| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | AE015451 | = 1777401 | 68 (1.510) | intergenic (+135/+157) | PP_5476/PP_1585 | conserved protein of unknown function/putative Antidote protein | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
CGACGGCTGGGCCAGCATCAGCTCGACGGCCTTGGCCTGGTCGAGGTCTGCCTTGCTGGCGTCGTCCAGCTTGCGGAAGGTGGTGCCGGCACGGTTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAACGGTGACCCAGCAGTCGCTGTGCATCTCGACCTTCTTCGTCATGTAGCCTGGCCGCCAGGGACCGCTGCT > AE015451/1737755‑1738219 | ctgggatctcgagttgtttcggtttgagaatttttcagatcaagatcacggacggatcttggtcggcagaacgcctgggaaggatatcgttgcgtaaatcttccccaaaatgcatccgtaaacacctgattctattggggtcgaaacgaacaaaaaaggcgcaattccgatgcgccatatttgctttaaggcattgatttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAgg < 1:170867‑M1/4‑1 (MQ=255) gggatctcgagttgtttcggtttgagaatttttcagatcaagatcacggacggatcttggtcggcagaacgcctgggaaggatatcgttgcgtaaatcttccccaaaatgcatccgtaaacacctgattctattggggtcgaaacgaacaaaaaaggcgcaattccgatgcgccatatttgctttaaggcattgatttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAGGCt > 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1:588856/236‑1 (MQ=255) cgccatatttgctttaaggcattgatttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAGGCTTTGAt > 2:377014‑M1/61‑71 (MQ=255) cgccatatttgctttaaggcattgatttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAGGCTTTGAt < 1:377017‑M1/11‑1 (MQ=255) cgccatatttgctttaaggcattgatttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAGGCTTTGATGCCGt > 1:646150‑M1/61‑76 (MQ=255) gAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAACGGTGACCCAGCAGt > 1:418092/1‑236 (MQ=255) catattttctttaagtcattgatttaacttggctttagtcgatttaacttggcgtccCAGGCTTTGATTCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCa > 2:390919‑M1/58‑174 (MQ=255) 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CGACGGCTGGGCCAGCATCAGCTCGACGGCCTTGGCCTGGTCGAGGTCTGCCTTGCTGGCGTCGTCCAGCTTGCGGAAGGTGGTGCCGGCACGGTTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAACGGTGACCCAGCAGTCGCTGTGCATCTCGACCTTCTTCGTCATGTAGCCTGGCCGCCAGGGACCGCTGCT > AE015451/1737755‑1738219 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |