New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_21 | = 29409 | 0 (0.000) | 117 (0.500) | 44/262 | 1.0 | 100% | intergenic (‑1/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– |
? | TrimmedAssembly_T66_contig_37 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+9) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Mobile element protein |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TATTTTCTGCATCATTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_21/29276‑29409 | tATTTTCTGCATCATTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTag < 1:1555207‑M1/136‑3 (MQ=255) tATTTTCTGCATCATTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTag < 1:1512811‑M1/136‑3 (MQ=255) tATTTTCTGCATCATTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTag < 2:72573‑M1/136‑3 (MQ=255) aTTTTCTGCATCATTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTata > 2:2480205‑M1/1‑133 (MQ=255) ttttCTGCATCATTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTaga > 1:1353716‑M1/1‑132 (MQ=255) atcatTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgttt < 1:762166‑M1/135‑12 (MQ=255) atcatTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgttt < 2:1554759‑M1/135‑12 (MQ=255) atcatTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgttt < 2:2374892‑M1/135‑12 (MQ=255) ttgatTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTATTCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagatcctgtttaaaatctctt < 2:200248‑M1/134‑22 (MQ=255) tGGATTTTTAATTTTTACATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCGTCTTTAACCATTTCACTCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctctt < 1:607252‑M1/136‑22 (MQ=255) tGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctctt < 2:951786‑M1/136‑22 (MQ=255) tttaatttttaaATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagca > 2:841250‑M1/1‑109 (MQ=255) ttaaATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTATTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatacta < 2:2447173‑M1/136‑36 (MQ=255) tATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑‑TTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaat > 1:2063651‑M1/1‑88 (MQ=255) aTCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaat < 1:1393726‑M1/136‑49 (MQ=255) aTCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaat < 1:1691448‑M1/136‑49 (MQ=255) aTCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaat < 2:1908941‑M1/136‑49 (MQ=255) aaaGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttg > 1:1349272‑M1/1‑79 (MQ=255) aaaGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttg > 2:93519‑M1/1‑79 (MQ=255) aaGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttga < 2:1876919‑M1/136‑59 (MQ=255) attctTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac < 2:379011‑M1/134‑60 (MQ=255) aGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac < 1:171268‑M1/136‑60 (MQ=255) aGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac < 1:1996924‑M1/136‑60 (MQ=255) aGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac < 2:2436071‑M1/136‑60 (MQ=255) aGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac < 2:608244‑M1/136‑60 (MQ=255) aGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac < 2:1437868‑M1/136‑60 (MQ=255) aGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac < 2:2080797‑M1/136‑60 (MQ=255) aGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac < 1:2365245‑M1/136‑60 (MQ=255) aGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATATCTTCTTTAACCATTTCTATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac < 1:51811‑M1/136‑60 (MQ=255) aGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAAAATCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac < 1:2085568‑M1/136‑60 (MQ=255) aGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCACTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac < 1:1236257‑M1/136‑60 (MQ=255) cTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTATTCTCGTCTTTAACCCTGTCAATCTCTAATTGGGTC‑TTTTTTTGTagaacctggttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaacatgacaatttgacg > 2:726228‑M1/1‑74 (MQ=255) cTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTCTTTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac < 1:956952‑M1/134‑60 (MQ=255) cTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacga < 1:841250‑M1/135‑62 (MQ=255) cTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgattaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac < 1:1160811‑M1/133‑60 (MQ=255) tGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTACAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactag < 2:2222342‑M1/136‑66 (MQ=255) gAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagt < 1:176395‑M1/136‑67 (MQ=255) tttGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccattttacgactagtgttaagtt > 1:859552‑M1/1‑62 (MQ=255) tttGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagtt > 1:268527‑M1/1‑62 (MQ=255) tttGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagtt > 1:425706‑M1/1‑62 (MQ=255) tttGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagtt > 2:1979980‑M1/1‑62 (MQ=255) tttGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagtt > 2:552131‑M1/1‑62 (MQ=255) tttGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagtt > 2:965107‑M1/1‑62 (MQ=255) tttGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatacta > 1:360127‑M1/1‑62 (MQ=255) tttGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatacta < 2:360127‑M1/97‑36 (MQ=255) tttGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaaactgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaattt > 2:965126‑M1/1‑62 (MQ=255) tttGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTag > 1:96888‑M1/1‑62 (MQ=255) tttGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATATCTAATTGGTTA‑TTTTTTTTTagaacatgtttaaaatatatttagcatcaatactaaaaaagctaaaatgaccattttacgactagttttaagtt > 2:2068438‑M1/1‑62 (MQ=255) gTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacg < 2:2231020‑M1/135‑79 (MQ=255) ttCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTag > 2:1843857‑M1/1‑56 (MQ=255) ttCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTag < 1:1843857‑M1/58‑3 (MQ=255) ttACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaa > 1:1366788‑M1/1‑51 (MQ=255) tACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccagttgacgactagtgttaagttgacgttcacaat > 2:137972‑M1/1‑50 (MQ=255) aaTCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaattttt < 2:1067953‑M1/136‑91 (MQ=255) tctcTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttcc < 1:2222972‑M1/136‑93 (MQ=255) tctcTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttcc < 1:1691226‑M1/136‑93 (MQ=255) ttcttTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagag > 1:312633‑M1/1‑40 (MQ=255) ttcttTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagag > 2:1526535‑M1/1‑40 (MQ=255) ttcttTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagag > 2:672994‑M1/1‑40 (MQ=255) tcttTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatacttaaaaagctaaaatgaccttttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagaga < 2:1350536‑M1/136‑98 (MQ=255) tcttTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagaga < 1:1526535‑M1/136‑98 (MQ=255) tcttTAACCAGTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagaga < 2:1350525‑M1/136‑98 (MQ=255) cttTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagac < 2:483627‑M1/136‑99 (MQ=255) cttTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagac > 1:2301912‑M1/1‑38 (MQ=255) cttTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagac > 2:1829250‑M1/1‑38 (MQ=255) cttTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagagttaagttgacgttcacaatttttccagagac > 2:1512497‑M1/1‑38 (MQ=255) ttAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagaagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgactttaacaatttttccagagacg > 1:505761‑M1/1‑36 (MQ=255) ccATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgac > 2:351807‑M1/1‑32 (MQ=255) ccATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgac > 1:2346127‑M1/1‑32 (MQ=255) ccATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgac > 2:2028291‑M1/1‑32 (MQ=255) aTTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcatcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacat > 1:1800502‑M1/1‑30 (MQ=255) aTTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacat > 2:1785795‑M1/1‑30 (MQ=255) aTTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacat > 1:1800521‑M1/1‑30 (MQ=255) tttCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatt > 2:1169594‑M1/1‑29 (MQ=255) aaTCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccattttacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacattta > 1:1069281‑M1/1‑25 (MQ=255) aaTCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacattta > 1:2413286‑M1/1‑25 (MQ=255) aaTCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacattta > 1:1285803‑M1/1‑25 (MQ=255) aaTCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacattta > 2:1101328‑M1/1‑25 (MQ=255) aaTCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacattta > 1:2122380‑M1/1‑25 (MQ=255) aaTCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacattta > 2:2099544‑M1/1‑25 (MQ=255) aaTCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacattta > 2:1726702‑M1/1‑25 (MQ=255) aaTCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac > 1:1220827‑M1/1‑25 (MQ=255) aaTCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac > 1:1220833‑M1/1‑25 (MQ=255) aaTCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac < 2:1220827‑M1/84‑60 (MQ=255) aaTCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac < 2:1220833‑M1/84‑60 (MQ=255) aaTCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccaattgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttata > 2:295404‑M1/1‑25 (MQ=255) aTCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatct < 2:1698805‑M1/136‑113 (MQ=255) aTCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatct < 1:1460496‑M1/136‑113 (MQ=255) tctcTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatcta < 1:1586464‑M1/136‑114 (MQ=255) tctcTAATTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatcta < 1:552131‑M1/136‑114 (MQ=255) aaTTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac < 2:1438908‑M1/77‑60 (MQ=255) aaTTGGTTC‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgac > 1:1438908‑M1/1‑18 (MQ=255) c‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatctaaccaactgaaaga < 2:209352‑M1/136‑127 (MQ=255) c‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatctaaccaactgaaaga < 1:2093739‑M1/136‑127 (MQ=255) c‑TTTTTTTTTagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatctaaccaactgaaaga < 1:2480205‑M1/136‑127 (MQ=255) tttttttttagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatctaaccaactgaaaga > 2:1836347‑M1/1‑9 (MQ=255) ttttttttagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatctaaccaactgaaagatc > 2:266664‑M1/1‑8 (MQ=255) ttttttttagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatctaaccaactgaaagatc > 2:1497980‑M1/1‑8 (MQ=255) tttttttagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatctaaccaactgaaagatcg < 2:1336043‑M1/136‑130 (MQ=255) tttttagaacctgtttaaaatctcttgagcagcaatactaaaaaagctaaaatgaccatttgacgactagtgttaagttgacgttcacaatttttccagagacggcgacatttatctaaccaactgaaagatcgtt < 1:495652‑M1/136‑132 (MQ=255) | TATTTTCTGCATCATTCATTGGATTTTTAATTTTTAAATCTGAATTATCTTTAACAAAGTCTTTGAGTTTATTTTGGGTTCTCTTACTAATCTCTTCTTTAACCATTTCAATCTCTAATTGGTTC‑TTTTTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_21/29276‑29409 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |