| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 713 total aligned reads displayed.
AAGTCGGCATTATCACTTATTAATGCCATATATTTACTTTTATGAAACATAGCACTAATTTGTGCTATGAGCCGTGACAGGCTCGAACTGTCGACCCTCTGATTAAAAGTCAGATGCTCTACCAACTGAGCTAACGGCTCAAAATATAATGGGGGATACAGGGCTCGAACCTGTGACCTCCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAACTGAGCTAATCCCCCATTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Annotation_U21_Trimmed_contig_12/778‑1004 | aGTCGGCATTATCACTTATTAATGCCATATATTTACTTTTATGAAACATAGCACTAATTTGTGCTATGAGCCGTGACAGGCTCGAACTGTCGACCCTCTGATTAAAAGTCAGATGCTCTACCAACTGAGCTAACg < 2:1498636/135‑1 (MQ=255) taacACTTATTAATGCCATATATTTACTTTTATGAAACATAGCACTAATTTGTGCTATGAGCCGTGACAGGCTCGAACTGTCGACCCTCTGATTAAAAGTCAGATGCTCTACCAACTGAGCTAACGGCTCAAAat < 2:182938/132‑1 (MQ=255) tATCACTTATTAATGCCTTATATTTCCTTTTATGAAACATAGCACTAATTTGTGCTATGAGCCGTGACAGGCTCGAACTGTCGACCCTCTGATTAAAAGACAGATGCTCTACCAACTGAGCTAACGGCTCAAAat < 1:2204287/135‑1 (MQ=255) tATCACTTATTAATGCCATATATTTACTTTTATGAAACATAGCACTAATTTGTGCTATGAGCCGTGACAGGCTCGAACTGTCGACCCTCTGATTAAAAGTCAGATGCTCTACCAACTGAGCTAACGGCTCAAAat < 2:1705836/135‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |