New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Only 100 of 373 total aligned reads displayed.
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tAATTTCGTAGAGTATCGGGTGCGACCGATGCTCTTTTTTT‑ATTTTCTATTATATCAAAAACAGGTCTGGAAAAATCCGAAGATTTTTCCAGACCTGTTTTGTTTCTAGAGACTTATGTCACAGCCTCTtgttttt > 1:1445366‑M2/1‑129 (MQ=255) tAATTTCGTAGAGTATCGGGTGCGACCGATGC‑TCTTTTTTTATTTTCTATTATATCAAAAACAGGTCTGGAAAAATCCGAAGATTTTTCCAGACCTGTTTTGTTTCTAGAGACTTATGTCACAGCCTCttttttg < 2:33590/135‑6 (MQ=25) aaTTTCGTAGAGTATCGGGTGCGACCGATGCTTTTTTTTTTATTTTCGATTATATCAAAAGCAGGTCTGGAAAAATCCGAAGATTTTTCAAGACCTGCTTTGTTTCTAGAGACGTATGTCACAGCAGCTTCGTAtt > 1:315867/1‑136 (MQ=38) cGTAGAGTATCGGGAGCGACCGATGCTCTTTTATTC‑TTTTCTCTTATATCAAAAACAGGTCTGGAAAAATCCGAAGATTTTTCCAGACCTGTTTTGTTTCTAGAGACTTATGTCACAGCCTCTtgtttttgatgtc > 2:963963‑M2/1‑123 (MQ=255) tAGAGTATCGGGTGCGACCGATGCTCTTTTTTT‑ATTTTCTATTATATCAAAAACAGGTCTGGAAAAATCCGAAGATTTTTCCAGACCTGTTTTGTTTCTAGAGACTTATGTCACAGCCTCTtgtttttgatgtcta < 1:349551‑M2/136‑16 (MQ=255) agagTATCGGGTGCGACCGATGCTTTTTTTTTTATTTTCTATTATATCAAAAGCAGGTCTGGAAAAATCCGAAGATTTTTCCAGACCTGCTTTGTTTCTAGAGACTTATGTCACAGCCTCTTCGTATTTAACAACt < 1:1365915/136‑1 (MQ=255) agagTATCGGGTGCGACCGATGCTTTTTTTTTTATTTTCTATTATATCAAAAGCAGGTCTGGAAAAATCCGAAGATTTTTCCAGACCTGCTTTGTTTCTAGAGACTTATGTCACAGCCTCTTCGTATTTAACAACt < 1:2278992/136‑1 (MQ=255) agTATCGGGTGCGACCGATGCTCTTTTTTT‑ATTTTCTATTATATCAAAAACAGGTCTGGAAAAATCCGAAGATTTTTCCAGACCTGTTTTGTTTCTAGAGACTTATGTCACAGCCTCTtgtgtttgatgtctatta < 2:670367‑M2/136‑19 (MQ=255) cGGGTGCGACCGATGCTTTTTTTTTTATTTTCTATTATATCAAATGCAGGTCTTGAAAAATCCTAAGATTTTTCCAGACCTGCTTTATTTCTAGAGACTTATGTCACAGCCTCTTCGTATTTAACAACTGCATTGc > 2:432893/1‑136 (MQ=255) cGGGTGCGACCGATGCTTTTTTTTTTATTTTCTATTATATCAAAAGCAGGTCTGGAAAAATCCGAAGATTTTTCCAGACCTGCTTTGTTTCTAGAGACTTATGTCACAGCCTCTTCGTATTTAACAACTGCATTGc > 1:415451/1‑136 (MQ=255) cGGGTGCGACCGATGCTCTTTTTTT‑ATTTTCTATTATATCAAAAACAGGTCTGGAAAAATCCGAAGATTTTTCCAGACCTGTTTTGTTTCTAGAGACTTATGTCACAGCCTCTtgtttttgatgtctattaaaatg < 2:1351670‑M2/136‑24 (MQ=255) gCGACCGATGCTCTTTTTTT‑ATTTTCTATTATATCAAAAACAGGTCTGGAAAAATCCGAAGATTTTTCCAGACCTGTTTTGTTTCTAGAGACTTATGTCACAGCCTCTtgtttttgatgtctattaaaatggaccc > 1:1724407‑M2/1‑108 (MQ=255) 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atatCAAAAGCAGGTCTGGAAAAATCCGAAGATTTTTCCAGACCTGCTTTGTTTCTAGAGACTTATGTCACAGCCTCTTCGTATTTAACAACTGCATTGCAATTGCTAGTTGACCTTGCATCAATCAACTATGGTg < 2:1139699/136‑1 (MQ=255) cAAAAGCAGGTCTGGAAAAATCCGAAGATTTTTCCAGACCTGCTTTGTTTCTAGAGACTTATGTCACAGCCTCTTCGTATTTAACAACTGCATTGCAATTGCTAGTTGACCTTGCATCAATCAACTATGGTGAcgc < 1:2241742/136‑1 (MQ=255) acaGGTCTGGAAAAATCCGAAGATTTTTCCAGACCTGTTTTGTTTCTAGAGACTTATGTCACCGCCTCTtgtttttgatgtctattaaaatggaccctaccggatttgaaccgacgacctcctgcatgcgaagcag < 1:1875591‑M2/135‑68 (MQ=255) acaGGTCTGGAAAAATCCGAAGATTTTTCCAGACCTGTTTTGTTTCTAGAGACTTATGTCACAGCCTCTtgtttttgatgtctattaaaatggaccctaccggatttgaaccgacgacctcctgcatgcgaagcag < 2:2243081‑M2/135‑68 (MQ=255) tCTGGAAAAATCCGAAGATTTTTCCAGACCTGTTTTGTTTCTAGAGACTTATGTCACAGCCTCTtgtttttgatgtctattaaaatggaccctaccggatttgaaacgacgacctcctgcatgcgaagcaggcgc > 2:2495250‑M2/1‑64 (MQ=255) cTGGAAAAATCCGAAGTTTTTTCCAGACCTGTTTTGTTTCTGGAGACTTATGTCACAGCCTCTtggtgttgatgtctctttaaatggacgctacgggatttgaaccgacgacctcctgcatgcgaagcaggcgg < 2:2130650‑M2/134‑72 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |