| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 1737987 = | 53 (1.060) | 32 (0.710) | 27/304 | NT | 35.6% | coding (32/348 nt) | yffB | putative glutathione‑dependent thiol reductase |
| ? | AE015451 | = 1777401 | 68 (1.510) | intergenic (+135/+157) | PP_5476/PP_1585 | conserved protein of unknown function/putative Antidote protein | |||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
CTGGGATCTCGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCGATGATCTCATCGCCGTGTTGCTGTTCGGCTGTGCGCAGATC > AE015451/1777170‑1777626 | gggATCTCGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggct < 1:498075‑M2/236‑7 (MQ=255) gggATCTCGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggct > 1:930743‑M2/1‑230 (MQ=255) ctcGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATATTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTcc < 1:383189/225‑1 (MQ=255) tgttTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgt > 2:528918‑M2/1‑218 (MQ=255) tttCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgat < 1:145051‑M2/227‑12 (MQ=255) tCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGCCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCg > 1:359954/1‑236 (MQ=255) aTTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcatt < 1:238495‑M2/236‑34 (MQ=255) aTTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAg > 1:538198/1‑230 (MQ=255) tttCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggct > 1:906410‑M2/1‑200 (MQ=255) tttCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggct > 2:22528‑M2/1‑200 (MQ=255) cAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGGTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatt < 1:730329‑M2/235‑39 (MQ=255) tcaCGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaag > 1:648372‑M2/1‑187 (MQ=255) caCGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGc > 1:599728/1‑236 (MQ=255) ggacggaTCTTGGTCGGCAGAACGCCGGGGAAGGATATCGTTGAGTAAATCTTCCCCAAAATGCAGCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCgtgt < 1:56559/208‑1 (MQ=255) gacggaTCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggctggga > 2:498072‑M2/1‑182 (MQ=255) gacggaTCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggct > 2:821425‑M2/1‑182 (MQ=255) cTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttcaaggggctgggattactcccc < 1:242963‑M2/236‑62 (MQ=255) tgggTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGGAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTagag < 2:60772/192‑1 (MQ=255) cGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtca < 2:373584‑M2/200‑32 (MQ=255) gAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTTGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggctgggattactccccaaaacctccc < 1:708‑M2/235‑72 (MQ=255) agcgcCTGGGAAGGATATCGTCGCGTAAATCTTCCACAAAATGTATCCGTAAACACCTGATGCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATAGTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaattt > 2:27191‑M2/3‑163 (MQ=255) aaCGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGttt > 1:757326/1‑236 (MQ=255) cGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAAtc < 2:912409/225‑1 (MQ=255) tCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCgtg > 2:810338/1‑170 (MQ=255) aaaTCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggctgggattactccccaaaacctccccaatat < 2:375282‑M2/214‑78 (MQ=255) aaaTCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgt < 1:395092‑M2/153‑17 (MQ=255) aaaTCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgt > 2:395089‑M2/1‑137 (MQ=255) aaaTCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCa < 2:296236/220‑1 (MQ=255) aaaTCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCa > 1:296239/1‑220 (MQ=255) aaaTCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCg > 1:533900/1‑236 (MQ=255) tCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTc < 2:816564/220‑1 (MQ=255) cgtCCCGAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCa < 2:813134/162‑1 (MQ=255) tCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGACATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggctgggattactccccaaaacctccccaatatctcccaaaaattag > 1:498163‑M2/1‑131 (MQ=255) cAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggctgggattactccccaaaacctccccaatatctcccaaaaattagtcgcaggattatgcgac < 1:52937‑M2/235‑109 (MQ=255) cAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCcaggctttgatgccgtaaagagtgtaagtcattgaatttaaaggggctgggattactccccaaaacctccccaatatctcccaaaaattagtcgcaggattatgcgac < 1:727387‑M2/235‑109 (MQ=255) cAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCgg > 2:127715/1‑217 (MQ=255) cAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATc > 2:127707/1‑235 (MQ=255) aaTGCATCCGTAAACACCTTATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCt < 1:841290/234‑1 (MQ=255) gCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGc < 2:795977/171‑1 (MQ=255) 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2:572307/1‑226 (MQ=255) | CTGGGATCTCGAGTTGTTTCGGTTTGAGAATTTTTCAGATCAAGATCACGGACGGATCTTGGTCGGCAGAACGCCTGGGAAGGATATCGTTGCGTAAATCTTCCCCAAAATGCATCCGTAAACACCTGATTCTATTGGGGTCGAAACGAACAAAAAAGGCGCAATTCCGATGCGCCATATTTGCTTTAAGGCATTGATTTAACTGGGCTTTAGTCGGTTTAACTTGGCGTCCCAGGCTTTGATGCCGTAGAGCGTGTAGGTCATTGTGTACATTGGGGTTGCAAGTAGCCCCAATCTCTCCGTTTTTCGATGTCAGTCGCGGGATTATGCGGGAACGATCCTCGCGGCGCCACGCCCGTGGCGCCCCTGTTTATTGATCAGGATGTGTTCAAGCGACCAGACGCTGGACCGACCCGATGATCTCATCGCCGTGTTGCTGTTCGGCTGTGCGCAGATC > AE015451/1777170‑1777626 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |