New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 1737987 = | 20 (0.890) | 4 (0.200) | 3/282 | 2.4 | 21.7% | coding (32/348 nt) | yffB | putative glutathione‑dependent thiol reductase |
? | AE015451 | = 1777401 | 11 (0.550) | intergenic (+135/+157) | PP_5476/PP_1585 | conserved protein of unknown function/putative Antidote protein |
TCATCGACGGCTGGGCCAGCATCAGCTCGACGGCCTTGGCCTGGTCGAGGTCTGCCTTGCTGGCGTCGTCCAGCTTGCGGAAGGTGGTGCCGGCACGGTTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAACGGTGACCCAGCAGTCGCTGTGCATCTCGACCTTCTTCGTCATGTAGCCTGGCCGCCAGGGACCGCTGCTCAT > AE015451/1737751‑1738222 | tcatcGACGGCTGGGCCAGCATCAGCTCGACGGCCTTGGCCTGGTCGAGGTCTGCCTTGCTGGCGTCGTCCAGCTTGCGGAAGGTGGTGCCGGCACGGTTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTcac < 1:322263/237‑1 (MQ=255) cGACGGCTGGGCCAGCATCAGCTCGACGGCCTTGGCCTGGTCGAGGTCTGCCTTGCTGGCGTCGTCCAGCTTGCGGAAGGTGGTGCCGGCACGGTTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAggg > 2:291694/1‑236 (MQ=255) gACGGCTGGGCCAGCATCAGCTCGACGGCCTTGGCCTGGTCGAGGTCTGCCTTGCTGGCGTCGTCCAGCTTGCGGAAGGTGGTGCCGGCACGGTTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCt < 1:329808/237‑1 (MQ=255) ggatctcgagttgtttcggtttgagaatttttcagatcaagatcacggacggatcttggtcggcagaacgcctgggaaggatatcgttgcgtaaatcttccccaaaatgcatccgtaaacacctgattctattggggtcgaaacgaacaaaaaaggcgcaattccgatgcgccatatttgctttaaggcattgatttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAGGCttt < 1:202688‑M1/8‑1 (MQ=255) 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1:65199‑M1/194‑199 (MQ=255) gAGGTCTGCCTTGCTGGCGTCGTCCAGCTTGCGGAAGGTGGTGCCGGCACGGTTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAgggg > 1:422271/1‑236 (MQ=255) ggacggatcttggtcggcagaacgcctgggaaggatatcgttgcgtaaatcttccccaaaatgcatccgtaaacacctgattctattggggtcgaaacgaacaaaaaaggcgcaattccgatgcgccatatttgctttaagtcattgatttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAgg > 2:308317‑M1/184‑187 (MQ=255) cgtaaatcttcccaaaaatgcatccgtaaacacctgattctattggggtcgaaacgaacaaaaaaggcgcaattccgatgcgccatatttgctttaaggcattgatttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAGGCttt > 1:159349‑M1/141‑148 (MQ=255) aaatcttccccaaaatgcatccgtaaacacctgattctattggggtcgaaacgaacaaaaaaggcgcaattccgatgcgccatatttgctttaaggcattgatttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAGGCTTTGATGCcgtcg < 2:89930‑M1/18‑3 (MQ=255) aaaatgcatccgtaaacacctgattctattggggtcgaaacgaacaaaaaaggcgcaattccgatgcgccatatttgctttaaggcattgatttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAGGCt > 2:191206‑M1/127‑132 (MQ=255) cccAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCt > 1:309687/1‑131 (MQ=255) cccAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCt < 2:309685/131‑1 (MQ=255) cccAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATg > 2:393813/1‑229 (MQ=255) atccgtaaacacctgattctattagggtcgaaacgaacaaaaaaggcgcaattccgatgcgccatatttgctttaaggcattgatttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAGGCTTTGATGcc > 2:54057‑M1/120‑133 (MQ=255) 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ggTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAACTTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCa > 1:366002/1‑207 (MQ=255) cgccatatttgctttaaggcattgatttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCAc > 2:49449‑M1/61‑188 (MQ=255) gCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATcc > 1:94028/1‑158 (MQ=255) gCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATcc < 2:94027/158‑1 (MQ=255) tntGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTg < 2:21162/173‑1 (MQ=255) ttGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAACGGTGACCCAGCAGTCGCTGTGCATCTCGACcttc < 1:291696/237‑1 (MQ=255) gTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCt < 2:216344/43‑1 (MQ=255) gTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATc < 2:179426/148‑1 (MQ=255) atttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAGGCTTTGATGCCGt > 2:238119‑M1/37‑52 (MQ=255) atttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAGGCTTTGATGCCGt < 1:238120‑M1/16‑1 (MQ=255) cAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCGCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAACGGTGACCCAGCAGTCGCTGTGCATCTCGACCTTCTTCGTCATGTAg < 1:397725/237‑1 (MQ=255) tACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAag > 1:216345/1‑43 (MQ=255) ttCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAACGGTGACCCAGCAGTCGCTGTGCATCTCGACCTTCTTCGTCATGTAGCCTGGCCGCCAGGGa < 1:328309/237‑1 (MQ=255) CAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCa < 1:176663‑M1/83‑1 (MQ=255) CAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAACGGTGACCCAGCAGTCGCTGTGCATCTCGACCTTCTTCGTCATGTAGCCTGGCCGCCAGGGACCGCTGCTCAt > 2:247283‑M1/1‑236 (MQ=255) | TCATCGACGGCTGGGCCAGCATCAGCTCGACGGCCTTGGCCTGGTCGAGGTCTGCCTTGCTGGCGTCGTCCAGCTTGCGGAAGGTGGTGCCGGCACGGTTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAACGGTGACCCAGCAGTCGCTGTGCATCTCGACCTTCTTCGTCATGTAGCCTGGCCGCCAGGGACCGCTGCTCAT > AE015451/1737751‑1738222 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |