New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 76184 = | 35 (0.700) | 4 (0.080) | 4/322 | NT | 8.8% | coding (26/1374 nt) | trkA | NAD‑binding component of TrK potassium transporter |
? | AE015451 | 76333 = | 50 (1.050) | coding (1211/1311 nt) | rsmB | Ribosomal RNA small subunit methyltransferase B |
GTCTCGTCACTGTTGGTTACCGCCACCAGCATGTCGGCGTCGTCGGCACCGGCCTGACGCAGTACCGTCGGCAGTGAGCCACGGCCCTGGACGGTGCGGATGTCCAGGCGGTCGCCGAGGTCGCGCAGGCGGTCGCCGTCGGTGTCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCTTGATCAGCTTGGCATAGTAGAAACCGTCGTGGCCGCCTTCCTGGGCCAGCAACTGACGGCCGTGGGGCTGGCGCAGGCCGGCTTCGGTCGCCAGGTCCAGCTCACGAGCGCCCGGGGTGCGCGCGAGGAAGGCTTTGATCACTTCAGTGTTCTCGGTCGG > AE015451/75977‑76415 | gTCTCGTCACTGTTGGTTACCGCCACCAGCATGTCGGCGTCGTCGGCACCGGCCTGACGCAGTACCGTCGGCAGTGAGCCACGGCCCTGGACGGTGCGGATGTCCAGGCGGTCGCCGAGGTCGCGCAGGCGGTCGCCGTCGGTGTCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATgcg > 1:379843/1‑236 (MQ=255) ccGCCACCAGCATGTCGGCGTCGTCGGCACCGGCCTGACGCAGTACCGTCGGCAGTGAGCCACGGCCCTGGACGGTGCGGATGTCCAGGCGGTCGCCGAGGTCGCGCAGGCGGTCGCCGTCGGTGTCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATgc < 1:136594/216‑1 (MQ=255) gCCACCAGCATGTCGGCGTCGTCGGCACCGGCCTGACGCAGTACCGTCGGCAGTGAGCCACGGCCCTGGACGGTGCGGATGTCCAGGCGGTCGCCGAGGTCGCGCAGGCGGTCGCCGTCGGTGTCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATc < 2:406599/207‑1 (MQ=255) ccaGCATGTCGGCGTCGTCGGCACCGGCCTGACGCAGTACCGTCGGCAGTGAGCCACGGCCCTGGACGGTGCGGATGTCCAGGCGGTCGCCGAGGTCGCGCAGGCGGTCGCCGTCGGTGTCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGgatgatgcgct > 2:442246/1‑200 (MQ=255) ggctttggccacgctgcaaggcgagctgctcgatgccctgtggccgaccctggaagtgggcggcatgctgctatacgccacctgctccacattgccgaccgagaacactgaagtgatcaaagccttcctcgcgcgcaccccgggcgctcgtgagctggacctggcgaccgaagccggCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCcg < 2:879270‑M1/56‑1 (MQ=255) tCGGCGTCGTCGGCACCGGCCTGACGCAGTACCGTCGGCAGTGAGCCACGGCCCTGGACGGTGCGGATGTCCAGGCGGTCGCCGAGGTCGCGCAGGCGGTCGCCGTCGGTGTCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAg > 1:481269/1‑236 (MQ=255) ttggccacgctgcaaggcgagctgctcgatgccctgtggccgaccctggaagtgggcggcatgctgctatacgccacctgctccacattgccgaccgagaacactgaagtgatcaaagccttcctcgcgcgcaccccgggcgctcgtgagctggacctggcgaccgaagccggCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAgg > 1:879273‑M1/174‑236 (MQ=255) gCCTGACGCAGTACCGTCGGCAGTGAGCCACGGCCCTGGACGGTGCGGATGTCCAGGCGGTCGCCGAGGTCGCGCAGGCGGTCGCCGTCGGTGTCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCTTGATCa < 1:545586/234‑1 (MQ=255) cTGACGCAGTACCGTCGGCAGTGAGCCACGGCCCTGGACGGTGCGGATGTCCAGGCGGTCGCCGAGGTCGCGCAGGCGGTCGCCGTCGGTGTCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCTTGATCAGCtt < 1:353741/236‑1 (MQ=255) gCAGGGGGCCACGGCCCGGGACGGTGCGGATGTCCAGGCGGTCGCCGAGGTCGCGCAGGCGGTCGCCGTCGGTGTCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATc < 2:130104/158‑1 (MQ=255) ggccgaccctggaagtgggcggcatgctgctatacgccacctgctccacattgccgaccgagaacactgaagtgatcaaagccttcctcgcgcgcaccccgggcgctcgtgagctggacctggcgaccgaagccggCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCtt < 2:814675‑M1/73‑1 (MQ=255) ggccgaccctggaagtgggcggcatgctgctatacgccacctgctccacattgccgaccgagaacactgaagtgatcaaagccttcctcgcgcgcaccccgggcgctcgtgagctggacctggcgaccgaagccggCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCtt > 1:814678‑M1/137‑209 (MQ=255) ccACGGCCCTGGACGGTGCGGATGTCCAGGCGGTCGCCGAGGTCGCGCAGGCGGTCGCCGTCGGTGTCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTc < 1:240622/164‑1 (MQ=255) ggATGTCCAGGCGGTCGCCGAGGTCGCGCAGGCGGTCGCCGTCGGTGTCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAgg < 1:742866/173‑1 (MQ=255) ggATGTCCAGGCGGTCGCCGAGGTCGCGCAGGCGGTCGCCGTCGGTGTCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAgg > 2:742863/1‑173 (MQ=255) ggATGTCCAGGCGGTCGCCGAGGTCGCGCAGGCGGTCGCCGTCGGTGTCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCTTGATCa > 2:836718/1‑188 (MQ=255) ggATGTCCAGGCGGTCGCCGAGGTCGCGCAGGCGGTCGCCGTCGGTGTCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCTTGATCAGCTTGGCATAGTAGAAACCGTCGTGgccgc > 1:187273/1‑218 (MQ=255) ggATGTCCAGGCGGTCGCCGAGGTCGCGCAGGCGGTCGCCGTCGGTGTCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCTTGATCAGCTTGGCATAGTAGAAACCGTCGTGGCCGCCTTCCt > 1:388910/1‑224 (MQ=255) ggATGTCCAGGCGGTCGCCGAGGTCGCGCAGGCGGTCGCCGTCGGTGTCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCTTGATCAGCTTGGCATAGTAGAAACCGTCGTGGCCGCCTTCCTGGGcc > 2:365652/1‑229 (MQ=255) ggATGTCCAGGCGGTCGCCGAGGTCGCGCAGGCGGTCGCCGTCGGTGTCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCTTGATCAGCTTGGCATAGTAGAAACCGTCGTGGCCGCCTTCCTGGGCCAg > 1:284464/1‑231 (MQ=255) ggATGTCCAGGCGGTCGCCGAGGTCGCGCAGGCGGTCGCCGTCGGTGTCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCTTGATCAGCTTGGCATAGTAGAAACCGTCGTGGCCGCCTTCCTGGGCCAGCAACt > 1:307738/1‑236 (MQ=255) ggATGTCCAGGCGGTCGCCGAGGTCGCGCAGGCGGTCGCCGTCGGTGTCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCTTGATCAGCTTGGCATAGTAGAAACCGTCGTGGCCGCCTTCCTGGGCCAGCAACt > 1:404977/1‑236 (MQ=255) gATGTCCAGGCGGTCGCCGCGGTCGCGCAGGCGGTCGCCGTCGGTGTCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCTTGATCAGCTTg < 1:216554/192‑1 (MQ=255) gCGGTCGCCGAGGTCGCGCAGGCGGTCGCCGTCGGTGTCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTAcctgccctg > 1:252528/1‑104 (MQ=255) gCGGTCGCCGAGGTCGCGCAGGCGGTCGCCGTCGGTGTCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTAcctgccctg < 2:252525/104‑1 (MQ=255) gCGGTCGCCGAGGTCGCGCAGGCGGTCGCCGTCGGTGTCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGGGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGGGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCcgc > 1:196433/1‑157 (MQ=255) aGGGGGTCGCCGTCGGTTTCTCCCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGATAGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTc < 2:871846/105‑1 (MQ=255) aGGCGGTCGCCGGCGGTGTCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCTTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCtt < 2:300327/154‑1 (MQ=255) gtgtCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCTTGATCAGCTTGGCATAGTAGAAACcgtcgt > 1:646828/1‑168 (MQ=255) tgtCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCtt > 2:868462/1‑138 (MQ=255) tgtCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCtt < 1:868465/138‑1 (MQ=255) aCCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTgcgc > 1:169835/1‑67 (MQ=255) aCCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTgcgc < 2:169834/67‑1 (MQ=255) tCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTCCCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCTTGATCAGCTTGGCATAGTAGAAACCGTCGTGGCCGCCTTCCTGGGCCAGCAACTGACGGCCGTGGGGCTGGCGCAGGCCGGc < 2:307735/202‑1 (MQ=255) gCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCTTGATCAGCTTGGCATAGTAGAAACCGTCGTGGCCGCCTTCCTGGGCCAGCAACTGACGGCCGTGGGGCTGGCGCAGGCCGGCTTCGGTCGCCAg < 1:300251/208‑1 (MQ=255) ttCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCTTGATCAGCTTGGCATAGTAGAAACCGTCGTGGCCGCCTTCCTGGGCCAGCAACTGACGGCCGTGGGGCTGGCGCAGGCCGGCTTCGGTCGCCAGGTCCAGCTCAc > 1:383692/1‑217 (MQ=255) cTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCTTGATCAGCTTGGCATAGTAGAAACCGTCGTGGCCGCCTTCCTGGGCCAGCAACTGACGGCCGTGGGGCTGGCGCAGGCCGGCTTCGGTCGCCAGGTCCAGCTCACGAGCGCCCGGGGTGCGCGCGAg > 1:834993/1‑235 (MQ=255) tGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCTTGATCAGCTTGGCATAGTAGAAACCGTCGTGGCCGCCTTCCTGGGCCAGCAACTGACGGCCGTGGGGCTGGCGCAGGCCGGCTTCGGTCGCCAGGTCCAGCTCACGAGCGCCCGGGGTGCGCGCGa < 2:404974/233‑1 (MQ=255) ttCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCTTGATCAGCTTGGCATAGTAGAAACCGTCGTGGCCGCCTTCCTGGGCCAGCAACTGACGGCCGTGGGGCTGGCGCAGGCCGGCt < 1:496995/180‑1 (MQ=255) tACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCTTGATCAGCTTGGCATAGTAGAAACCGTCGTGGCCGCCTTCCTGGGCCAGCAACTGACGGCCGTGGGGCTGGCGCAGGCCGGCTTCGGTCGCCAGGTCCAGCTCACGAGCGCCCGGGGTGCGCGCGAGGAAGGCTTTGATCACTTCAgtgt > 1:814999/1‑236 (MQ=255) tACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCTTGATCAGCTTGGCATAGTAGAAACCGTCGTGGCCGCCTTCCTGGGCCAGCAACTGACGGCCGTGGGGCTGGCGCAGGCCGGCTTCGGTCGCCAGGTCCAGCTCACGAGCGCCCGGGGTGCGCGCGAGGAAGGCTTTGATCACTTCAgtgt > 1:152336/1‑236 (MQ=255) tgccctgcGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCTTGATCAGCTTGGCATAGTAGAAACCGTCGTGGCCGCCTTCCTGGGCCAGCAACTGACGGCCGTgg > 2:417119/1‑140 (MQ=255) tgccctgcGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCTTGATCAGCTTGGCATAGTAGAAACCGTCGTGGCCGCCTTCCTGGGCCAGCAACTGACGGCCGTgg < 1:417122/140‑1 (MQ=255) tgccctgcGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCTTGATCAGCTTGGCATAGTAGAAACCGTCGTGGCCGCCTTCCTGGGCCAGCAACTGACGGCCGTGGGGCTGGCGCAGGCCGGCTTCGGTCGCCAGGTCCAGCTCACGAGCGCCCGGGGTGCGCGCGAGGAAGGCTTTGATCACTTCAGTGTTCtcggtcgg > 1:249289/1‑235 (MQ=255) | GTCTCGTCACTGTTGGTTACCGCCACCAGCATGTCGGCGTCGTCGGCACCGGCCTGACGCAGTACCGTCGGCAGTGAGCCACGGCCCTGGACGGTGCGGATGTCCAGGCGGTCGCCGAGGTCGCGCAGGCGGTCGCCGTCGGTGTCGACCACGGTAATGTCGTTGGCTTCGCTGGCCAGGTGTTCAGCCAGCGTACCGCCTACCTGCCCTGCGCCGAGGATGATGATCTTCATGCGCTACTCCCTATCCTTTGTTCTTATCCGCGCGAGGCGGCGATCTTGATCAGCTTGGCATAGTAGAAACCGTCGTGGCCGCCTTCCTGGGCCAGCAACTGACGGCCGTGGGGCTGGCGCAGGCCGGCTTCGGTCGCCAGGTCCAGCTCACGAGCGCCCGGGGTGCGCGCGAGGAAGGCTTTGATCACTTCAGTGTTCTCGGTCGG > AE015451/75977‑76415 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |