| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_36 | = 864 | 0 (0.000) | intergenic (+2/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Transposase/– | |||||
Only 100 of 671 total aligned reads displayed.
AATCGATAAATTGCTAAATCTACTCCAGATAACTTATCGATATCCTTATAGCCAAAGAATGCCACGGTTAGCCACCACCCTATCTAATAATCTATTCACTAGATTACCATAAATGCGTAACCGCTTCTAAAAAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < TrimmedAssembly_T66_contig_15/135‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCCGCTTCAGAGACTTCTCGTTATAAACATTAAACTGAGAAACCAGGAAGCGATCCAGTGAATCTTCCGTTGGAAATTGTTCT < TrimmedAssembly_T66_contig_36/864‑730 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ATCGATAAATTGCTAAATCTACTCCAGATAACTTATCGATATCCTTATAGCCAAAGAATGCCACGGTTAGCCACCACCCTATCTAATAATCTATTCACTAGATTACCATAAATGCGTAACCGCTTCTAAAAAACGG > 2:1824669/1‑136 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AACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCCGCTTCAGAGACTTCTCGTTATAAACATTAAACTGAGAAACCAGGAAGCGATCCAGTGAATCTTCCGTTGGAAATTGT < 1:2786478/136‑1 AACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCCGCTTCAGAGACTTCTCGTTATAAACATTAAACTGAGAAACCAGGAAGCGA > 2:1020216/1‑109 AACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCCGCTTCAGAGACTTCTCGTTATAAACATTAAACTGAGAAACC < 1:858718/100‑1 AACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTAGAACCCTCCGTGGTTCCGGTTCAGAGACTTCTCGTGTTAAACATTAAAATGAGATACCTGGATGAGATCCAGTGAATCTTCCGTTGGAAATTGT < 2:344884/136‑1 ACTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCCGCTTCAGAGACTTCTCGTTATAAACATTAAACTGAGAAACCAGGAAGCGATCCAGTGAATCTTCCGTTGGAAATTGT > 1:2247683/1‑135 CTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCCGCTTCAGAGACTTCTCGTTATAAACATTAAACTGAGAAACCAGGAAGCGATCCAGTGAATCTTCCGTTGGAAATTGTTC < 2:1171568/136‑1 CTTAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCCGCTTCAGAGACTTCTCGTTATAAACATTAAACTGAGAAACCAGGAAGCGATCCAGTGAATCTTCCGTTGGAAATTGT > 1:648873/1‑134 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| AATCGATAAATTGCTAAATCTACTCCAGATAACTTATCGATATCCTTATAGCCAAAGAATGCCACGGTTAGCCACCACCCTATCTAATAATCTATTCACTAGATTACCATAAATGCGTAACCGCTTCTAAAAAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < TrimmedAssembly_T66_contig_15/135‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAAATAAATGATGCTTCCAAGGTGTCCTGGAGTCCTTTGAACCCTCGGTGGATCCGCTTCAGAGACTTCTCGTTATAAACATTAAACTGAGAAACCAGGAAGCGATCCAGTGAATCTTCCGTTGGAAATTGTTCT < TrimmedAssembly_T66_contig_36/864‑730 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |