| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_2 | = 291973 | 0 (0.000) | 199 (0.430) +GGTAGCGTCAAGAATCTTGTGTAAATGAAATGCCTTCGTACATATAATATGTATCTAACT |
48/140 | 0.1 | 100% | intergenic (+2/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_36 | = 864 | 0 (0.000) | intergenic (+2/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Transposase/– | |||||
Only 100 of 297 total aligned reads displayed.
AACGCTATGGACGAAAAATGTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_2/291839‑291973 | tacGCTCTGGACGAAATATGGTGGTAGTAAGATTTTGATCCAGATTCAAGTCATTGTCTTTGTCGGTGGCGATACCCCGACTCTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGTTGTGACTAATCGGGTGGCg < 2:658988‑M1/135‑2 (MQ=255)aaCGCTATGGACGAAAAATGTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGc < 2:1970544/135‑1 (MQ=255)aaCGCTATGGACGAAAAATGTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCg < 2:1665204‑M1/136‑2 (MQ=255) aCGCTATGGACGAAAAATGTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCgg > 2:759144‑M1/1‑134 (MQ=255) ggACGAAAAATGTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtc > 2:897019‑M1/1‑127 (MQ=255) aCGAAAAATGTTGGTAGTCAGAGTTTGAACCACATTCAAGACATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTAGGATAAGTAATAACTGAATCATGTGACTAATCGGGAGGCggaagcgtcaa > 1:658988‑M1/1‑125 (MQ=255) aCGAAAAATGTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaa > 2:1352515‑M1/1‑125 (MQ=255) aCGAAAAATGTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaa > 2:1386258‑M1/1‑125 (MQ=255) aCGAAAAATGTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaa > 1:2088175‑M1/1‑125 (MQ=255) aCGAAAAATGTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaa > 2:1540948‑M1/1‑125 (MQ=255) gAAAAATGTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaaga < 1:771006‑M1/136‑14 (MQ=255) aTGTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatctt > 2:73038‑M1/1‑118 (MQ=255) gTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgt < 2:100078‑M1/136‑21 (MQ=255) ttaaGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatg < 2:1702290‑M1/135‑28 (MQ=255) aaGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatg < 2:1800109‑M1/134‑28 (MQ=255) ttttGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaat < 1:749228‑M1/134‑32 (MQ=255) ttGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgcct < 1:1427235‑M1/136‑36 (MQ=255) ttGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgcct < 1:324042‑M1/136‑36 (MQ=255) ttGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgcct < 1:817205‑M1/136‑36 (MQ=255) gAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttc < 1:458384‑M1/136‑38 (MQ=255) gAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttc < 2:1730703‑M1/136‑38 (MQ=255) aCCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgt > 1:130724‑M1/1‑97 (MQ=255) ttCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatat < 1:594489‑M1/136‑46 (MQ=255) tCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatata > 1:1892673‑M1/1‑90 (MQ=255) cATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatg < 1:42644‑M1/135‑52 (MQ=255) gACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatct > 2:923332‑M1/1‑80 (MQ=255) gACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatct > 2:1142336‑M1/1‑80 (MQ=255) gACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgcct < 1:1174831‑M1/115‑36 (MQ=255) gACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgcct > 2:1174831‑M1/1‑80 (MQ=255) cGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaa > 2:1079392‑M1/1‑72 (MQ=255) cGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaa > 2:819053‑M1/1‑72 (MQ=255) cGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaa > 1:867689‑M1/1‑72 (MQ=255) ggCGATACCCAGTCACTTGTTGATGTGTTGGATAAGTTAGATCTGAATGATGTGACTAATCGGGTGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaa < 1:2367202‑M1/136‑69 (MQ=255) ggCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtatatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaa < 2:202646‑M1/136‑69 (MQ=255) ggCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaattccttcgtacatataatatgtatctaacttaattaaa < 2:1410726‑M1/136‑69 (MQ=255) ggCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaa < 2:1440829‑M1/136‑69 (MQ=255) cGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaat < 1:389240‑M1/135‑70 (MQ=255) ccAGACACTTGTTGATGTGTTGGATAAGTTAGAACTGACTGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgttcatataatatgtatctaacttaaataaatgatgctt < 1:267532‑M1/136‑77 (MQ=255) ccAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgctt < 1:759152‑M1/136‑77 (MQ=255) ccAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgct > 1:1498017‑M1/1‑60 (MQ=255) cacTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgttcatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttcc < 1:1616146‑M1/133‑79 (MQ=255) cacTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatttaatatgtatctaacttaaataaatgatgcttcc < 2:2264500‑M1/133‑79 (MQ=255) cacTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaag < 1:1015282‑M1/136‑82 (MQ=255) cacTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttcc < 2:1450604‑M1/133‑79 (MQ=255) cacTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttcc < 2:289062‑M1/133‑79 (MQ=255) cacTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttcc < 1:1035209‑M1/133‑79 (MQ=255) cacTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttcc < 1:1096841‑M1/133‑79 (MQ=255) cacTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttcc < 1:1576357‑M1/133‑79 (MQ=255) cacTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttcc < 1:1335585‑M1/133‑79 (MQ=255) acTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaagg > 2:312531‑M1/1‑54 (MQ=255) cTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggt > 1:2206335‑M1/1‑53 (MQ=255) cTTGTTGATGAGTAGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatctagtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggt > 2:1090585‑M1/1‑53 (MQ=255) tgatgaTTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTATTCGGGAGGCggtagcgtcaagtatcttgtgtaaatgaaatgcattcttacatttaatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcct < 2:619337‑M1/136‑89 (MQ=255) tgatgaGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcct < 1:1812806‑M1/136‑89 (MQ=255) tgatgaGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcct < 1:1265908‑M1/136‑89 (MQ=255) tgatgaGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgt > 1:1993222‑M1/1‑48 (MQ=255) tgatgaGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgt > 1:2135381‑M1/1‑48 (MQ=255) tgatgaGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaaaaaatgatgcttccaaggtgt > 2:306943‑M1/1‑48 (MQ=255) gatgaGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaattccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgattccaaggtgt > 1:1750826‑M1/1‑47 (MQ=255) gatgaGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctg > 1:2387697‑M1/1‑47 (MQ=255) gatgaGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctg > 2:440057‑M1/1‑47 (MQ=255) gTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagt > 1:145005‑M1/1‑42 (MQ=255) tGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtcct < 2:1892673‑M1/136‑97 (MQ=255) tGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtcct < 1:1957505‑M1/136‑97 (MQ=255) tGGATAAGTTAGAACTGAATGAGGGGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaagaaatgatgcttccaaggggtcctggagtcc < 1:333233‑M1/135‑96 (MQ=255) ggATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtcctt > 1:182883‑M1/1‑39 (MQ=255) ggATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttcc < 2:2294332‑M1/117‑79 (MQ=255) ggATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttcc > 1:2294332‑M1/1‑39 (MQ=255) ggATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtac > 2:2562555‑M1/1‑39 (MQ=255) tAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtcctttga < 1:495986‑M1/136‑101 (MQ=255) tAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtcctttga < 2:2495084‑M1/136‑101 (MQ=255) tAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtcctttga > 2:2240032‑M1/1‑36 (MQ=255) tAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtcctttga < 1:1142322‑M1/136‑101 (MQ=255) tAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtcctttga < 1:2258802‑M1/136‑101 (MQ=255) tAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtcctttga < 1:1481846‑M1/136‑101 (MQ=255) gTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtag < 1:525277‑M1/38‑6 (MQ=255) cTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtcctttgaaccctcggtg < 1:142086‑M1/136‑111 (MQ=255) tGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgctgcttccaaggtgtcctggagtcctttgaaccctcggtgg < 1:901119‑M1/136‑112 (MQ=255) tGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtcctttgaaccctcggtgg > 2:1689847‑M1/1‑25 (MQ=255) tGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtac < 1:2146497‑M1/66‑42 (MQ=255) tGAATGATGTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgacttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtccttttaaccctcggtgg > 2:1927573‑M1/1‑25 (MQ=255) gatgTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctgtagtcatttgaaacctcggtggatcc > 2:2320562‑M1/1‑20 (MQ=255) gatgTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtcctttgaaccctcggtggatcc > 2:400237‑M1/1‑20 (MQ=255) gatgTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtcctttgaaccctcggtggatcc > 1:555636‑M1/1‑20 (MQ=255) gatgTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtcctttgaaccctcggtggatcc > 2:2058182‑M1/1‑20 (MQ=255) gatgTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtcctttgaaccctcggtggatcc > 2:1832974‑M1/1‑20 (MQ=255) gatgTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtcctttgaaccctcggtggatcc > 1:972737‑M1/1‑20 (MQ=255) gatgTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaagaaacgatgcatccaaggtgtcctggagtcctttgaaccctcggtggatcc > 1:2504793‑M1/1‑20 (MQ=255) gatgTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtacctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtcctttgaaccctcggtggatcc > 2:760293‑M1/1‑20 (MQ=255) gatgTGACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatctt > 2:525277‑M1/1‑20 (MQ=255) tgtgACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtcctttgaaccctcggtggatccgct < 2:2386950‑M1/136‑119 (MQ=255) gACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtcctttgaaccctcggtggatccgcttca > 1:2017875‑M1/1‑15 (MQ=255) gACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtcctttgaaccctcggtggatccgcttca > 2:836731‑M1/1‑15 (MQ=255) gACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtcct < 1:1741317‑M1/111‑97 (MQ=255) gACTAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtcct > 2:1741318‑M1/1‑15 (MQ=255) tAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtcct < 2:554027‑M1/108‑97 (MQ=255) tAATCGGGAGGCggtagcgtcaagaagcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtagctaacttaaaaaaatgatgcttccaaggtgtcctggagtccttagaaccctcggtggatccgcttctgag > 2:1230937‑M1/1‑12 (MQ=255) aTCGGGAGGCggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtcctttgaaccctcggtggatccgcttcagag > 1:790746‑M1/1‑10 (MQ=255) cggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtcctttgaaccctcggtggatccgcttcagagacttctcgtta > 2:786084‑M1/1‑1 (MQ=255) cggtagcgtcaagaatcttgtgtaaatgaaatgccttcgtacatataatatgtatctaacttaaataaatgatgcttccaaggtgtcctggagtcctttgaaccctcggtggatccgcttcagagacttctcgt < 2:2155989‑M1/134‑134 (MQ=255) | AACGCTATGGACGAAAAATGTTGGTAGTAAGATTTTGAACCAGATTCAAGTCATTGACTTTGTCGGTGGCGATACCCAGACACTTGTTGATGAGTTGGATAAGTTAGAACTGAATGATGTGACTAATCGGGAGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_2/291839‑291973 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |