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ccagTTTCATAATGTTTAACGCCAGTATTACGATTCCGGCTTCCTTGGTGACCTTGTCGAAACCTCGCACCGAGAATCGATTGAAATGTAAAGAAGCCTTCATCTTGCCAAAAACTGGTTCAACATCGATCTTAc < 1:167974‑M2/131‑1 (MQ=255) ccagTTTCATAATGTTTAACGCCAGTATTACGATTCCGGCTTCCTTGGTGACCTTGTCGAAACCTCGCACCGAGAATCGATTGAAATGTAAAGAAGCCTTCATCTTGCCAAAAACTGGTTCAACATCGATCTTAc < 2:749931‑M2/131‑1 (MQ=255) ccagTTTCATAATGTTTAACGCCAGTATTACGATTCCGGCTTCCTTGGTGACCTTGTCGAAACCTCGCACCGAGAATCGATTGAAATGTAAAGAAGCCTTCATCTTGCCAAAAACTGGTTCAACATCGATCTTAc < 2:917843‑M2/131‑1 (MQ=255) ccagTTTCATAATGTTTAACGCCAGTATTACGATTCCGGCTTCCTTGGTGACCTTGTCGAAACCTCGCACCGAGAATCGATTGAAATGTAAAGAAGCCTTCATCTTGCCAAAAACTGGCTCAACATCGATCTTAc < 2:2490676‑M2/131‑1 (MQ=255) ccagTTTCATAATGTTTAACGCCAGTATTACGATTCCGGCTTCCTTGGTGACCTTGTCGAAACCTCGCACCGAGAATCGATTGAAATGTAAAGAAGCCTTCATCTTGCCAAAAACTGGCTCAACATCGATCTTAc < 2:452103‑M2/131‑1 (MQ=255) ccaaTTTCATAATGTTTAACGCCAGTATTACGATTCCGGCTTCCTTGGTGACCTTGTCGAAACCTCGCACCGAGAATCGATTGAAATGTAAAGAAGCCTTCATCTTGCCAAAAACTGGCTCAACATCGATCTTAc < 1:194698‑M2/131‑1 (MQ=255) 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tttCATAATGTTTAACGCCAGTATTACGATTCCGGCTTCCTTGGTGACCTTGTCGAAACCTCGCACCGAGAATCGATTGAAATGTAAAGAAGCCTTCATCTTGCCAAAAACTGGCTCAACATCGATCTTACGTTGa < 1:1260003/136‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTTCATAATGTTTAACGCCAGTATTACGATTCCGGCTTCCTTGGTGACCTTGTCGAAACCTCGCACCGAGAATCGATTGAAATGTAAAGAAGCCTTCATCTTGCCAAAAACTGGCTCAACATCGATCTTACGTTGA > TrimmedAssembly_T66_contig_42/1‑136 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |