑1 (MQ=255) aatgcctcctgtgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGa > 1:367027‑M2/114‑136 (MQ=255) aatgcctcctgtgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGa > 2:847691‑M2/114‑136 (MQ=255) aatgcctcctgtgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGa > 2:1362346‑M2/114‑136 (MQ=255) gcctcctgtgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAata < 1:141571‑M2/26‑1 (MQ=255) gcctcctgtgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAata < 2:1129358‑M2/26‑1 (MQ=255) gcctcctgtgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAata > 1:1483195‑M2/111‑136 (MQ=255) ctcctgtgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATg > 1:2511511‑M2/109‑136 (MQ=255) gtgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTg > 2:2060714‑M2/104‑135 (MQ=255) tgatgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTg > 2:354302‑M2/103‑134 (MQ=255) atgttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTg > 1:243282‑M2/101‑132 (MQ=255) gttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTaaa < 1:2009672‑M2/38‑1 (MQ=255) ttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcataaatcttttatgcatttacacaataaattttacgctctcTGATTTCATATGTTTGAAACAGAATATGATTGACTaaa > 2:1074435‑M2/98‑135 (MQ=255) ttttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTaaa > 2:1743176‑M2/98‑135 (MQ=255) tttctgtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATc < 2:773805‑M2/40‑1 (MQ=255) gtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTaa > 1:1883667‑M2/92‑136 (MQ=255) gtggttactaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTaa > 1:1135825‑M2/92‑136 (MQ=255) actaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCa > 1:305020‑M2/86‑135 (MQ=255) ctaaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCa > 2:2514609‑M2/85‑134 (MQ=255) aaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACt > 2:1510454‑M2/83‑135 (MQ=255) aaatatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACt > 2:1063137‑M2/83‑135 (MQ=255) atatcataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCg < 1:2249258‑M2/56‑1 (MQ=255) ataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTaa > 1:2087884‑M2/76‑136 (MQ=255) ataagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTaa > 2:664939‑M2/76‑136 (MQ=255) aagggaaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAAt < 1:2239500‑M2/63‑1 (MQ=255) aaggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACg > 2:1966138‑M2/69‑136 (MQ=255) aggcattccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACg < 1:1063137‑M2/68‑1 (MQ=255) aggaattccctatttctatactattcagaaatcttttattcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTTTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACg < 1:2338965‑M2/68‑1 (MQ=255) attccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTaa > 2:1435120‑M2/64‑136 (MQ=255) attccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTaa < 2:1647629‑M2/73‑1 (MQ=255) ccctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAAtt > 2:283826‑M2/61‑135 (MQ=255) ctatttctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCt > 1:990628‑M2/59‑136 (MQ=255) ctatacatttgagaaatattttatgcatttacacaagataatttaagctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTACATCTTTAATTTCAACTTCGAGTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTaa < 2:565879‑M2/84‑1 (MQ=255) ctatacaattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTaa > 1:1389361‑M2/53‑136 (MQ=255) caattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGt < 1:130915‑M2/89‑1 (MQ=255) caatccagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAACTCTTTCATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGt < 2:926149‑M2/89‑1 (MQ=255) aattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCttatt > 1:1542245‑M2/47‑128 (MQ=255) aattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCttatt < 2:1542245‑M2/82‑1 (MQ=255) aattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGtt > 2:374724‑M2/47‑136 (MQ=255) aattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGtt > 1:1942738‑M2/47‑136 (MQ=255) aattcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGtt > 1:2469347‑M2/47‑136 (MQ=255) attcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTg < 2:938119‑M2/91‑1 (MQ=255) attcagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTg < 2:1447780‑M2/91‑1 (MQ=255) cagaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGaaa < 1:1966138‑M2/94‑1 (MQ=255) agaaatcttttatgcatttacacaatatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAg > 2:2081238‑M2/42‑136 (MQ=255) agaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAg > 2:1470848‑M2/42‑136 (MQ=255) agaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAg > 1:94035‑M2/42‑136 (MQ=255) agaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAg > 2:813641‑M2/42‑136 (MQ=255) agaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAg > 1:814367‑M2/42‑136 (MQ=255) agaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAg > 1:2062916‑M2/42‑136 (MQ=255) agaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAg > 1:1431090‑M2/42‑136 (MQ=255) agaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAg > 2:2047975‑M2/42‑136 (MQ=255) agaaatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTATGATTAATACGTTGAAAg > 1:2273180‑M2/42‑136 (MQ=255) aatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGa < 2:1399330‑M2/96‑1 (MQ=255) aatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGAc < 1:974044‑M2/97‑1 (MQ=255) aatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGAc > 1:439914‑M2/39‑135 (MQ=255) aatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGAc < 2:486950‑M2/97‑1 (MQ=255) aatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGAc < 2:305020‑M2/97‑1 (MQ=255) aatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGAc < 1:2192674‑M2/97‑1 (MQ=255) aatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGAc < 1:644244‑M2/97‑1 (MQ=255) aatcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGATAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGAc < 2:2166031‑M2/97‑1 (MQ=255) atcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGAccc < 2:2229784‑M2/99‑1 (MQ=255) atcttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGAccc < 1:261887‑M2/99‑1 (MQ=255) ttttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCgtg < 2:350582‑M2/102‑1 (MQ=255) ttatgcatttacactatatattttacgctctcTGTTTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATATTTTATTTCCACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTGGAAAGACCCgtggt < 2:1492080‑M2/104‑1 (MQ=255) ttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCgtggt < 1:664939‑M2/104‑1 (MQ=255) ttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCgtggt < 2:2342547‑M2/104‑1 (MQ=255) ttatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCgtggt < 2:1574255‑M2/104‑1 (MQ=255) tatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGaaa > 1:891351‑M2/32‑125 (MQ=255) tatgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGaaa < 2:891351‑M2/94‑1 (MQ=255) tgcatttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGta > 1:1358123‑M2/30‑136 (MQ=255) atttacacaagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGtata < 2:1168001‑M2/109‑1 (MQ=255) caagatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGTATAGCAAatat > 1:1854883‑M2/20‑136 (MQ=255) agatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGTATAGCAAATAtgt < 2:2461481‑M2/119‑1 (MQ=255) agatattttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGTATAGCAAATAtgt < 1:491717‑M2/119‑1 (MQ=255) attttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGTATAGCAAATATgtgt > 2:324437‑M2/14‑134 (MQ=255) attttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGTATAGCAAATATgtgt > 2:2454150‑M2/14‑134 (MQ=255) attttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGTATAGCAAATATgtgt > 1:908740‑M2/14‑134 (MQ=255) attttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGTATAGCAAATATgtgt > 1:1228087‑M2/14‑134 (MQ=255) attttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGTATAGCAAATATgtgt > 1:1915881‑M2/14‑134 (MQ=255) ttttacgctctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGTATAGCAAATATGTGTTCt < 2:1970998‑M2/124‑1 (MQ=255) ctcTGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGTATAGCAAATATGTGTTCTAATTAACTc > 2:2520411‑M2/4‑136 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGATTTCATCTGGTTGTATCAGAATATGATTGACTAAATCTTTAATTTCAACTTCGCTTAAATTAACGGCTAATTTCTTATTAATACGTTGAAAGACCCGTGGTGTATAGCAAATATGTGTTCTAATTAACTC > TrimmedAssembly_T66_contig_14/1‑133 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |