| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_10 | = 98898 | 0 (0.000) | 84 (0.360) | 32/262 | 2.6 | 55.1% | intergenic (+59/–) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc/– | hypothetical protein/– |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_2 | = 81 | 137 (0.470) | coding (80/180 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=elepa@bvbrc | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 335 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTATTTTTTGGATCATCATTTATTTATATTTATCAAAGTAACGGTCTGTTATTTTAACGAATGTACTAAATTATTTTCGTTTCTGGTTACAAGACGCTAAAAGTATTTGATTTTACATGATATCGCTTTTTTTA > TrimmedAssembly_T66_contig_2/1‑215 | gttaaacattatgaaactggtcacggtagggaccaactttaaaaatcaaaggCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCtcttcg < 1:1313403‑M1/84‑3 (MQ=255) ttaaacattatgaaattggtcacggtagggaccaactttaaaaatcaaaggCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCAGTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCacagcctcgtctt < 1:944978‑M1/85‑6 (MQ=255) ttaaacattatgaaattggtcacggtagggaccaactttaaaaatcaaagaCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTAtt < 1:997265‑M1/85‑1 (MQ=255) ttaaacattatgaaattggtcacggtagggaccaactttaaaaatcaaagaCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTAtt < 1:19564‑M1/85‑1 (MQ=255) ttaaacattatgaaactggtcacggtagggaccaactttaaaaatcaaaggCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTGGTTATGTCACAGCctcttttc < 1:2386411‑M1/85‑4 (MQ=255) ttaaacattatgaaactggtcacggtagggaccaactttaaaaatcaaaggCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCacagcctcgcctt < 1:354715‑M1/85‑6 (MQ=255) ttaaacattatgaaactggtcacggtagggaccaactttaaaaatcaaaggCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCacagcctcgcctt < 2:21540‑M1/85‑6 (MQ=255) ttaaacattatgaaactggtcacggtagggaccaactttaaaaatcaaaggCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCacagcctcgcctt < 2:1869975‑M1/85‑6 (MQ=255) ttaaacattatgaaactggtcacggtagggaccaactttaaaaatcaaaggCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCacagcctcatttt < 1:2327034‑M1/85‑6 (MQ=255) ttaaacattatgaaactggtcacggtagggaccaactttaaaaatcaaaggCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCacagcctcatttt < 2:2295843‑M1/85‑6 (MQ=255) ttaaacattatgaaactggtcacggtagggaccaactttaaaaatcaaaggCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCacagcctcatttt < 2:2232099‑M1/85‑6 (MQ=255) ttaaacattatgaaactggtcacggtagggaccaactttaaaaatcaaaggCGTAAGCAAAGGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTCGGTTATACAGAGGCTCGTTATGTCacagcctcatttt < 2:1221275‑M1/85‑6 (MQ=255) ttaaacattatgaaactggtcacgggagggaccaactttaaaaatcaaaggCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAACATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCctcttttc < 2:2444965‑M1/85‑4 (MQ=255) aacattatgaaattggtcacggtagggaccaactttaaaaatcaaagaCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTAttttt < 2:484437‑M1/88‑1 (MQ=255) cattatgaaattggtcacggtagggaccaactttaaaaatcaaaggCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCtccttttttgaa < 1:364351‑M1/90‑4 (MQ=255) cattatgaaattggtcacggtagggaccaactttaaaaatcaaagaCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTATTTTTTg < 2:1566017‑M1/90‑1 (MQ=255) cattatgaaactggtcacggtagggaccaactttaaaaatcaaaggCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGGTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCtcattttttatg < 1:1038040‑M1/90‑4 (MQ=255) ttatgaaattggtcacggtagggaccaactttaaaaatcaaaggCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGcctccttttttgaagt > 2:364351‑M1/45‑131 (MQ=255) tgaaactggtcacggtagggaccaactttaaaaatcaaaggCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCATTTTttatggccgt < 2:1426133‑M1/95‑5 (MQ=255) gaaattggtcacggtagggaccaactttaaaaatcaaagaCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTATTTTTTGGatca < 1:477549‑M1/95‑1 (MQ=255) gaaactggtcacggtagggaccaactttaaaaatcaaaggCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCATTTtttatggccgtg < 2:1987486‑M1/96‑6 (MQ=255) gaaactggtcacggtagggaccaactttaaaaatcaaaggCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCAGTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCATTTtttatggccgtg < 2:713029‑M1/96‑6 (MQ=255) 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tttaaaaatcaaaggCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGcctccttttttgaagt < 2:1031480‑M1/92‑6 (MQ=255) tttaaaaatcaaagaCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACATAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTATTTTTTGGATCATCATTTCTTTATATTTATCAAAGTa < 1:420790‑M1/120‑1 (MQ=255) tttaaaaatcaaagaCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTATTTTTTGGATCATCATTTATTTATATTTATCAAAGTa < 1:2101004‑M1/120‑1 (MQ=255) tttaaaaatcaaagaCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTATTTTTTGGATCATCATTTATTTATATTTATCAAAGTa < 1:50883‑M1/120‑1 (MQ=255) tttaaaaatcaaagaCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTATTTTTTGGATCATCATGTATTTATATTTATCAAAGTa < 1:1004173‑M1/120‑1 (MQ=255) tttaaaaatcaaagaCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGGCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTATTTTTTGGATCATCATTTATTTATATTTATCAAAGTa < 1:1727377‑M1/120‑1 (MQ=255) taaaaatcaaagaCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAACATTCGGTTTCTCGTCCCATGTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTATTTTTTGGATCATCATGTATTTATATTTATCAAAGTAACg < 2:2047932‑M1/123‑1 (MQ=255) aaaatcaaagaCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTATTTTTTGGATCATCATTTATTTATATTTATCAAAGTAACGGt > 1:2026462‑M1/12‑136 (MQ=255) caaaggcgtaagcAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCgcctttagcttattggactaagcgaaccttgactggcacgattagttctt > 1:567258‑M2/7‑86 (MQ=255) aaggcgtaaGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCgcctttagcttattggactaagcgaaccttgactggcacgattagttctttg > 2:957178‑M2/5‑84 (MQ=255) aagaCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTATTTTTTGGATCATCATTTATTTATATTTATCAAAGTAACGGTCTGTTAt < 1:1971659/133‑1 (MQ=255) gTAAGCAAATGGGACGAGAAACCTAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCgcctttagcttattggactaagcgaaccttgactggcacgattagttctttgttatt > 2:1366274‑M2/1‑79 (MQ=255) 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCTTATTTTTTGGATCATCATTTATTTATATTTATCAAAGTAACGGTCTGTTATTTTAACGAATGTACTAAATTATTTTCGTTTCTGGTTACAAGACGCTAAAAGTATTTGATTTTACATGATATCGCTTTTTTTA > TrimmedAssembly_T66_contig_2/1‑215 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |