| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_4 | 245808 = | 117 (0.570) | 113 (0.690) +AACCTAAGGAATCGTTAATTCG |
33/218 | 1.9 | 69.9% | intergenic (‑7/–) | rasttk_feature_creation_tool=tRNAscan‑SE/– | tRNA‑Asn‑GTT/– |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_6 | = 156776 | 0 (0.000) | intergenic (‑82/–) | rasttk_feature_creation_tool=tRNAscan‑SE/– | tRNA‑Thr‑GGT/– | |||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑AAGCTTCTTGGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < TrimmedAssembly_T66_contig_4/245870‑245808‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGTCGGCAG < TrimmedAssembly_T66_contig_6/156776‑156642 |||||||||||||||||||||| agttAAGCTTCTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTA < 1:2432926/131‑1agttAAGCTTCTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTA < 1:452048/131‑1 ttAAGCTTCTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAAC > 1:575267/3‑136 ttAAGCTTCTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAAC > 1:1747089/3‑136 CTTCTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCT > 2:337432/1‑136 TTCTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTT < 1:1895466/136‑1 TTCTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTT < 1:2349620/136‑1 TTCTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTT < 1:2117723/136‑1 TTCTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTT < 1:2060594/136‑1 TTCTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTT < 2:1985539/136‑1 TTCTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTT < 2:2170841/136‑1 TTCTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTT < 1:1866218/136‑1 TTCTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTT < 2:2198743/136‑1 TTCTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTT > 2:1382827/1‑136 TTCTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTT < 1:1294590/136‑1 TTCTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTT < 2:2467763/136‑1 CTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTT > 2:2183349/1‑136 CTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTT > 2:2183367/1‑136 CTTAGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTT < 2:1083324/136‑1 ttaGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTG < 1:494914/133‑1 taGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGG > 2:822602/3‑136 aGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGTGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGT < 2:1921337/135‑1 aGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGT > 2:2291687/2‑136 aGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGT < 2:1849651/135‑1 aGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGT < 2:333507/135‑1 aGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGT < 2:669864/135‑1 aGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGT < 1:2013207/135‑1 aGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGT < 1:200930/135‑1 aGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGT < 1:1881484/135‑1 aGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGATGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGT < 2:691427/135‑1 aGCGCCGAGAGTAGTGGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGT < 1:815254/135‑1 GCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTA > 1:2484771/1‑136 GCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTA > 2:2509062/1‑136 CGAGAGTAGTTTGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACT < 2:875393/136‑1 CGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACT < 2:1032179/136‑1 CGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACT < 1:1040549/136‑1 CGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACT < 2:1955908/136‑1 GAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTG < 2:1988960/136‑1 GTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATA > 1:79107/1‑136 GTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGC > 2:1872801/1‑119 GATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATT < 2:2421592/135‑1 TCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAAC > 2:1063328/1‑136 TCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAAC > 1:631499/1‑136 TCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCG < 2:294500/136‑1 CCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGT > 2:1578625/1‑136 TGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTT < 1:2198627/136‑1 GCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACAGGCTTGTGGTATACTGGAGAGGGTCAATTAACGCCGTTTTA > 2:2344473/1‑136 GAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGC < 2:788493/136‑1 GAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTGTA > 2:1169822/1‑134 GAGGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCCTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGTATTTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACAAGCGTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGC < 2:2416589/136‑1 GGGTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCT < 2:1392348/135‑1 GTAGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACACGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTC < 1:546187/134‑1 AGGACGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACTGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGC < 2:2526912/135‑1 CGTTGCCATGCAACCTAAGGACTCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTA < 1:741609/136‑1 CGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTA < 1:567979/136‑1 CGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTA < 1:1843550/136‑1 CGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTA < 1:2046033/136‑1 CGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTA < 1:2183349/136‑1 CGTTGCCATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTA < 1:296570/136‑1 CATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAATCATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGC > 2:529206/1‑134 CATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATCGGGTCAATTAACGCCGTTGTAGCTCAGCAGGTAGTGC > 1:45398/1‑134 CATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGC > 2:2206906/1‑134 CATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGC > 2:247079/1‑134 CATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGC > 1:1987569/1‑134 CATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGC > 2:654492/1‑134 CATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGC > 1:336745/1‑134 CATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGC > 2:529154/1‑134 CATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGC > 2:468536/1‑134 CATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGC > 2:1464306/1‑134 CATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTGTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGC > 1:1661754/1‑134 CATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTGTTTACGTTGACTGTCAACCAGTACAGGTTGAATTTCAACATGCTTTTGGTATACTGGTTAGGGTCAATTAACGCCGTGTTAGCTCAGCAGGTAGAGC > 2:735760/1‑134 ATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTTGCTCAGCAGGTAGAGCACT > 1:1056469/1‑136 ATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACT > 1:1172927/1‑136 ATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACT > 1:2346569/1‑136 ATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACT > 2:1140564/1‑136 ATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGAGAGGGTCGATTAACGCCGTGTTAGCGCAGCAGGTCGAGCACT > 2:360986/1‑136 ATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTA > 1:922799/1‑40 ATGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTA < 2:922799/40‑1 TGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTT < 1:468536/136‑1 TGCAACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTT < 2:2392224/136‑1 AACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCg > 1:1297367/1‑135 AACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCA < 1:850385/136‑1 ACCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCAT < 1:337432/136‑1 CCTAAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTAC < 1:219318/35‑1 AAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTA < 1:1698483/136‑1 AAGGAATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAAGTTAAACATGCTTTTGGTCTACTGGATAGGGTCACTTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCAGGGTc > 2:1933350/1‑135 tgcATCCTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGCATGTAAACCATTACAGTTTGAAATTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCAATTCCATGGTAAG < 2:1773361/133‑1 AATCGTTAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAG < 1:2238722/134‑1 gAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGT < 2:2353524/135‑1 TAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGT < 2:1638409/136‑1 TAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGT < 2:1747075/136‑1 TAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGT < 2:1747089/136‑1 TAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGT < 2:2469999/136‑1 TAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGT < 1:1382827/136‑1 TAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATT < 1:2123025/86‑1 TAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATT > 2:2123025/1‑86 TAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGT < 2:2026014/67‑1 TAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGT > 2:2339482/1‑67 TAATTCGGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTAGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGT < 2:2469971/136‑1 GGTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGTCGGCAG > 2:2132257/1‑136 |||||||||||||||||||||| ‑‑‑‑AAGCTTCTTGGCGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCTCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < TrimmedAssembly_T66_contig_4/245870‑245808‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTCCTTTTTTTTACGTTGAATGTCAACCAGTACAGTTTGAATTTAAACATGCTTTTGGTATACTGGATAGGGTCAATTAACGCCGTTTTAGCTCAGCAGGTAGAGCACTTCCATGGTAAGGAAGAGGTCGGCAG < TrimmedAssembly_T66_contig_6/156776‑156642 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |