New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 1739440 | 90 (1.800) | 3 (0.070) | 3/310 | NT | 3.6% | intergenic (‑25/+9) | PP_1533/PP_1534 | putative Excisionase/conserved protein of unknown function |
? | AE015451 | = 1739426 | 78 (1.700) | intergenic (‑11/+23) | PP_1533/PP_1534 | putative Excisionase/conserved protein of unknown function | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
ATTCGATTAACAAGGGGACTGCCCACTGGAACGCGGGGCAGCGGCTCTGGCTCCCGGTAGCAGGCATCGGCCTCAACATAGTAGCTGCGACCGTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCGTATGCTCGCAGCTGTGCTGCAGCGTCGATCAGGTCTTCCAGCAGCAGAGGGGACGCCGCAATCAACTTTGCGTTTGCCATTTGATGCATTCCCCCATCT > AE015451/1739207‑1739656 | aTTCGATTAACAAGGGGACTGCCCACTGGAACGCGGGGCAGCGGCTCTGGCTCCCGGTAGCAGGCATCGGCCTCAACATAGTAGCTGCGACCGTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCcggcggcgg > 1:848392/1‑235 (MQ=255) gggACTGCCCACTGGAACGCGGGGCAGCGGCTCTGGCTCCCGGTAGCAGGCATCGGCCTCAACATAGTAGCTGCGACCGTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCaggag < 1:61038/235‑1 (MQ=255) ggACTGCCCACTGGAACGCGGGGCAGCGGCTCTGGCTCCCGGTAGCAGGCATCGGCCTCAACATAGTAGCTGCGACCGTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCagga < 2:732569/233‑1 (MQ=255) tGCCCACTGGAACGCGGGGCAGCGGCTCTGGCTCCCGGTAGCAGGCATCGGCCTCAACATAGTAGCTGCGACCGTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGcc > 1:640915/1‑236 (MQ=255) aCTGGAACGCGGGGCAGCGGCTCTGGCTCCCGGTAGCAGGCATCGGCCTCAACATAGTAGCTGCGACCGTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTAc > 1:403909/1‑236 (MQ=255) aaCGCGGGGCAGCGGCTCTGGCTCCCGGTAGCAGGCATCGGCCTCAACATAGTAGCTGCGACCGTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATgg > 1:818975/1‑236 (MQ=255) ggggCAGCGGCTCTGGCTCCCGGTAGCAGGCATCGGCCTCAACATAGTAGCTGCGACCGTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGt > 2:405931/1‑232 (MQ=255) cGGCTCTGGCTCCCGGTAGCAGGCATCGGCCTCAACATAGTAGCTGCGACCGTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAg < 1:388089/235‑1 (MQ=255) ccGGGAGCAGGCATCGGCCTCAACATGGTGGCTGCGACCGTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCagga < 2:7522/195‑1 (MQ=255) ggCATCGGCCTCAACATAGTAGCTGCGACCGTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGa > 1:556888/1‑236 (MQ=255) ccTCAACATAGTAGCTGCGACCGTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCGGGTTGGCGTTg > 2:496416/1‑227 (MQ=255) tCAACATAGTAGCTGCGACCGTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCtt > 1:664089/1‑236 (MQ=255) aaCATAGTAGCTGCGACCGTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGTGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCttt < 1:908595/235‑1 (MQ=255) agCTGCGACCGTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAgg > 1:793861/1‑206 (MQ=255) agCTGCGACCGTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAgg < 2:793858/206‑1 (MQ=255) cTGCGACCGTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGt < 1:805972/235‑1 (MQ=255) cGACCGTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCgg > 2:319490/1‑235 (MQ=255) cGACCGTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGa > 1:909520/1‑236 (MQ=255) aCCGTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCggcggcggcg < 2:65935/148‑2 (MQ=255) aCCGTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCggcggcggcg > 1:65935/1‑147 (MQ=255) aCCGTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGtgg > 1:815490‑M1/1‑145 (MQ=255) aCCGTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGc > 2:805969/1‑222 (MQ=255) aCCGTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAgg > 1:479130/1‑236 (MQ=255) gTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGaa < 2:840537/183‑1 (MQ=255) gTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGaa > 1:840540/1‑183 (MQ=255) gTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTGCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTGTACGa < 2:37244/170‑1 (MQ=255) gCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGCGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCcggcg > 2:265088/1‑153 (MQ=255) ttACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTg < 1:586901/236‑1 (MQ=255) ttACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTg < 1:614701/236‑1 (MQ=255) gaCCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGc < 2:741472/212‑1 (MQ=255) aCCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTg < 2:818972/234‑1 (MQ=255) cggggccggggTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGa < 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agacaggATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTg < 1:552874/220‑1 (MQ=255) ggggTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGACGGTCTGCTCg > 1:548078/1‑165 (MQ=255) ggggTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGAGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGtt > 1:98274/1‑188 (MQ=255) ggggTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGGGATCGTGCGCCCATTCGTCGTGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCCCGCCCCAggcggcggc > 2:77846/1‑128 (MQ=255) gggTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCa < 1:125177/234‑1 (MQ=255) tCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCg < 1:405934/236‑1 (MQ=255) aGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCg < 1:853967/234‑1 (MQ=255) 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cAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAgcgc > 2:372805/1‑147 (MQ=255) ggCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCtt < 1:253332/172‑1 (MQ=255) agTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCttt > 1:448574/1‑166 (MQ=255) agTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCttt < 2:448571/166‑1 (MQ=255) agTGTTGCTGCTGGGCGGCGCTCTGAGCTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGTTGGTCTGCTCGAAGCACGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTTCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCGTATGCTCGCAGCTGTGCTGCAGCGt < 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tCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCGTATGCTCGCAGCTGTGCTGCAGCGTCGATCAGGTCTTCCAGCAGCagag > 1:904504/1‑236 (MQ=255) aaGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGTGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGt < 2:848389/172‑1 (MQ=255) tGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTg < 2:739338/162‑1 (MQ=255) tCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCGTATGCTCGCAGCTGTGCTGCAGCGTCGATCAGGTCTTCCAGCAGCAGAGGGGAcgcc > 2:807771/1‑234 (MQ=255) cGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTGCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCGTATGCTCGCAGCTGTGCTGCAGCGTCGATCAGGTCTTcc < 1:291083/215‑1 (MQ=255) gTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGTTGCAGGGTCTCGTATGCTCGCAGCTGtgctgc > 1:281601/1‑195 (MQ=255) gTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGCTCTCCACGCCGCCGGCGGCGtggagaccatcatgtgcaaagtcaccctcgacgaatgggcgcacgatcacttcagaacgccgcccagca > 1:351962‑M1/1‑58 (MQ=255) cgcACATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCGTATGCTCGCAg < 1:458945/183‑1 (MQ=255) cccATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGtggagaccatcatgtgcaaagtcaccctcgacgaatgggcgcacgatcacttcagcacgccgcccagcagcaacactcttcgccgtt > 2:764608‑M1/1‑53 (MQ=255) cccATTCGGCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCGTATGCTCGCAg < 2:105541/181‑1 (MQ=255) ttCGTCGAGGGTGCCTGTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCGTATGCTCGCAGCTGTGCTGCAGCGTCGATCAGGTCTTCCAGCAGCAGAgggg < 2:768756/218‑1 (MQ=255) ttCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGtggagaccatcatgtgcaaagtcaccctcgacgaatgggcgcacgatcacttcagaacgccgcccagcagcaacactc < 2:351959‑M1/127‑79 (MQ=255) gtcgAGGGTGACTTTGCACATGATCGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGc < 2:719371/128‑1 (MQ=255) gACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCGTATGCTCGCAGCTGTGCTGCAGCGTCGATCAGGTCTTCCAGCAGCAGAGGGGACGCCGCAATCAACTTTGCGTTTGCCAttt > 1:636655/1‑236 (MQ=255) cTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCGTATGCTCGCAGCTGTGCTGCAGCGTCGATCAGGTCTTCCAGCAGCAGAGGGGa > 2:638103/1‑205 (MQ=255) ttGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCGTATGCTCGCAGCTGTGCTGCAGCGTCGATCAGGTCTTCCAGCAGCAGAGGGGACGCCGCAATCAACTTTGCGTTTGCCATTTg > 2:336877/1‑233 (MQ=255) tGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCGTATGCTCGCAGCTGTGCTGCAGCGTCGATCAGGTCTTCCAGCAGCAGAGGGGACGCCGCAATCAACTTTGCGTTTGCCATTTGATGc < 1:125693/236‑1 (MQ=255) acaTGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCaggag < 2:788693/44‑1 (MQ=255) acaTGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCaggag > 1:788696/1‑44 (MQ=255) acaTGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCGTATGCTCGCAGCTGTGCTGCAGCGTCGATCAGGTCTTCCAGCAGCAGAGGGGACGCCGCAATCAACTTTGCGTTTGCCATTTGATGc < 2:556885/233‑1 (MQ=255) tgatgGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAg > 2:775627/1‑45 (MQ=255) tgatgGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAg < 1:775630/45‑1 (MQ=255) tgGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAg < 1:449810/42‑1 (MQ=255) ggTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCGTATGCTCGCAGCTGTGCTGCAGCGTCGATCAGGTCTTCCAGCAGCAGAGGGGACGCCGCAAt > 2:353384/1‑201 (MQ=255) ccACGCCGCCGGCGGCGtggagaccatcatgtgcaaagtcaccctcgacgaatgggcgcacgatcacttcagaacgccgcccagcagcaacactcttcgccgttgggcccgtgagggcctgatcaccccggccccggtaaagcacggt > 2:815487‑M1/1‑17 (MQ=255) ccACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCGTATGCTCGCAGCTGTGCTGCAGCGTCGATCAGGTCTTCcag > 2:60238/1‑175 (MQ=255) aCGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGgc < 2:393701/116‑1 (MQ=255) gccggcGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCGTATGCTCGCAGCTGTGCTGCAGCGTCGATCAGGTCTTCCAGCAGCAGAGGGGAcgcc < 2:293295/187‑1 (MQ=255) gccgccGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCGTATGCTCGCAGCTGTGCTGCAGCGTCGATCAGGTCTTCCAGCAGCAGAGGGGACGCCGCAATCAACTTTGCGTTTGCCATTTGATGCATTCCCCCATCt > 2:593433/1‑229 (MQ=255) ccgccgGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCGTATGCTCGCAGCTGTGCTGCAGCGTCGATCAGGTCTTCCAGCAGCAGAGGGGAcgc > 2:516946/1‑185 (MQ=255) cgccgGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCGTATGCTCGCAGCTGTGCTGCAGCGTCGATCAGGTCTTCCAGCAGCAGAGGGGACGCCGCAATCAACTTTGCGTTTGCCATTTGATGCa > 1:676291/1‑216 (MQ=255) cgccgGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCGTATGCTCGCAGCTGTGCTGCAGCGTCGATCAGGTCTTCCAGCAGCAGAGGGGACGCCGCAATCAACTTTGCGTTTGCCATTTGATGCa < 2:676288/216‑1 (MQ=255) gccgGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGt > 2:449807/1‑42 (MQ=255) ccgGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGGCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCttt < 1:575053/84‑1 (MQ=255) cggcggcggCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCGTATGCTCGCAGCt > 2:554418/1‑138 (MQ=255) cggcggCGtggagaccatcatgtgcaaagtcaccctcgacgaatgggcgcacgatcacttcagaacgccgcccagcagcaacactcttcgccgttgggcccgtgagggcctgatcagcccggacccggtaaagcacggtcgcagctactatgttgaggccgatgcctgctaccgggagccagagccgctgccccgcgttccagtgggcag > 1:509797‑M1/1‑8 (MQ=255) ggcggcggcAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTg > 2:407041/1‑106 (MQ=255) ggcggcggcAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTg < 1:407044/106‑1 (MQ=255) gtcggcAGGGTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCGTATGCTCg < 2:628045/127‑1 (MQ=255) gcggcAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCGTATGCTCGCAGCTGTGCTGCAGCGTCGATCAGGTCTTCCAGCAGCAGAGGGGGCGCCGCAATCAACTTTGCGTTTGCCa > 2:264519/1‑199 (MQ=255) cggcAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCGTATGCTCg < 2:600986/127‑1 (MQ=255) | ATTCGATTAACAAGGGGACTGCCCACTGGAACGCGGGGCAGCGGCTCTGGCTCCCGGTAGCAGGCATCGGCCTCAACATAGTAGCTGCGACCGTGCTTTACCGGGGCCGGGGTGATCAGGCCCTCACGGGCCCAACGGCGAAGAGTGTTGCTGCTGGGCGGCGTTCTGAAGTGATCGTGCGCCCATTCGTCGAGGGTGACTTTGCACATGATGGTCTCCACGCCGCCGGCGGCGGCAGGTTGTCAGGAGGTAGCCTTTACGATGGTCTGCTCGAAGCGCGCGGCCAGGTTGGCGTTGACCTCGGCCTTTGCCATGCTGTCGGAGGTGCCTTTGGCGCGGTGCAGGGTCTCGTATGCTCGCAGCTGTGCTGCAGCGTCGATCAGGTCTTCCAGCAGCAGAGGGGACGCCGCAATCAACTTTGCGTTTGCCATTTGATGCATTCCCCCATCT > AE015451/1739207‑1739656 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |