| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_37 | 1 = | 0 (0.000) | 225 (0.790) | 68/260 | 0.3 | 100% | intergenic (–/+9) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Mobile element protein |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_8 | = 137664 | 0 (0.000) | intergenic (‑2/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Histidinol‑phosphate aminotransferase (EC 2.6.1.9)/– | |||||
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
ATTGAACGATCTTTCAGTTGGTTAGATAAATGTCGCCGTCTCTGGAAAAATTGTGAACGTCAACTTAACACTAGTCGTCAAATGGTCATTTTAGCTTTTTTAGTATTGCTGCTCAAGAGATTTTAAACAGGTTCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < TrimmedAssembly_T66_contig_37/135‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAGCCACCAACGACCAGGTGCTAGTGTCCGCACCGACGTTTTCAGAATATGGACTACATGCTGAAATCGAGGGGGGGCAATTAATCAGTGTGCCAACGTTGCCTAATGACCATGTGAACTTCGAAGGCTTAATGA < TrimmedAssembly_T66_contig_8/137664‑137530 AACGATCTTTCAGTTGGTTAGATAAATGTCGCCGTCTCTGGAAAAATTGTGAACGTCAACTTAACACTAGTCGTCAAATGGTCATTTTAGCTTTTTTAGTATTGCTGCTCAAGAGATTTTAAACAGGTTCTTAGCC > 2:2310774/1‑136 AACGATCTTTCAGTTGGTTAGATAAATGTCGCCGTCTCTGGAAAAATTGTGAACGTCAACTTAACACTAGTCGTCAAATGGTCATTTTAGCTTTTTTAGTATTGCTGCTCAAGAGATTTTAAACAGGTTCTTAGCC > 1:745825/1‑136 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ATTGAACGATCTTTCAGTTGGTTAGATAAATGTCGCCGTCTCTGGAAAAATTGTGAACGTCAACTTAACACTAGTCGTCAAATGGTCATTTTAGCTTTTTTAGTATTGCTGCTCAAGAGATTTTAAACAGGTTCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < TrimmedAssembly_T66_contig_37/135‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAGCCACCAACGACCAGGTGCTAGTGTCCGCACCGACGTTTTCAGAATATGGACTACATGCTGAAATCGAGGGGGGGCAATTAATCAGTGTGCCAACGTTGCCTAATGACCATGTGAACTTCGAAGGCTTAATGA < TrimmedAssembly_T66_contig_8/137664‑137530 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |