| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_21 | = 29409 | 0 (0.000) | 117 (0.500) | 44/262 | 1.0 | 100% | intergenic (‑1/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_37 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+9) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Mobile element protein | |||||
Only 100 of 322 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATCGTTCAATA > TrimmedAssembly_T66_contig_37/1‑136 | tcattaagccttcgaagttcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaatttccccccctcgatttcagcatgtagtccaaattctgaaaacgtcggagcggacactagcacctggtcgttggtggctaa < 2:132869‑M1/1‑1 (MQ=255)tcattaagccttcgaagttcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaa < 2:1608809‑M1/1‑1 (MQ=255)tcattaagccttcgaagttcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaa < 2:2243866‑M1/1‑1 (MQ=255) tattttctgcatcattcattggatttttaatttttaaatctgaattatctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAg < 1:1512811‑M2/2‑1 (MQ=255) tattttctgcatcattcattggatttttaatttttaaatctgaattatctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAg < 1:1555207‑M2/2‑1 (MQ=255) cattaagccttcgaagttcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAg > 1:224903‑M1/135‑136 (MQ=255) cattaagccttcgaagttcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAg > 2:1170048‑M1/135‑136 (MQ=255) attttctgcatcattcattggatttttaatttttaaatctgaattatctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGa < 1:336296‑M2/3‑1 (MQ=255) attaagccttcgaagttcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGa < 2:1247241‑M1/3‑1 (MQ=255) taagccttcgaagttcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGaa < 1:80291‑M1/4‑1 (MQ=255) ttcgaagttcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGttt > 2:802878‑M1/126‑136 (MQ=255) atcattcattggatttttaatttttaaatctgaattatctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGttt < 2:1554759‑M2/11‑1 (MQ=255) agttcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAg > 1:1174472‑M1/121‑122 (MQ=255) agttcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacatggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTaaaa < 1:1008829‑M1/15‑1 (MQ=255) attggatttttaatttttaaatctgaattatctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAAtctc < 1:1335170‑M2/19‑1 (MQ=255) tggatttttaatttttacatctgaattatctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcgtctttaaccatttcactctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCtt < 1:607252‑M2/21‑1 (MQ=255) ggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAAt < 2:864321‑M1/31‑1 (MQ=255) caacgttggcacactgattaatggccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACt > 2:1461403‑M1/102‑135 (MQ=255) ttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTaaaaaa < 1:1122680‑M1/40‑1 (MQ=255) ttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTaaaaaa < 1:747156‑M1/40‑1 (MQ=255) ttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTaaaaaa < 2:1966216‑M1/40‑1 (MQ=255) tggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgtttgtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTaaaaaa < 1:1665919‑M1/40‑1 (MQ=255) atctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAAt < 2:1908941‑M2/48‑1 (MQ=255) ttaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGAcc < 2:2264671‑M1/52‑1 (MQ=255) taattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCa < 1:284887‑M1/53‑1 (MQ=255) ttgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCAttt > 1:1462103‑M1/81‑136 (MQ=255) aaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTg > 2:93519‑M2/80‑136 (MQ=255) aaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTg > 1:2323892‑M2/80‑136 (MQ=255) aaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccaattcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTg > 2:2469156‑M2/80‑136 (MQ=255) attctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac < 2:379011‑M2/59‑1 (MQ=255) agtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac < 1:1996924‑M2/59‑1 (MQ=255) agtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac < 1:2365245‑M2/59‑1 (MQ=255) agtctttgagtttattttgggttctcttactaaaatcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac < 1:2085568‑M2/59‑1 (MQ=255) agtctttgagtttattttgggttcacttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac < 1:1236257‑M2/59‑1 (MQ=255) agtctttgagattattttgggttctcttaataatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCCTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac < 2:1065601‑M2/59‑1 (MQ=255) cccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac > 1:21843‑M1/77‑135 (MQ=255) cccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac > 1:983814‑M1/77‑135 (MQ=255) cccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac > 1:1377771‑M1/77‑135 (MQ=255) cccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac > 1:655570‑M1/77‑135 (MQ=255) cccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac > 1:1608809‑M1/77‑135 (MQ=255) cccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac > 1:2429003‑M1/77‑135 (MQ=255) ctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttcttttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac < 1:956952‑M2/59‑1 (MQ=255) cccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgacg < 2:2132797‑M1/60‑1 (MQ=255) cctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctcAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTa < 2:1081824‑M1/64‑1 (MQ=255) cctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac < 2:1211958‑M1/59‑1 (MQ=255) cctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCGTGAGCAGCCATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTa < 1:1925553‑M1/64‑1 (MQ=255) cagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGt > 2:2219670‑M1/64‑136 (MQ=255) tttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGtt > 2:552131‑M2/63‑136 (MQ=255) tttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGtt > 1:268527‑M2/63‑136 (MQ=255) tttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAAACTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAttt > 2:965126‑M2/63‑136 (MQ=255) tttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatatctaattggttatttttttttAGAACATGTTTAAAATATATTTAGCATCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTTACGACTAGTTTTAAGtt > 2:2068438‑M2/63‑136 (MQ=255) ttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAg > 2:1843857‑M2/57‑58 (MQ=255) tactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCAGTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAAt > 2:137972‑M2/51‑136 (MQ=255) attctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTCTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAAAGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAAttt < 2:2346131‑M1/88‑1 (MQ=255) ctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAAttttt < 1:1818425‑M1/90‑1 (MQ=255) ctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAAttttt < 2:393697‑M1/90‑1 (MQ=255) gaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCa < 2:1501492‑M1/93‑1 (MQ=255) gaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCa < 1:431674‑M1/93‑1 (MQ=255) aacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCagag < 2:2448821‑M1/96‑1 (MQ=255) tctttaaccagttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAgaga < 2:1350525‑M2/97‑1 (MQ=255) acgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAgaga > 1:2219138‑M1/40‑136 (MQ=255) acgaccgtgcgcacactagcacctggtccttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCAAgaga > 2:1994676‑M1/40‑136 (MQ=255) ctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGAc < 2:483627‑M2/98‑1 (MQ=255) cgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGAc > 2:1587052‑M1/39‑136 (MQ=255) ccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGAc > 2:351807‑M2/33‑136 (MQ=255) atttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCATCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACAt > 1:1800502‑M2/31‑136 (MQ=255) ggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAAAACTAAAAAAGCAAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGGTGACGTTCACAATTTTTACAGAGAAGGCGACAtt < 1:46565‑M1/107‑1 (MQ=255) acactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTa < 2:706713‑M1/109‑1 (MQ=255) aatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTa > 2:1726702‑M2/26‑134 (MQ=255) aatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTa > 1:1700375‑M2/26‑134 (MQ=255) aatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTa > 2:1101328‑M2/26‑134 (MQ=255) aatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTa > 1:2122380‑M2/26‑134 (MQ=255) ctagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCt > 1:1595059‑M1/25‑136 (MQ=255) tctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTa < 1:552131‑M2/113‑1 (MQ=255) tagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTa > 2:63689‑M1/24‑136 (MQ=255) tagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTa > 1:399835‑M1/24‑136 (MQ=255) aattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac < 2:1438908‑M2/59‑1 (MQ=255) aattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac > 1:1438908‑M2/19‑77 (MQ=255) ggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTg > 2:730403‑M1/16‑136 (MQ=255) cgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAATTGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGaaa < 1:1097652‑M1/124‑1 (MQ=255) cgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACAtt < 1:858312‑M1/107‑1 (MQ=255) cgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGaaa < 1:1251309‑M1/124‑1 (MQ=255) cgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGaaa < 1:1088057‑M1/124‑1 (MQ=255) cgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGaaa < 1:1689517‑M1/124‑1 (MQ=255) cgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGaaa < 1:892319‑M1/124‑1 (MQ=255) cgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGaaa < 1:1890217‑M1/124‑1 (MQ=255) cgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGaaa < 2:1825570‑M1/124‑1 (MQ=255) cgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACGAGTGTTAAGTTGTCGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGaaa < 2:1674902‑M1/124‑1 (MQ=255) ctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGa < 2:209352‑M2/126‑1 (MQ=255) ctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGa < 1:2480205‑M2/126‑1 (MQ=255) tggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGa > 1:2054578‑M1/10‑135 (MQ=255) tggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGa > 2:1890217‑M1/10‑135 (MQ=255) tggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGa > 1:815327‑M1/10‑135 (MQ=255) ttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATc > 2:266664‑M2/9‑136 (MQ=255) ggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATCGtt > 2:210479‑M1/6‑136 (MQ=255) ggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATCGtt > 2:1054147‑M1/6‑136 (MQ=255) aAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATAGTTCAAt < 2:239340‑M1/135‑1 (MQ=255) aGAACCTGTTTAAAATCTCTTGATCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATCGTTCaata < 1:2390739/136‑1 (MQ=255) aGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAACTGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATCGTTCaata < 2:2381592/136‑1 (MQ=255) aGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATCGTTCaata > 1:1360703/1‑136 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATCGTTCAATA > TrimmedAssembly_T66_contig_37/1‑136 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |