New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 3398276 = | 45 (0.900) | 7 (0.150) | 6/320 | NT | 14.8% | coding (757/819 nt) | PP_3002 | shikimate dehydrogenase‑related enzyme |
? | AE015451 | 3398411 = | 38 (0.800) | coding (69/438 nt) | aroQ‑III | 3‑dehydroquinate dehydratase 3, type II |
GCGCTGGAAGGGCAATCGTTCGACATCGTCGTCAACGCCACCTCGGCGAGCCTGACCGCGGACTTGCCGCCCCTGCCGGCTGATGTGCTGGGCGAGGCGGCCTTGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGACCCTGGCCGACATCGACCAGGCGTTACAGGCCCTGGGCGAGGAGCTGGGGGCACAGGTCGAGAGCTTCCAGAGCAACTTCGAGGGC > AE015451/3398045‑3398510 | gcgcTGGAAGGGCAATCGTTCGACATCGTCGTCAACGCCACCTCGGCGAGCCTGACCGCGGACTTGCCGCCCCTGCCGGCTGATGTGCTGGGCGAGGCGGCCTTGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGgc > 1:400518/1‑235 (MQ=255) cgcTGGAAGGGCAATCGTTCGACATCGTCGTCAACGCCACCTCGGCGAGCCTGACCGCGGACTTGCCGCCCCTGCCGGCTGATGTGCTGGGCGAGGCGGCCTTGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCtggtgg < 2:400515/233‑1 (MQ=255) cTGGAAGGGCAATCGTTCGACATCGTCGTCAACGCCACCTCGGCGAGCCTGACCGCGGACTTGCCGCCCCTGCCGGCTGATGTGCTGGGCGAGGCGGCCTTGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCgg > 1:893342/1‑236 (MQ=255) tCGTTCGACCTCGTCGTCAACGCCACCTCGGCGAGCCTGACCGCGGACTTGCCGCCCCTGCCGGCTGATGTGCTGGGCGAGGCGGCCTTGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCtggtg < 1:128308/218‑1 (MQ=255) gACCGCGGACTTGCCGCCCCTGCCGGCTGATGTGCTGGGCGAGGCGGCCTTGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGacacac > 1:264996/1‑203 (MQ=255) accggcattgatcagcacggcatccacccggtcctcataggcctgatggatgcgctcgcacatggcgccctcgaagttgctctggaagctctcgacctgtgcccccagctcctcgcccagggcctgtaacgcctggtcgatgtcggccagggtcgctgtgccgtacTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGAt > 1:820489‑M1/167‑235 (MQ=255) cggcggATGTGCTGGGCGAGGCGGCCTTGGCCTACGCGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATg < 1:597626/235‑1 (MQ=255) cGGCTGATGTGCTGGGCGAGGCGGCCTTGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGt > 1:365335/1‑236 (MQ=255) gCTGATGTGCTGGGCGAGGCGGCCTTGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCggg < 2:458110/162‑1 (MQ=255) ggCTGGGCGAGGCGGCCTTGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGAtgc < 1:667068/234‑1 (MQ=255) atccacccggtcctcataggcctgatggatgcgctcgcacatggcgccctcgaagttgctctggaagctctcgacctgtgcccccagctcctcgcccagggcctgtaacgcctggtcgatgtcggccagggtcgctgtgccgtacTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGAt > 1:315546‑M1/146‑214 (MQ=255) tGGGCGAGGCGGCCTTGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCGCGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCgg < 2:196717/151‑1 (MQ=255) ccacccggtcctcataggcctgatggatgcgctcgcacatggcgccctcgaagttgctctggaagctctcgacctgtgcccccagctcctcgcccagggcctgtaacgcctggtcgatgtcggccagggtcgctgtgccgtacTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGt < 1:644315‑M1/72‑1 (MQ=255) ccacccggtcctcataggcctgatggatgcgctcgcacatggcgccctcgaagttgctctggaagctctcgacctgtgcccccagctcctcgcccagggcctgtaacgcctggtcgatgtcggccagggtcgctgtgccgtacTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGt > 2:644312‑M1/144‑215 (MQ=255) gggCGAGGCGGCCTTGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGAtgct < 2:557581/232‑1 (MQ=255) ggcggcCTTGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGCTGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCa > 1:73456/1‑234 (MQ=255) ggcggcCTTGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTGTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGc < 1:790710/233‑1 (MQ=255) ggcCTTGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGAtgct > 1:353088/1‑223 (MQ=255) gcCTTGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATg < 2:660253/227‑1 (MQ=255) aCGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGACAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCATTCAGCTGACGATTCCCtt < 1:657154/178‑1 (MQ=255) ggatgcgctcgcacatggcgccctcgaagttgctctggaagctctcgacctgtgcccccagctcctcgcccagggcctgtaacgcctggtcgatgtcggccagggtcgctgtgccgtacTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTc > 1:57085‑M1/120‑185 (MQ=255) gCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCgg > 1:696394/1‑235 (MQ=255) tgtGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGcgcg < 1:145021/234‑1 (MQ=255) tATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGAtt > 1:563294/1‑162 (MQ=255) tATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGAtt < 2:563291/162‑1 (MQ=255) tATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGcgcg > 1:292750/1‑236 (MQ=255) ggCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCcg < 1:99354/232‑1 (MQ=255) gcgccctcgaagttgctctggaagctctcgacctgtgcccccagctcctcgcccagggcctgtaacgcctggtcgatgtcggccagggtcgctgtgccgtacTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGAc > 2:388504‑M1/103‑149 (MQ=255) gCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCCTGCTGGGGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACCCGTGCg > 2:114839/1‑131 (MQ=255) gCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCgcgc > 1:520074/1‑234 (MQ=255) gCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGAt < 1:52531/163‑1 (MQ=255) cTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCa < 1:843806/222‑1 (MQ=255) tGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCA‑GCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGGGCGGCCCGACACACGTGCGGt > 2:199380/1‑117 (MQ=255) cTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATgg > 1:205103/1‑177 (MQ=255) cTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATgg < 2:205101/177‑1 (MQ=255) cTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGACCCTgg > 1:121044/1‑236 (MQ=255) tCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGACCCTGGcc > 2:869861/1‑233 (MQ=255) gcgAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAg > 2:406069/1‑137 (MQ=255) gcgAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGACCCTGGCCGACAt > 1:679647/1‑236 (MQ=255) ggAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGt < 2:2650/104‑1 (MQ=255) gAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCcg < 2:689085/202‑1 (MQ=255) ctgtgcccccagctccccgcccagggcctgtaacgcctggtcgatgtcggccagggtcgctgtgccgtacTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGc > 2:626076‑M1/71‑167 (MQ=255) ggCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGt < 1:88983/138‑1 (MQ=255) ggggCTCGCCGGGCGGATGGCGTGGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGAt < 2:796778/130‑1 (MQ=255) ccTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTg < 2:449476/140‑1 (MQ=255) tGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGACCCTGGCCGACATCGACCAGGCGTTACAGGccc > 1:688919/1‑235 (MQ=255) ggCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGa < 2:274314/98‑1 (MQ=255) ggCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGa > 1:274317/1‑98 (MQ=255) aTGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGACCCTGGcc < 2:320062/204‑1 (MQ=255) gCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGACCCTGGCCGACATCGACCAGGCGTTACAGGCCCTGGGCgagga > 1:361336/1‑236 (MQ=255) cGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGAc > 2:687957/1‑190 (MQ=255) gCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCGCAGCg < 2:584372/186‑1 (MQ=255) aGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAAt < 2:200713/102‑1 (MQ=255) cgccgAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTTCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTCGGTCGATGGTCGCCAATGTAc > 2:1382/1‑102 (MQ=255) ccgCGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGACCCTGGCCGACATCGACCAGGCGTTACAGGCCCTGGGCgatgtcggc < 2:365332/213‑8 (MQ=255) gtggCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGACCCTGGCCGACATCGACCAGGCGTTACAGGCCCTGGGCGAGGAGCTGGGGGCACAGGTCGAGAGCTTCCAGAGCAACTTCGAGGgc < 1:260248/236‑1 (MQ=255) gtggCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCGGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCaa < 1:639784/121‑1 (MQ=255) | GCGCTGGAAGGGCAATCGTTCGACATCGTCGTCAACGCCACCTCGGCGAGCCTGACCGCGGACTTGCCGCCCCTGCCGGCTGATGTGCTGGGCGAGGCGGCCTTGGCCTACGAGCTGGCCTATGGCAAAGGCCTCACGCCTTTCCTGCGCCTGGCTCGCGAGCAGGGCCAGGCGCGCCTGGCCGATGGCGTCGGCATGCTGGTGGAGCAGGCCGCCGAGGCGTTTGCCTGGTGGCGCGGGGTGCGGCCCGACACACGTGCGGTGATCAATCAGCTGACGATTCCCTTGGAGTAGGTCGATGGTCGCCAATGTACTGATGCTGCATGGCATCAACCACAACATGTTCGGCAAGCGCGACCCGCGCCAGTACGGCACAGCGACCCTGGCCGACATCGACCAGGCGTTACAGGCCCTGGGCGAGGAGCTGGGGGCACAGGTCGAGAGCTTCCAGAGCAACTTCGAGGGC > AE015451/3398045‑3398510 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |