| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Annotation_U21_Trimmed_contig_9 | 1 = | 0 (0.000) | 1111 (0.800) | 120/260 | 1.0 | 100% | coding (1/936 nt) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Plasmid replication initiation protein |
| ? | Annotation_U21_Trimmed_contig_9 | = 10661 | NA (NA) | intergenic (+719/–) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2/– | ORF9/– | |||||
Only 100 of 1120 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGTGATAAGGGAGATCAGACAGTTAGATT > Annotation_U21_Trimmed_contig_9/1‑134 | gttttgtctgtttatcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGa > 1:923189‑M1/131‑134 (MQ=255) ttttgtctgtttatcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGc < 1:1319755‑M1/6‑1 (MQ=255) tttgtctgtttatcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGc > 1:419587‑M1/129‑134 (MQ=255) gtctgtttatcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATg > 1:314381‑M1/126‑135 (MQ=255) tttatcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACtt > 1:2412582‑M1/121‑135 (MQ=255) tttatcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACtt > 1:2318706‑M1/121‑135 (MQ=255) attaacaacgcgcttttgtctgcttaaccacgaggttttgtctgtttctcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACtt > 1:765278‑M1/121‑135 (MQ=255) atcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTtata < 1:1273397‑M1/18‑1 (MQ=255) atcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTtata < 2:53652‑M1/18‑1 (MQ=255) caacgaggttttgtctgtttatcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATaaa > 1:704295‑M1/116‑135 (MQ=255) caacgaggttttgtctgtttatcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATaaa > 1:1960902‑M1/116‑135 (MQ=255) ttttgtctgtttatcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGa < 2:1216199‑M1/26‑1 (MQ=255) ttttgtctgtttatcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGa < 1:524611‑M1/26‑1 (MQ=255) ttttgtctgtttatcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGa < 1:354955‑M1/26‑1 (MQ=255) ttttgtctgtttatcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGa < 2:2278473‑M1/26‑1 (MQ=255) ttttgtctgtttatcaacgagggtttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAaaatatta < 2:1358743‑M1/26‑3 (MQ=255) tttgtctgtttatcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGAt > 1:1890042‑M1/107‑133 (MQ=255) tttgtctgtttatcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGAt > 2:2566007‑M1/107‑133 (MQ=255) tttgtctgtttatcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATc > 2:1874999‑M1/107‑134 (MQ=255) tttgtctgtttatcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATc > 2:1610338‑M1/107‑134 (MQ=255) gtctgtttatcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGa > 1:2580476‑M1/104‑135 (MQ=255) tgtttatcaacgtggttttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACt > 2:1521435‑M1/101‑135 (MQ=255) atcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGAt < 1:15096‑M1/27‑1 (MQ=255) atcaacgaggttttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAAt < 1:1603487‑M1/39‑1 (MQ=255) acgaggttttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCAt > 2:2002142‑M1/92‑135 (MQ=255) gaggttttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATGCTGAACTTAATACCATTc > 2:1797918‑M1/90‑135 (MQ=255) ttttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGt < 1:998187‑M1/49‑1 (MQ=255) ttgtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTa > 2:2182338‑M1/84‑134 (MQ=255) gtctgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGt > 2:290242‑M1/82‑135 (MQ=255) tgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTaa > 1:1353862‑M1/79‑134 (MQ=255) tgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTaa > 2:2600186‑M1/79‑134 (MQ=255) tgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTaa > 1:1130069‑M1/79‑134 (MQ=255) tgtttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTaa > 2:1111897‑M1/79‑134 (MQ=255) tttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAAtt > 1:2670817‑M1/77‑135 (MQ=255) tttatcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAAtt > 1:1651179‑M1/77‑135 (MQ=255) atcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGAt > 2:1323707‑M1/74‑100 (MQ=255) tcaacgaggtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCAc < 2:2626741‑M1/62‑1 (MQ=255) gtttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTg > 1:1175569‑M1/65‑134 (MQ=255) tttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGaa < 1:1002617‑M1/72‑1 (MQ=255) tttttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGaa < 1:490198‑M1/72‑1 (MQ=255) ttaatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATg > 1:1848189‑M1/61‑135 (MQ=255) aatggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGa < 2:1546485‑M1/76‑1 (MQ=255) ggtgatcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCt > 1:2044951‑M1/56‑135 (MQ=255) atcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTAttt < 2:1665277‑M1/84‑1 (MQ=255) atcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTAtt > 2:2659022‑M1/52‑134 (MQ=255) tcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTAtttt < 2:2078262‑M1/85‑1 (MQ=255) tcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTAtttt < 1:1723242‑M1/85‑1 (MQ=255) tcgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCATGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTAtttt < 1:1932428‑M1/85‑1 (MQ=255) cgttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTAttttt > 2:1055705‑M1/50‑135 (MQ=255) gttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATaaa < 2:1938289‑M1/20‑1 (MQ=255) gttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGAt > 2:1410879‑M1/49‑75 (MQ=255) gttgataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTAtttttt > 2:1684303‑M1/49‑135 (MQ=255) gataaacaatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTc > 1:181494‑M1/46‑134 (MQ=255) aaacaatcgttgattttatataatacttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAatt > 2:799371‑M1/43‑135 (MQ=255) aaacaatcgttgattttatataagagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAatt > 1:2164553‑M1/43‑135 (MQ=255) aatcgttgattttatataatagttgttgaggtgtgattATGATCAATGAACTTATAAAATATGATCATGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTAttt > 2:926952‑M1/39‑135 (MQ=255) aatcgttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTAttt > 1:805198‑M1/39‑135 (MQ=255) ttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGt > 1:1485208‑M1/34‑135 (MQ=255) ttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGt < 1:2287204‑M1/102‑1 (MQ=255) ttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGt > 2:2249700‑M1/34‑135 (MQ=255) ttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGt > 1:2530758‑M1/34‑135 (MQ=255) ttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGt > 1:2608113‑M1/34‑135 (MQ=255) ttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGt > 1:2757152‑M1/34‑135 (MQ=255) ttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGt < 1:572520‑M1/102‑1 (MQ=255) ttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGt > 2:2735540‑M1/34‑135 (MQ=255) ttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGt > 1:1440406‑M1/34‑135 (MQ=255) ttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGt < 2:482728‑M1/102‑1 (MQ=255) ttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGt < 1:970007‑M1/102‑1 (MQ=255) ttgattttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGt > 2:1277558‑M1/34‑135 (MQ=255) attttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATg < 2:2462506‑M1/105‑1 (MQ=255) tttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCg > 2:868094‑M1/29‑135 (MQ=255) tttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCg < 2:1773622‑M1/107‑1 (MQ=255) ttatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGt < 2:562489‑M1/108‑1 (MQ=255) tatataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTCATACCAGTGCGTTACGTAAATTCACCACTATTGACATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGTg > 2:2138891‑M1/27‑135 (MQ=255) atataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCAtt < 2:384932‑M1/45‑1 (MQ=255) atataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCAtt > 1:384932‑M1/26‑70 (MQ=255) tataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGTGAt > 1:2458629‑M1/25‑135 (MQ=255) tataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGTGAt > 1:637561‑M1/25‑135 (MQ=255) ataatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGTGATa < 1:1556261‑M1/112‑1 (MQ=255) taatagttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGTGATaa > 1:871215‑M1/23‑135 (MQ=255) ttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGAt > 2:439657‑M1/17‑43 (MQ=255) ttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGTGATAAGGgag < 1:2114514‑M1/118‑1 (MQ=255) ttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGTGATAAGGgag < 2:2367667‑M1/118‑1 (MQ=255) ttgtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGTGATAAGGgag < 2:1475339‑M1/118‑1 (MQ=255) gtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGTGATAAGGGAGATc > 1:272071‑M1/15‑135 (MQ=255) gtggaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGTGATAAGGGAGATc > 2:1723242‑M1/15‑135 (MQ=255) gaggtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGTGATAAGGGAGATCAGa < 1:2497182‑M1/124‑1 (MQ=255) ggtctgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGTGATAAGGGAGATCAGAc > 2:2414103‑M1/10‑134 (MQ=255) gtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGTGATAAGGGAGATCAGACAg < 1:1793714‑M1/127‑1 (MQ=255) gtgtgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGTGATAAGGGAGATCAGACAg < 2:714982‑M1/127‑1 (MQ=255) tgattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGTGATAAGGGAGATCAGACAGTTa < 2:1162240‑M1/130‑1 (MQ=255) gattATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGTGATAAGGGAGATCAGACAGTTAg < 2:2307852‑M1/131‑1 (MQ=255) attATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGTGATAAGGGAGATCAGACAGTTAg > 1:1235302‑M1/4‑134 (MQ=255) attATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGTGATAAGGGAGATCAGACAGTTAGa < 2:356123‑M1/132‑1 (MQ=255) attATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGTGATAAGGGAGATCAGACAGTTAGa < 2:637346‑M1/132‑1 (MQ=255) attATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGTGATAAGGGAGATCAGACAGTTAGa < 1:2248729‑M1/132‑1 (MQ=255) ttATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGTGATAAGGGAGATCAGACAGTTAGAt < 1:45576‑M1/133‑1 (MQ=255) ttATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCATATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGTGATAAGGGAGATCAGACAGTTAGAt < 1:1409658‑M1/133‑1 (MQ=255) aTGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGTGATAAGGGAGATCAGACAGTTAGAtt > 2:2528034/1‑134 (MQ=255) aTGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGTGATAAGGGAGATCAGACAGTTAGAtt > 1:1049454/1‑134 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATGAGCAATGAACTTATAAAATATGATCCTGAACTTAATACCATTCCGTTACGTAAATTCACCCCTATTGAAATGAATCTATTTTTTTCAATTATTTCTCGTATGCGTGATAAGGGAGATCAGACAGTTAGATT > Annotation_U21_Trimmed_contig_9/1‑134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |