New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | Annotation_U21_Trimmed_contig_10 | 1 = | 0 (0.000) | 399 (0.310) | 91/256 | 0.2 | 100% | noncoding (117/117 nt) | rasttk_feature_creation_tool=RNA_reps_5S_rRNA | 5S rRNA # 5S ribosomal RNA ‑ 3 prime truncation |
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Only 100 of 399 total aligned reads displayed.
CGTAAGTTAGCACAGAGTGTGGTGACGATAGTGAGAAGGATATACCTGTTCCCATGTCGAACACAGAAGTCAAGCTTCTTAACGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCCCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Annotation_U21_Trimmed_contig_10/134‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAAATGGGGGATTAGCTCAGTTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGGAGGTCACAGGTTCGAGCCCTGTATCCCCCATTATATTTTGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGGGT < Annotation_U21_Trimmed_contig_12/1004‑871 CGTAAGTTAGCACAGAGTGTGGTGACGATAGTGAGAAGGATATACCTGTTCCCATGTCGAACACAGAAGTCAAGCTTCTTAACGCCGAGAGTAGTTGGGGGATCGCCCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCT < 1:1779258/135‑1 GTAAGTTAGCACAGAGTGTGGTGACGATTGTGAGAAGGATATACCTGTTCCCATGTCGAACACAGAAGTCAAGCTTCTTAACGCCTAGAGTAGTTGGGGGATCTCCCCCTGCGAGGGTAGGACGTTGCCATGCTA < 1:2535018/135‑1 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ATGCTAAATGGGGGATTAGCTCAGTTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGGAGGTCACAGGTTCGAGCCCTGTATCCCCCATTATATTTTGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGA < 1:175730/134‑1 ATGCTAAATGGGGGATTAGCTCAGTTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGGAGGTCACAGGTTCGAGCCCTGTATCCCCCATTATATTTTGAGACGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCATAG > 2:1592264/1‑135 TGCTAAATGGGGGATTAGCTCAGTTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGGAGGTCACAGGTTCGAGCCCTGTATCCCCCATTATATTTTGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGG < 2:1796672/135‑1 CTAAATGGTGGATTAGCTCAGTTGGGAGAGCATCTGCCTTACTAGCAGGAGTTCACAGGTTCGAGCCCTGTATCCCCCATTATATTTTGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGGGT < 1:1077534/135‑1 CTAAATGGGGGATTAGCTCAGTTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGGAGGTCACAGGTTCGAGCCCTGTATCCCCCATTATATTTTGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGGGT < 1:1551747/135‑1 CTAAATGGGGGATTAGCTCAGTTGGGAGAGCATCTGCCTTACAAGCAGGAGGTCACAGGTTCGAGCCCTGTATCCCCCATTATATTTTGAGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCATCTGACTTTTAATCAGAGGGT < 1:1502543/135‑1 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |