| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_18 | 1 = | 0 (0.000) | 223 (0.730) | 63/262 | 0.2 | 100% | intergenic (–/+69) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/hypothetical protein |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_34 | = 1203 | 0 (0.000) | intergenic (+58/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Mobile element protein/– | |||||
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
CAAGTTAAATGCTCATTTCCGACCATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < TrimmedAssembly_T66_contig_18/133‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTGTTTAAGGTATCTT < TrimmedAssembly_T66_contig_34/1203‑1069 TAAATGCTCATTTCCGACCATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATT < 2:1030939/136‑1 GCTCATTTCCGACCATTCGTCCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAA < 2:180485/136‑1 GCTCATTTCCGACCATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAA < 1:308922/136‑1 GCTCATTTCCGACCATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAA < 1:1385276/136‑1 GCTCATTTCCGACCATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAA < 2:333020/136‑1 TTCCGACCATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAG < 1:516877/136‑1 TTCCGACCATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAG > 1:522861/1‑136 TCCGACCATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGT > 1:1610496/1‑136 TCCGACCATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGT > 2:2057298/1‑136 TCCGACCATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGT < 2:413069/136‑1 TCCGACCATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGT > 2:90232/1‑136 CCGACCATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTG < 2:553290/136‑1 CCGACCATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTG < 1:1432620/136‑1 ATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCTAATCAAGTGCAAC > 1:345447/1‑134 ATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAA < 2:1183065/122‑1 ACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGA > 1:235172/1‑136 ACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGA > 1:1102131/1‑136 ACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGA > 1:209703/1‑136 CCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAA < 2:1288214/136‑1 GATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCT < 1:1048578/136‑1 TCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTG < 1:2009335/118‑1 TCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAAGTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTAT > 2:1711831/1‑135 CACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTAT > 1:1010587/1‑134 CCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTGTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAG < 2:343863/135‑1 CTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGT < 2:1133330/136‑1 CTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGT < 2:2432951/136‑1 CTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGG > 2:1628643/1‑135 GGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAACAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGT < 2:272567/135‑1 CCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCT < 1:863891/136‑1 CCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCT < 2:619918/136‑1 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCATATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 1:1136282/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAATTCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 2:1980410/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTTGTCTAGTTTCTAA > 2:965132/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTGGTTGCTca > 1:79377/1‑134 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 1:1241246/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 2:2528788/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 2:1399868/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 2:286326/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 2:1534986/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 2:119923/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 1:131064/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 1:124350/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 2:450216/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 1:957675/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 1:1729071/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 2:743578/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 1:2208544/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 1:1173513/1‑136 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAA < 2:1062214/107‑1 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACA < 2:672009/100‑1 GATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTAAAATCAAGTGCAACACTAAGAA < 2:848493/107‑1 TAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 2:2409079/1‑134 TAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAA > 2:1559222/1‑134 ATTGCACACGCGCTCAATTAAAAGTCGTGCTTTCCCGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTACGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTA < 2:2384831/136‑1 ATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTA < 1:450216/136‑1 ATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTA < 2:1920727/136‑1 TTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAG > 2:2323925/1‑136 TTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAG > 1:2462349/1‑136 TTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCATTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATACTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAG < 2:1459492/136‑1 ACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTC < 2:1852986/135‑1 ATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATC < 1:1546105/136‑1 ATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATC < 1:669746/136‑1 AAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCT < 2:2202948/136‑1 AAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTG < 1:1352867/136‑1 TCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGC > 2:808387/1‑136 CGTGCTTTCAGGATTAACTTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCA < 2:1000988/136‑1 GTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAG < 2:2510231/136‑1 GTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAG < 1:573974/136‑1 GTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAG < 1:2409079/136‑1 GTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGAATTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAG < 2:1215544/136‑1 GCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCG > 1:735158/1‑136 GCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCG > 1:2384555/1‑136 GCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGC < 2:1757148/135‑1 TTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGAT > 1:1819523/1‑136 TTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGA > 1:1071667/1‑135 GGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTC > 1:1949751/1‑136 TTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAAT < 2:1493771/136‑1 AAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGA < 1:1211335/136‑1 ATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACC < 1:694681/136‑1 ATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACC < 1:1810325/136‑1 CTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCC < 1:2115054/136‑1 GAGCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTA > 2:1731443/1‑135 GCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGC < 2:125947/135‑1 GCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGC < 1:2375268/135‑1 GCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGC < 2:357755/135‑1 GCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGC < 2:1327565/135‑1 GCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGC < 2:522861/135‑1 GCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAG < 1:1753257/134‑1 GCACGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGAAAGTTCAATGACCGCCGTAGCC > 1:1665266/1‑136 GCACGACTTATAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAG < 1:2132789/134‑1 CGACTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGT < 1:1451887/136‑1 CTTTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTG < 1:1917635/135‑1 aTTACTTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTACGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGGTGCGAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGAGAGTTCAATGACCGCCGGAGCCGGTTGTTT < 2:715130/135‑1 TTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTGTTT < 1:2167408/136‑1 TTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTGTTT < 1:2310128/136‑1 TTTAATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTGTTT < 1:2505763/136‑1 ATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTGTTTAAGG > 1:1530141/1‑136 ATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTGTTTAAGG > 2:575279/1‑136 ATTTTTCCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTGTTTAAGG > 1:362585/1‑136 CCCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTGTTTAAGGTATCTT < 2:724747/136‑1 CAAGTTAAATGCTCATTTCCGACCATTCGACCTGATTCACGACCACGTCTATGTGGTCCGATAATTGAACACGCGTTAAATTAAAAGTCGTGCTTTCAGGATTAAATTCTGAGAGCACGACTTTTAATTTTTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < TrimmedAssembly_T66_contig_18/133‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTCAATTGTCAAATCAAGTGCAACACTAAGAATCTATTCTTAGAAGTGGTCTAGTTGCTAAGCTAGTTCAGGCATTAGATCGGCTGGGCAGCGATAGTTCAATGACCGCCGTAGCCGGTTGTTTAAGGTATCTT < TrimmedAssembly_T66_contig_34/1203‑1069 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |