| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_18 | 1 = | 0 (0.000) | 223 (0.730) | 63/262 | 0.2 | 100% | intergenic (–/+69) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/hypothetical protein |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_34 | = 1203 | 0 (0.000) | intergenic (+58/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Mobile element protein/– | |||||
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCGGAAATGAGCATTTAACTTGG > TrimmedAssembly_T66_contig_18/1‑134 | aagataccttaaacaaccggctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggg < 2:724747‑M1/1‑1 (MQ=255)aagataccttaaacaaccggctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggg < 1:243254‑M1/1‑1 (MQ=255) ccttaaacaaccggctacggcggtcattgatctatcgctgcccagccgatataatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAAt > 2:1698406‑M1/130‑136 (MQ=255) ccttaaacaaccggctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAAt > 1:667181‑M1/130‑136 (MQ=255) ccttaaacaaccggctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAAt > 1:1530141‑M1/130‑136 (MQ=255) ccttaaacaaccggctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAAt > 1:1474172‑M1/130‑136 (MQ=255) ccttaaacaaccggctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAAt > 2:575279‑M1/130‑136 (MQ=255) aaacaaccggctccggcggtcattgaactctcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttcgcacctagaccacttctaagaatagattcgtagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAAGtaat < 2:715130‑M1/11‑2 (MQ=255) aaacaaccggctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTaaa < 1:2109855‑M1/11‑1 (MQ=255) aaacaaccggctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTaaa < 1:2167387‑M1/11‑1 (MQ=255) caaccggctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAg < 1:1917635‑M1/13‑1 (MQ=255) accggctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCg < 1:1451887‑M1/16‑1 (MQ=255) ggctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGc > 1:2384345‑M1/118‑136 (MQ=255) gctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctacgaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGc < 2:22746‑M1/19‑1 (MQ=255) gctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatatattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGACGTGc < 1:965132‑M1/19‑1 (MQ=255) gctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGc < 1:472246‑M1/19‑1 (MQ=255) gctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGc < 2:357755‑M1/19‑1 (MQ=255) gctacggcggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGc < 2:522861‑M1/19‑1 (MQ=255) ggtcattgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAAt > 1:2489710‑M1/109‑136 (MQ=255) attgaactatcgctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTaa < 1:1628643‑M1/32‑1 (MQ=255) gctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGc < 2:1757148‑M1/42‑1 (MQ=255) ctgcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAATTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCAc < 2:1215544‑M1/44‑1 (MQ=255) gcccagccgatctaatgcctgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGa > 2:808387‑M1/91‑136 (MQ=255) tgaactagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCgtgt < 2:1148482‑M1/65‑1 (MQ=255) ctagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCaa < 1:2003243‑M1/69‑1 (MQ=255) ctagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCaa < 1:518444‑M1/69‑1 (MQ=255) ctagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCaa < 2:1241246‑M1/69‑1 (MQ=255) ctagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCaa < 1:1559222‑M1/69‑1 (MQ=255) ctagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATACTGAAAGCACGACTTTTAATTTATCGCGTGTTCaa < 2:1022148‑M1/69‑1 (MQ=255) tagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAAt < 1:902112‑M1/70‑1 (MQ=255) tagcttagcaactagaccacttctaagaatagattcgtagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCGGGAAAGCACGACTTTTAATTGAGCGCGTGTGCAAt < 2:2384831‑M1/70‑1 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTa > 2:1559222‑M1/63‑134 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTa > 1:560251‑M1/63‑134 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTa > 2:2409079‑M1/63‑134 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 2:2192629‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 2:2505763‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 2:2528788‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 2:286326‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 2:1718586‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 2:1399868‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 2:438498‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 2:743578‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 2:1914889‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 2:1451887‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 1:1033553‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 2:1513047‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 1:1225242‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 1:1165788‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 1:124350‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 1:1729071‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 1:1756208‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 1:724747‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 1:1817457‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 1:1840648‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 1:2074322‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatatgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 1:1136282‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgaattgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 2:1980410‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagcaactagaccacgtctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaatggaggGAAAATTTAAAAGTCGTGCTCTCAGTATTTAATCCTGAATGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 2:1115007‑M1/63‑136 (MQ=255) ttagaaactagacaacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 2:965132‑M1/63‑136 (MQ=255) agcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCgg < 1:2404037‑M1/76‑1 (MQ=255) agcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCgg < 2:619918‑M1/76‑1 (MQ=255) agcaactagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCgg < 2:1847625‑M1/76‑1 (MQ=255) actagaccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTGTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGAcc < 2:272567‑M1/79‑1 (MQ=255) accacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAg < 2:1478268‑M1/85‑1 (MQ=255) accacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAg < 1:1264474‑M1/85‑1 (MQ=255) accacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAg < 2:1198497‑M1/85‑1 (MQ=255) accacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAg < 2:2432951‑M1/85‑1 (MQ=255) ccacttctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAg > 2:1628643‑M1/51‑135 (MQ=255) ctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGACAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTgg < 2:343863‑M1/91‑1 (MQ=255) ctaagaatagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTATTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTgg < 1:1711831‑M1/91‑1 (MQ=255) atagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTg > 1:232221‑M1/39‑134 (MQ=255) atagattcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTg > 1:1010587‑M1/39‑134 (MQ=255) ttcttagtgttgcacttgattttacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 1:848493‑M1/34‑107 (MQ=255) ttcttagtgttgcacttgattttacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc < 2:848493‑M1/74‑1 (MQ=255) ttcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 1:1062214‑M1/34‑107 (MQ=255) ttcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc < 2:1062214‑M1/74‑1 (MQ=255) ttcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAgg < 1:314349‑M1/103‑1 (MQ=255) ttcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAgg < 1:2205031‑M1/103‑1 (MQ=255) ttcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAgg < 1:2224314‑M1/103‑1 (MQ=255) tcttagtgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGt > 2:129013‑M1/33‑136 (MQ=255) tgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc < 2:672009‑M1/74‑1 (MQ=255) tgttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATc > 1:672009‑M1/27‑100 (MQ=255) gttgcacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAAt > 1:1332865‑M1/26‑134 (MQ=255) cacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAATAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCgg < 2:1273158‑M1/115‑1 (MQ=255) cacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCgg < 1:1432620‑M1/115‑1 (MQ=255) cacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCgg < 2:332165‑M1/115‑1 (MQ=255) cacttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCgg < 2:553290‑M1/115‑1 (MQ=255) acttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCGGa > 2:90232‑M1/21‑136 (MQ=255) acttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCGGa > 2:2057298‑M1/21‑136 (MQ=255) acttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCGGa < 2:413069‑M1/116‑1 (MQ=255) acttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCGGa > 1:42788‑M1/21‑136 (MQ=255) cttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCGGaa < 1:2120945‑M1/117‑1 (MQ=255) ttgatttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCGGaaa < 1:2361883‑M1/118‑1 (MQ=255) ttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAAt > 1:1183065‑M1/14‑122 (MQ=255) ttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCGGAAATGAGc < 1:1075365‑M1/123‑1 (MQ=255) ttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCGGAAATGAGc < 1:308881‑M1/123‑1 (MQ=255) ttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCGGAAATGAGc > 1:357755‑M1/14‑136 (MQ=255) ttgacaattgaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGACGAATGGTCGGAAATGAGc < 2:180485‑M1/123‑1 (MQ=255) gaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCGGAAATGAGCATTTAACtt > 1:1363605‑M1/5‑136 (MQ=255) gaggGAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCGGAAATGAGCATTTAACtt > 1:769487‑M1/5‑136 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAAAAATTAAAAGTCGTGCTCTCAGAATTTAATCCTGAAAGCACGACTTTTAATTTAACGCGTGTTCAATTATCGGACCACATAGACGTGGTCGTGAATCAGGTCGAATGGTCGGAAATGAGCATTTAACTTGG > TrimmedAssembly_T66_contig_18/1‑134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |