| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
ATTATGATAAGAGTGGAATTTTGCTACTAGTTGTGATTATCCAAGTTTTGATCGGTAATATTGCAATGTTTCTAGGAAGAATGAGTGTTAGAGGATTGTATAATGTCTCTAACCTGATGGGTGTACAGTATTACAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_3/262448‑262583 | aTTATGATAAGAGTGGAATTTTGCTACTAGTTGTGATTATCCAAGTTTTGATCGGTAATATTGCAATGTTTCTAGGAAGAATGAGTGTTAGAGGATTGTATAATGTCTCTAACCTGATGGGTGTACAGTATTacac > 2:292601/1‑136 (MQ=255) ttATGATAAGAGTGGAATTTTGCTACTAGTTGTGATTATCCAAGTTTTGATCGGTAATATTGCAATGTTTCTAGGAAGAATGAGTGTTAGAGGATTGTATAATGTCTCTAACCTGATGGGTGTACAGTATTACACg < 1:1159895‑M1/136‑2 (MQ=255) tAAGAGTGGAATTTTGCTACTAGTTGTGATTATCCAAGTTTTGATCGGTAATATTGCAATGTTTCTAGGAAGAATGAGTGTTAGAGGATTGTATAATGTCTCTAACCTGATGGGTGTACAGTATTACACggtagcg > 1:1638429‑M1/1‑129 (MQ=255) aaGAGTGGAATTTTGCTACTAGTTGTGATTATCCAAGTTTTGATCGGTAATATTGCAATGTTTCTAGGAAGAATGAGTGTTAGAGGATTGTATAATGTCTCTAACCTGATGGGTGTACAGTATTACACggtagcgt < 1:1271085‑M1/136‑9 (MQ=255) 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ATTATGATAAGAGTGGAATTTTGCTACTAGTTGTGATTATCCAAGTTTTGATCGGTAATATTGCAATGTTTCTAGGAAGAATGAGTGTTAGAGGATTGTATAATGTCTCTAACCTGATGGGTGTACAGTATTACAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_3/262448‑262583 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |