New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 2457184 | 50 (1.000) | 3 (0.060) | 3/312 | NT | 5.2% | coding (255/999 nt) | PP_2150 | putative Thiamine biosynthesis lipoprotein |
? | AE015451 | = 2457331 | 64 (1.390) | coding (402/999 nt) | PP_2150 | putative Thiamine biosynthesis lipoprotein |
ATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTG > AE015451/2456951‑2457415 | aTTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTgg > 1:6013/1‑235 (MQ=255) tCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGc > 1:276787/1‑234 (MQ=255) gCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCt < 1:629871/236‑1 (MQ=255) aCCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGtt < 1:723916/235‑1 (MQ=255) cTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTcgc > 2:15434/1‑218 (MQ=255) gcgcCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTGCTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCAc > 1:637961/1‑235 (MQ=255) cgcCTGGGTGGTCCGACCATGCGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGtt < 1:70877/215‑1 (MQ=255) ccTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCtt < 1:732043/235‑1 (MQ=255) gggTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGcc > 1:141242/1‑235 (MQ=255) gggTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGcc > 1:887601/1‑235 (MQ=255) ggtggtCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGc > 2:498791/1‑233 (MQ=255) gtCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTgccgcc > 2:524670/1‑190 (MQ=255) gtCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTgccgcc < 1:524673/190‑1 (MQ=255) gACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCa < 2:875695/206‑1 (MQ=255) cagcTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGCCATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGtt < 1:135941/189‑1 (MQ=255) cagcTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTc < 1:349391/235‑1 (MQ=255) cTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACa < 2:938446/176‑1 (MQ=255) tACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTGCTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGa < 2:637958/233‑1 (MQ=255) tACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCCCTgccg > 2:756866/1‑156 (MQ=255) gcgAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCa < 2:431930/181‑1 (MQ=255) cgAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGctc < 2:861085/143‑1 (MQ=255) gCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACa < 1:315281/152‑1 (MQ=255) ccGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTAGACTTGTGGGGCt < 1:575872/235‑1 (MQ=255) tGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGt < 1:296578/236‑1 (MQ=255) gCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGtt < 2:804027/135‑1 (MQ=255) gCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGtt > 1:804030/1‑135 (MQ=255) aTGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGa < 2:183638/167‑1 (MQ=255) tGGAAACCATCCTGCACGACATCGCCCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGGGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCt > 2:289051/1‑133 (MQ=255) ggAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGAtct > 2:3159/1‑174 (MQ=255) gAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGcc < 1:605758/236‑1 (MQ=255) cATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGaa < 1:15434/235‑1 (MQ=255) cATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAACACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAAc < 1:145427/236‑1 (MQ=255) aTCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAAcc < 1:770133/236‑1 (MQ=255) gCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCa > 2:747678/1‑164 (MQ=255) cACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCAcagg > 1:498794‑M2/1‑231 (MQ=255) ggcatCGACCACCACTGCTCGCCCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTG < 2:187711‑M1/79‑1 (MQ=255) aTCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCAcaggcactgg > 1:142160‑M2/1‑225 (MQ=255) cGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTaga > 2:707103/1‑162 (MQ=255) cGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCGGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCAcaggcactggccc < 1:742935‑M2/236‑14 (MQ=255) gACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGtggttcgggcacttgctcgtgacgggcctgagggccgaagccccacaagtcgcgcaatggctctacggt > 1:159762‑M1/1‑75 (MQ=255) tactCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGtggttcgggcacttgctcgtgacgggcctgagggccgaagccccacaagtcgagcaatggctctacggggagatcgaaagcgccatcgctctgctcggcaaggagct > 1:179323‑M1/1‑66 (MQ=255) aCCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTgggg > 1:2020/1‑163 (MQ=255) aCCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAg > 1:218442/1‑218 (MQ=255) gcggcgATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAg < 1:808813/224‑1 (MQ=255) gcggcgATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTAc > 1:904133/1‑236 (MQ=255) ttCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGtggttcgggcacttgctcgtgacgggcctgagggccgaagccccacaagtcgagcaatggctctacggtgggatcgaacg > 2:256750‑M1/1‑46 (MQ=255) tCGCAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCGGCGGGCCAGTGCCTGGCTCGGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTg < 2:181827/134‑1 (MQ=255) aaGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACa < 1:576126/53‑1 (MQ=255) aaGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACa > 2:576123/1‑53 (MQ=255) cAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCGGGGTCAGCACCTTACCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCATGccc > 2:861124/1‑157 (MQ=255) aaCCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGa > 2:935206/1‑89 (MQ=255) aaCCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGa < 1:935209/89‑1 (MQ=255) aaCCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCa > 2:687763/1‑212 (MQ=255) aaCCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGc > 1:464273/1‑236 (MQ=255) aaCCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGGCACGAGCAAg > 2:192971/1‑163 (MQ=255) gCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCa < 1:884960/193‑1 (MQ=255) tGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGa < 2:717100/227‑1 (MQ=255) gggCCAGTGCCTGtggttcgggcacttgctcgtgaccggcctgagggccgaagccccacaagtcgagcaatggctctacggtgagatcgaaagcgccatcgctctgctcggcaaggtgctgacccaggctgaccaacgcgagcatgtcaggcggcagagccaggcactggcccgcaggcaagcggttgaactggcttacgatggaatcgccgcggtaggtcgagtagtggtggtcg < 1:742935‑M1/236‑224 (MQ=255) ggCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCAGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAg > 1:657867/1‑214 (MQ=255) ccAGTGCCTGtggttcgggcacttgctcgtgacgggcctgagggccgaagccccacaagtcgagcaatggctctacggtgagatcgaaagcgccatcgctctgctcggcaaggtgctgacccaggctgaccaacgcgagcatgtcaggcggcagagccaggcactggcccgcaggcaagcggttgaactggcttacgatggaatcgccgcggtaggtcgagtagtggtggtcgat > 1:142160‑M1/1‑10 (MQ=255) aGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCg < 1:396282/236‑1 (MQ=255) tGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCa < 2:49115/37‑1 (MQ=255) ccTGtggttcgggcacttgctcgtgacgggcctgagggccgaagccccacaagtcgagcaatggctctacggtgagatcgaaagcgccatcgctctgctcggcaaggtgctgacccaggctgaccaacgcgagcatgtcaggcggcagagccaggcactggcccgcaggcaagcggttgaactggcttacgatggaatcgccgcggtaggtcgagtagtggtggtcgatgtcgtg > 1:498794‑M1/1‑4 (MQ=255) cTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGGGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGa < 2:896078/210‑1 (MQ=255) cTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTgcgc > 1:635589/1‑171 (MQ=255) | ATTCTGCTGCTACTCACCGCCTGCAACCAAGGCCCCACCCTGGAGCGCCTGGGTGGTCCGACCATGGGCAGCAGCTACAGCATCCAGTACGTCCGCGAGCCTGGTGGCCCGCTGCCGGCCCAGGTGCAGATGGCGGTGGAAACCATCCTGCACGACATCGACCACCACTACTCGACCTACCGCGGCGATTCCATCGTAAGCCAGTTCAACCGCTTGCCTGCGGGCCAGTGCCTGGCTCTGCCGCCTGACATGCTCGCGTTGGTCAGCCTGGGTCAGCACCTTGCCGAGCAGAGCGATGGCGCTTTCGATCTCACCGTAGAGCCATTGCTCGACTTGTGGGGCTTCGGCCCTCAGGCCCGTCACGAGCAAGTGCCCGAACCACAGGCACTGGCCCAGGTGCGCCAGCGTGTGGGTTACCAGCACTTGCGCGTCAAAGGTCGAGCCCTGTGCAAGGATGCCCCGGTG > AE015451/2456951‑2457415 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |