| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
ATTGGTACTTACCGAAGTATTGACCGTTACGAGCAGAATATGAACCACCAGATTCTTTACCAGCAATCCAAGCCTTAGCAGCACTATCAGAACCATTGTTGCTATAGTTTGATGTTGAACTAGACGTTTGAGTCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_39/529‑663 | aTTGGTACTTACCGAAGTATTGACCGTTACGAGCAGAATATGAACCACCAGATTCTTTACCAGCAATCCAAGCCTTAGCAGCACTATCAGAACCATTGTTGCTATAGTTTGATGTTGAACTAGACGTTTGAGTCa > 2:896475/1‑135 (MQ=33)aTTGGTACTTACCGAAGTATTGACCGTTACGAGCAGAATATGAACCACCAGATTCTTTACCAGCAATCCAAGCCTTAGCAGCACTATCAGAACCATTGTTGCTATAGTTTGATGTTGAACTAGACGTTTGAGTCa > 2:482291/1‑135 (MQ=33)aTTGGTACTTACCGAAGTATTGACCGTTACGAGCAGAATATGAACCACCAGATTCTTTACCAGCAATCCAAGCCTTAGCAGCACTATCAGAACCATTGTTGCTATAGTTTGATGTTGAACTAGACGTTTGAGTCa > 2:1507734/1‑135 (MQ=33)aTTGGTACTTACCGAAGTATTGACCGTTACGAGCAGAATATGAACCACCAGATTCTTTACCAGCAATCCAAGCCTTAGCAGCACTATCAGAACCATTGTTGCTATAGTTTGATGTTGAACTAGACGTTTGAGTCa > 2:1558915/1‑135 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1:2002213‑M2/136‑132 (MQ=255) gTCAtcgtctgagcagcaggtttgctagtttgtgtttgacttgattgggtctggctagcttggctcggttgagcttgagtttgactagtctgagctgatgattgtgtcgtggtcgtttgttgagtcgtctgtgtt > 1:1829263‑M2/1‑4 (MQ=255) | ATTGGTACTTACCGAAGTATTGACCGTTACGAGCAGAATATGAACCACCAGATTCTTTACCAGCAATCCAAGCCTTAGCAGCACTATCAGAACCATTGTTGCTATAGTTTGATGTTGAACTAGACGTTTGAGTCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > TrimmedAssembly_T66_contig_39/529‑663 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |