New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 3220484 | 42 (0.840) | 5 (0.100) | 5/324 | NT | 10.8% | coding (528/1161 nt) | PP_5539 | conserved exported protein of unknown function |
? | AE015451 | = 3220485 | 42 (0.880) | coding (527/1161 nt) | PP_5539 | conserved exported protein of unknown function |
GCCGATGGACGCGAAACCGCCTTTCTTGCGGTTCAGGCTCAGGAAGTCGACCTGTGTAGGCGAGCCCCCTGGGGCGACGACCGAGGCGCTGAGGTTCGTGTCGATGTCCGCTTCGGCGTACCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCACCTTCGTAGTTGCTCAGCTGGACCTGGCTGTAGACCTCATCCGGCAGCCGCAGCCAAGGGTGGGTGACACCGACGTCGAGGGTTTCGGAATACATGTAGATCGGCAGGCGCAGCCGCCCTACGCGCACCGTCAGGCCTTCGGTCGCTTTCCAGGAGAGGTAA > AE015451/3220250‑3220712 | gCCGATGGACGCGAAACCGCCTTTCTTGCGGTTCAGGCTCAGGAAGTCGACCTGTGTAGGCGAGCCCCCTGGGGCGACGACCGAGGCGCTGAGGTTCGTGTCGATGTCCGCTTCGGCGTACCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCC > 1:816007‑M1/1‑235 (MQ=255) aCGCGAAACCGCCTTTCTTGCGGTTCAGGCTCAGGAAGTCGACCTGTGTAGGCGAGCCCCCTGGGGCGACGACCGAGGCGCTGAGGTTCGTGTCGATGTCCGCTTCGGCGTACCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTggccgcca > 1:658367‑M2/1‑228 (MQ=255) ggCTCAGGAAGTCGGCCTGTGTAGGCGAGCCCCCTGGGGCGACGACCGAGGCGCTGAGGTTCGTGTCGATGTCCGCTTCGGCGTACCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCt < 1:129600/201‑1 (MQ=255) gAAGTCGACCTGTGTAGGCGAGCCCCCTGGGGCGACGACCGAGGCGCTGAGGTTCGTGTCGATGTCCGCTTCGGCGTACCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCggtgg < 1:910692/236‑1 (MQ=255) aGTCGACCTGTGTAGGCGAGCCCCCTGGGGCGACGACCGAGGCGCTGAGGTTCGTGTCGATGTCCGCTTCGGCGTACCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTc < 1:213102/236‑1 (MQ=255) tgtAGGCGAGCCCCCTGGGGCGACGACCGAGGCGCTGAGGTTCGTGTCGATGTCCGCTTCGGCGTACCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGgtgt < 2:518183/233‑1 (MQ=255) gtAGGCGAGCCCCCTGGGGCGACGACCGAGGCGCTGAGGTTCGTGTCGATGTCCGCTTCGGCGTACCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCgg < 1:289602/220‑1 (MQ=255) gtAGGCGAGCCCCCTGGGGCGACGACCGAGGCGCTGAGGTTCGTGTCGATGTCCGCTTCGGCGTACCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCgg > 2:289599/1‑220 (MQ=255) tAGGCGAGCCCACTGGGGCGACGACCGAGGCGCTGAGGTTCGTGTCGATGTCCGCTTCGGCGTACCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTggccgccaaccgcaacttgttcgccat > 1:399877‑M2/1‑180 (MQ=255) gCGAGCCCCCTGGGGCGACGACCGAGGCGCTGAGGTTCGTGTCGATGTCCGCTTCGGCGTACCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCa > 1:563147/1‑236 (MQ=255) cccccTGGGGCGACGACCGAGGCGCTGAGGTTCGTGTCGATGTCCGCTTCGGCGTACCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCg < 2:563144/234‑1 (MQ=255) ccTGGGGCGACGACCGAGGCGCTGAGGTTCGTGTCGATGTCCGCTTCGGCGTACCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCAc > 2:363514/1‑194 (MQ=255) ccTGGGGCGACGACCGAGGCGCTGAGGTTCGTGTCGATGTCCGCTTCGGCGTACCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCg > 1:87989/1‑201 (MQ=255) ccTGGGGCGACGACCGAGGCGCTGAGGTTCGTGTCGATGTCCGCTTCGGCGTACCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCAcc > 1:447681/1‑236 (MQ=255) ccTGGGGCGACGACCGAGGCGCTGAGGTTCGTGTCGATGTCCGCTTCGGCGTACCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGGCACGGTGTAGAGGGCATCGGCAcc > 1:127056/1‑236 (MQ=255) ccTGGGGCGACGACCGAGGCGCTGAGGTTCGTGTCGATGTCCGCTTCGGCGTACCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGGTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCCCGGAGCCg > 2:251234/1‑201 (MQ=255) cgacgaCCGAGGCGCTGAGGTTCGTGTCGATGTCCGCTTCGGCGTACCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCACCTTCGTAg < 1:561774/236‑1 (MQ=255) ccGAGGCGCTGAGGTTCGTGTCGATGTCCGCTTCGGCGTACCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCACCTTCGTAGTTg > 2:827837/1‑233 (MQ=255) gggCGCTGAGGTTCGTGTCGATGTCCGCTTCGGCGTGCCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTc < 2:143819/175‑1 (MQ=255) cgcTGAGGTTCGTGTCGATGTCCGCTTCGGCGTACCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGt < 2:222454/172‑1 (MQ=255) gAGGTTCGTGTCGATGTCCGCTTCGGCGTACCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTggccgccaaccgcaacttgttcgccatggatgacttgtacga > 1:676408‑M2/1‑146 (MQ=255) tCGATGTCCGCTTCGGCGTACCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGGACGTCACGGAGccggtgccggtg > 2:128170/1‑177 (MQ=255) cGGCGTACCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTggccgccaaccgcaacttgttcgccatggatgacttgtacgacatc < 1:434691‑M2/169‑47 (MQ=255) cGGCGTACCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTggccgccaaccgcaacttgttcgccatggatgacttgtacgacatc > 2:434688‑M2/1‑123 (MQ=255) cGGCGTACCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCACCTTCGTAGt < 2:674083/198‑1 (MQ=255) cGGCGTAACCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCggtggt < 2:680952/166‑1 (MQ=255) ccccGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCACCTTCGTAGTTGCTCAGCTGGACCTGGCTGTa < 1:164939/213‑1 (MQ=255) ccGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCACCTTCGTAGTTGCTCAGCTGGACCTGGCTGTAGACCTCATCCGGCAGCCGCAGCCa < 1:827840/236‑1 (MQ=255) aCGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCAGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCACCTTCGTAGTTGCTCAGCTgg < 1:222206/196‑1 (MQ=255) cAGCGTGCTGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCggtg < 2:204296/148‑1 (MQ=255) gCGTGCCGAAGCCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCACCTTCGTAGTTGCTCAGCTGGACCTGGCTGt < 2:374706/201‑1 (MQ=255) cGAAGTCAGAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCACCTTCGTAGTTGCTCAGCTTGACCTGGCTGTAGACCTCATCCGgcagccgc < 2:493571/215‑1 (MQ=255) gAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCACCTTCGTAGGTGCTCAGCTGGACCTGGCTGTAGACCTCATCCGGCAGCCGCAGCCAAGGGTGGGTGACAcc > 1:273500/1‑234 (MQ=255) gTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGTCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCACCTTCGTAGTTGCTCAGCTGGACCTGGCTGTAGACCTCATCCGGCAGCCGCAGCCAAGGGTGGGTGACACTGACGTCGAggg < 1:878872/235‑1 (MQ=255) tCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCACCTTCGTAGTTGCTCAGCTGGACCTGGCTGt < 2:87989/181‑1 (MQ=255) ggCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGACATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCaggccgccaaccgcaacttgttcgccatggatgactcgtacgacatcgactacaagaagatcttcgcgg > 2:422270‑M1/1‑80 (MQ=255) tCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCACCTTCGTAGTTGCTCAGCTGGACCTGGCTGTAGACCTCATCCGGCAGCCGCAGCCAAGGGTGGGTGACACCGACGTCGa < 2:536482/216‑1 (MQ=255) ccgcGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACGAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTggccgccaaccgcaacttgttcgccatggatgtcttgtacgacatcgactacaagaagatcttcgcggcgaacgtcagcc > 2:422270‑M2/1‑69 (MQ=255) aTCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCACCTTCGTAGTTGCTCAGCTGGACCTGGCTGTAGACCTCATCCGGCAGCCGCAGCCAAGGGTGGGTGACACCGACGTCGAGGGt < 2:447678/209‑1 (MQ=255) cgTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCTAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGTCCGCCGGCCACCTGGAACGTCCCGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCACCTTCGTAGTTGCTCAGCTGGACCTGGCTGTAGACCTCATCCGgcagccgc < 2:82052/166‑1 (MQ=255) cGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGGCggtg > 2:128291/1‑89 (MQ=255) gATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCaggccgccaaccgcaacttgttcgccatggatgacttgtacgacatcgactacaagaagatcttcgcggcgaacgtcagcctggaaacctatgacttcggcacgctgcgtctcgggtacgccg > 2:434688‑M1/1‑46 (MQ=255) gATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCaggccgccaaccgcaacttgttcgccatggatgacttgtacgacatcgactacaagaagatcttcgcggcgaacgtcagcctggaaacctatgacttcggcacgctgcgtctcgggtacgccg < 1:434691‑M1/169‑124 (MQ=255) gATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCC < 1:501621‑M1/46‑1 (MQ=255) gATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCC > 2:501618‑M1/1‑46 (MQ=255) aTGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCACCTTCGTAGTTGCTCAGCTGGACCTGGCTGTAGACCTCATCCGGCAGCCGCAGCCAAGGGTGGGTGACACCGACGTCGAGGGTTTCGGAATACATGTAGATCGGCAGGCGCAGCCGCCCTAcgcg > 1:879454/1‑236 (MQ=255) tCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCaggccgccaaccgcaacttgttcgccatggatgacttgtacgacatcgactacaagaagatcttcgcggcgaacgtcagcctggaaacctatgacttcggcacgctgcgtctcgggtacgccgaagcggacatcgacacgaacctc > 1:676408‑M1/1‑42 (MQ=255) cATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCACCTTCGTAGTTGCTCAGCTGGACCTGGCTGTAGACCTCATCCGGCAGCCGCAGCCAAGGGTGGGTGACACCGACGTCGAGGGTTTCGGAATACATGTAGATCGGCAGGCGCAGCCGCCCTACGCGCACCGTCAGGCCTTCgg > 1:399707/1‑236 (MQ=255) aTGGCGAACAGGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAGCGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCACCTTCGTAGTTGCTCAGCTGGa < 2:174334/115‑1 (MQ=255) aTGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCaggccgccaaccgcaacttgttcgccatggatgacttgtacgacatcgactacaagaagatcttcgcggcgaacgtcagcctggaaacctatgacttcggcacgctgcgtctcgggtacgccgaagcggacatcgacacgaacctcagcgcctcggtcgtcgccccagtgggctcgccta > 1:399877‑M1/1‑27 (MQ=255) ggCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCACCTTCGTAGTTGCTCAGCTGGACCTGGCTGTAGACCTCATCCGGCAGCCGCAGCCAAGGGTGGGTGACACCGACGTCGAGGGTTTCGGAATACATGTAGATCGGCAGGCGCAGCCGCCCTACGCGCACCGTCAGGCCTTCgg < 2:592356/233‑1 (MQ=255) aaGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCACCTTCGTAGTTGCTCAGCTGGACCTGGCTGTAGACCTCATCCGGCAGCCGCAGCCAAGGGTGGGTGACACCGACGTCGAggg < 2:242318/166‑1 (MQ=255) aaGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCACCTTCGTAGTTGCTCAGCTGGACCTGGCTGTAGACCTCATCCGGCAGCCGCAGCCAAGGGTGGGTGACACCGACGTCGAGGGTTTCGGAATACATGTAGATCGGCAGGCGCAGCCGCCCTAcgc < 1:326129/208‑1 (MQ=255) aaGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCACCTTCGTAGTTGCTCAGCTGGACCTGGCTGTAGACCTCATCCGGCAGCCGCAGCCAAGGGTGGGTGACACCGACGTCGAGGGTTTCGGAATACATGTAGATCGGCAGGCGCAGCCGCCCTACGCGCACCGTCAGGCCTTCGGTCGCt < 1:136754/231‑1 (MQ=255) gTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCACCTTCGTAGTTGCTCAGCt < 1:726082/101‑1 (MQ=255) gTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCACCTTCGTAGTTGCTCAGCt > 2:726079/1‑101 (MQ=255) ggTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCACCTTCGTAGTTGCTCAGCTGGACCTGGCTGTAGACCTCATCCGGCAGCCGCAGCCAAGGGTGGGTGACACCGACGTCGAGGGTTTCGGAATACATGTAGATCGGCAGGCGCAGCCGCCCTACGCGCACCGTCAGGCCTTCGGTCGCTTTCCAGgaga < 2:812557/234‑1 (MQ=255) tGGCGGCCaggccgccaaccgcaacttgttcgccatggatgacttgtacgacatcgactacaagaagatcttcgcggcgaacgtcagcctggaaacctatgacttcggcacgctgcgtctcgggtacgccgaagcggacatcgacacgaacctcagcgcctcggtcgtcgccccagggggctcgcctacacaggtcgacttcctgagcctgaaccgcaagaaaggcggtttcgcgt > 1:658367‑M1/1‑8 (MQ=255) ccTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATg < 1:843009/38‑1 (MQ=255) ccTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATg > 2:843006/1‑38 (MQ=255) | GCCGATGGACGCGAAACCGCCTTTCTTGCGGTTCAGGCTCAGGAAGTCGACCTGTGTAGGCGAGCCCCCTGGGGCGACGACCGAGGCGCTGAGGTTCGTGTCGATGTCCGCTTCGGCGTACCCGAGACGCAGCGTGCCGAAGTCATAGGTTTCCAGGCTGACGTTCGCCGCGAAGATCTTCTTGTAGTCGATGTCGTACAAGTCATCCATGGCGAACAAGTTGCGGTTGGCGGCCTGGCCGCCGGCCACCTGGAACGTCACGGAGCCGATGCCGGTGGTCACGGTGTAGAGGGCATCGGCACCTTCGTAGTTGCTCAGCTGGACCTGGCTGTAGACCTCATCCGGCAGCCGCAGCCAAGGGTGGGTGACACCGACGTCGAGGGTTTCGGAATACATGTAGATCGGCAGGCGCAGCCGCCCTACGCGCACCGTCAGGCCTTCGGTCGCTTTCCAGGAGAGGTAA > AE015451/3220250‑3220712 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |