| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | TrimmedAssembly_T66_contig_37 | 1 = | 0 (0.000) | 225 (0.790) | 68/260 | 0.3 | 100% | intergenic (–/+9) | –/rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | –/Mobile element protein |
| ? | TrimmedAssembly_T66_contig_8 | = 137664 | 0 (0.000) | intergenic (‑2/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | Histidinol‑phosphate aminotransferase (EC 2.6.1.9)/– | |||||
Only 100 of 401 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATCGTTCAATA > TrimmedAssembly_T66_contig_37/1‑136 | tcattaagccttcgaagttcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagctcctggtcgttggtggctaa < 2:1442297‑M1/1‑1 (MQ=255)tcattaagccttcgaagttcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaa < 2:1486712‑M1/1‑1 (MQ=255) tattttctgcatcattcattggatttttaatttttaaatctgaattatctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAg < 2:1859993‑M2/2‑1 (MQ=255) tattttctgcatcattcattggatttttaatttttaaatctgaattatctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAg < 1:2206906‑M2/2‑1 (MQ=255) tattttctgcatcattcattggatttttaatttttaaatctgaattatctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAg < 1:1390853‑M2/2‑1 (MQ=255) tattttctgcatcattcattggatttttaatttttaaatctgaattatctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAg < 2:2517324‑M2/2‑1 (MQ=255) cattaatccttagaatttctcttgttcattaggaaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAg > 2:1689346‑M1/135‑136 (MQ=255) cattaagccttcgaagttcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAg > 2:440222‑M1/135‑136 (MQ=255) attttctgcatcattcattggatttttaatttttatatctgaattatctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGa > 2:2479556‑M2/134‑136 (MQ=255) attttctgcatcattcattggatttttaatttttaaatctgaattatctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcgtactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGa > 1:2397288‑M2/134‑136 (MQ=255) attttctgcatcattcattggatttttaatttttaaatctgaattatctttaacaaagtatttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGa < 1:2711093‑M2/3‑1 (MQ=255) cttcgaagttcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGtt < 1:1762562‑M1/10‑1 (MQ=255) tcattcattggatttttaatttttaaatctgaattatctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTaa < 1:2343774‑M2/13‑1 (MQ=255) aagttcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTaaaa < 1:118701‑M1/15‑1 (MQ=255) agttcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTaaaa < 2:2704241‑M1/15‑1 (MQ=255) agttcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTaaaa < 1:2633185‑M1/15‑1 (MQ=255) tcacatggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAAtctc > 2:553205‑M1/118‑136 (MQ=255) attggatttttaatttttaaatctgaattatctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatatctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAAtctc < 2:1230997‑M2/19‑1 (MQ=255) ggatttttaatttttaaatctgaattatctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTg > 1:2151800‑M2/115‑136 (MQ=255) atggtcattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGa < 1:704814‑M1/23‑1 (MQ=255) atttttaatttttaaatctgaattatctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGa > 2:2053380‑M2/113‑135 (MQ=255) atttttaatttttaaatctgaattatctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGa > 2:469170‑M2/113‑135 (MQ=255) cattaggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGagcagc < 2:417783‑M1/28‑1 (MQ=255) taggcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggggcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAAt < 2:2157933‑M1/31‑1 (MQ=255) gcaacgttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACt < 2:116136‑M1/34‑1 (MQ=255) ttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTaaaaaa < 2:2430899‑M1/40‑1 (MQ=255) ttggcacactgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTaaaaaa < 2:2609419‑M1/40‑1 (MQ=255) ctgattaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAAt > 2:1390210‑M1/89‑136 (MQ=255) atctttaacaaagtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAAt < 2:1823547‑M2/48‑1 (MQ=255) attaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGa < 2:1995468‑M1/50‑1 (MQ=255) ttaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCtt < 2:266274‑M1/21‑1 (MQ=255) ttaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCtt > 1:2568454‑M1/85‑105 (MQ=255) ttaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGAcc < 1:1226159‑M1/52‑1 (MQ=255) ttaattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACGAAAAAAGCTAAAATGAcc < 2:699621‑M1/52‑1 (MQ=255) taattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactatcacctggtcgtttgtggctaAGAACCAGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAACAAAAAATGACCa < 1:771726‑M1/53‑1 (MQ=255) taattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCa < 1:427780‑M1/53‑1 (MQ=255) aattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCAt < 1:2444094‑M1/54‑1 (MQ=255) aattgccccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCAt < 1:995531‑M1/54‑1 (MQ=255) attacttttagtttatttggggttcactaacaaatctctacttaaaccatttcaatcactaattggtaatttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTga < 2:1586536‑M2/58‑1 (MQ=255) agtctttgagtttattttgggttctcttacttatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac < 1:1068307‑M2/59‑1 (MQ=255) agtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac < 1:1914400‑M2/59‑1 (MQ=255) agtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac < 1:282233‑M2/59‑1 (MQ=255) agtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac < 1:1108893‑M2/59‑1 (MQ=255) agtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac < 1:2187645‑M2/59‑1 (MQ=255) agtctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaacatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac < 2:1080729‑M2/59‑1 (MQ=255) cccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac > 1:536833‑M1/77‑135 (MQ=255) cccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac > 1:611888‑M1/77‑135 (MQ=255) cccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac > 1:307786‑M1/77‑135 (MQ=255) cccccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac > 2:1740355‑M1/77‑135 (MQ=255) ctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAg > 2:1916296‑M2/75‑76 (MQ=255) ctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATTACCATTTgacg > 2:1299593‑M2/75‑134 (MQ=255) ctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgacg > 1:1629894‑M2/75‑134 (MQ=255) ctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgacg > 1:2672640‑M2/75‑134 (MQ=255) ctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac < 2:1780963‑M2/59‑1 (MQ=255) ctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgac > 1:1780963‑M2/75‑133 (MQ=255) ctttgagtttattttgggttctcttactaatctcttctttaaccatttcaatctctaattggttctttttttttAGAACATGTTTAAAATCTATTGAGAAGCAATACTAAAAATGCTAAAATGACCATTtgacgaa > 2:2260935‑M2/75‑135 (MQ=255) cccctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTgacg < 1:687735‑M1/60‑1 (MQ=255) cctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCACTACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTa < 2:1225486‑M1/64‑1 (MQ=255) cctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATTAACATTTGACGACTa < 2:761086‑M1/64‑1 (MQ=255) cctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTa < 1:2033014‑M1/64‑1 (MQ=255) cctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTa < 1:1281561‑M1/64‑1 (MQ=255) cctcgatttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTa > 2:815210‑M1/73‑136 (MQ=255) atttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGtt < 2:2501535‑M1/69‑1 (MQ=255) atttcagcatgtagtccatattctgaaaacgtcggtgcggacactagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGtt < 1:1563857‑M1/69‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTa > 1:1002679‑M1/24‑136 (MQ=255) tagcacctggtcgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTa > 1:2750403‑M1/24‑136 (MQ=255) tctaattggttctttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAAc < 1:229742‑M2/115‑1 (MQ=255) cgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTa > 1:2506019‑M1/13‑125 (MQ=255) cgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGaaa > 1:1486712‑M1/13‑136 (MQ=255) cgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGaaa < 1:196631‑M1/124‑1 (MQ=255) cgttggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGaaa < 1:4000‑M1/124‑1 (MQ=255) ttttttttAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATc < 2:663326‑M2/128‑1 (MQ=255) ggtggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATc > 2:2033014‑M1/9‑136 (MQ=255) ggctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATCGtt > 2:1544852‑M1/6‑136 (MQ=255) gctaAGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGa > 2:219663‑M1/5‑130 (MQ=255) aAGAACCTGGTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAAACAACTGAAAGATCGTTCAAt < 2:788779‑M1/135‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGAACCTGTTTAAAATCTCTTGAGCAGCAATACTAAAAAAGCTAAAATGACCATTTGACGACTAGTGTTAAGTTGACGTTCACAATTTTTCCAGAGACGGCGACATTTATCTAACCAACTGAAAGATCGTTCAATA > TrimmedAssembly_T66_contig_37/1‑136 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |