| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | AE015451 | = 3550927 | 67 (1.340) | 4 (0.080) | 4/320 | NT | 6.3% | coding (79/957 nt) | PP_3135 | putative Glycosyl transferase |
| ? | AE015451 | = 3550994 | 55 (1.160) | coding (146/957 nt) | PP_3135 | putative Glycosyl transferase | |||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
CCGAACAGTTGATCAAGCGGGTCGAGGCACGTTGCGAAGCCTACCCATGGATCGATCTGGTGAAGCAGCGCAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACCGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCTCAATACCGATGCCTTCGTTGCCGCCGACTCGCTGCAAAAAA > AE015451/3550702‑3551155 | ccGAACAGTTGATCAAGCGGGTCGAGGCACGTTGCGAAGCCTACCCATGGATCGATCTGGTGAAGCAGCGCAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACCGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGa > 1:563628/1‑236 (MQ=255) aGTTGATCAAGCGGGTCGAGGCACGTTGCGAAGCCTACCCATGGATCGATCTGGTGAAGCAGCGCAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACCGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACagcga > 1:22466/1‑236 (MQ=255) aTCAAGCGGGTCGAGGCACGTTGCGAAGCCTACCCATGGATCGATCTGGTGAAGCAGCGCAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACCGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCgg < 1:621009/235‑1 (MQ=255) aaGCGGGTCGAGGCACGTTGCGAAGCCTACCCATGGATCGATCTGGTGAAGCAGCGCAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACCGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTg > 1:454178/1‑235 (MQ=255) gAGGCACGTTGCGAAGCCTACCCATGGATCGATCTGGTGAAGCAGCGCAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACCGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTGCGGGGACAGCTGAAATGGGTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCATCTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACagcga > 1:518393/1‑219 (MQ=255) aGGCACGTTGCGAAGCCTACCCATGGATCGATCTGGTGAAGCAGCGCAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACCGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTAcc > 1:849815/1‑235 (MQ=255) aGGCACGTTGCGAAGCCTACCCATGGATCGATCTGGTGAAGCAGCGCAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACCGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGC > 2:338618‑M1/1‑202 (MQ=255) cGAAGCCTACCCATGGATCGATCTGGTGAAGCAGCGCAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACCGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACagcg > 2:789333/1‑207 (MQ=255) ccATGGATCGATCTGGTGAAGCAGCGCAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACCGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGGGCTGCGcc > 2:823785/1‑185 (MQ=255) 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cAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACCGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTgcagcgcatcga > 1:338621‑M2/1‑223 (MQ=255) aCGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACCGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGt > 1:22902/1‑221 (MQ=255) cGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACCGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCt < 2:295173/175‑1 (MQ=255) gCCTACGACCCGGAAGTGGAACCGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTgcagcgcatcgaacatc > 2:366117‑M2/1‑216 (MQ=255) 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cGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCTCAATACCGATGcc > 1:266964/1‑235 (MQ=255) ggACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCcaa > 2:724161/1‑173 (MQ=255) ggACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCcaa < 1:724164/173‑1 (MQ=255) ggACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCGGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGt < 1:538900/205‑1 (MQ=255) gACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATg < 2:328669/90‑1 (MQ=255) gACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATg > 1:328672/1‑90 (MQ=255) gACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTgcagc < 1:440255‑M2/102‑6 (MQ=255) gACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTgcagc > 2:440252‑M2/1‑97 (MQ=255) gCAGCCGATGTTCGACGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGcc < 2:123895/202‑1 (MQ=255) cAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATg > 2:738496/1‑199 (MQ=255) cAGCCGATGTTCGATGCGCGGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTgcagc > 2:371760‑M2/1‑89 (MQ=255) aGCGGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCGGGCCAGTTACCTGGTGGTAGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTgcagcgcatcgaacatcggctgcaacagtccagcggtattgaagttgaccaccatgacatccacaggt > 1:79880‑M2/1‑88 (MQ=255) ccGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGttgttg < 1:59614/174‑1 (MQ=255) cGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAAcc < 2:73429/165‑1 (MQ=255) gATGTTCGATGCGCTGCaccgagtcatcgcgcgaggcattgtcgaccaccaggtaactggccagccgctcgctgtcggcccggcgcagcgcatcgaacatcggctgcaacagtccagcggtattgaagttgaccaccatgacatccacaggtttgctagccatttcagctgtccccgaagaaatactgacgtctttgcgccatcagtaacggttccacttccgggtcgtaggc > 2:366117‑M1/1‑17 (MQ=255) tCGATGCGCTGCaccgagtcatcgcgcgaggcattgtcgaccaccaggtaactggccagccgctcgctgtcggcccggcgcagcgcatcgaacatcggctgcaacagtccagcggtattgaagttgaccaccatgacatccacaggtttgctagccatttcagctgtccccgaagaaatactgacgtctttgcgccatcagtaacggttccacttccgggtcgtaggcaccgttg > 1:338621‑M1/1‑12 (MQ=255) tCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGcc > 1:116951/1‑129 (MQ=255) cgctgcgcCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGgcccggc < 1:573802/168‑6 (MQ=255) cgctgcgcCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCTCAATACCGATGCCTTCGTTGCCGCCGACTCGCTGCaaaaa < 2:401363/233‑1 (MQ=255) gctgcgcCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCCCAATAc > 1:453189/1‑198 (MQ=255) gcTGCaccgagtcatcgcgcgaggcattgtcgaccaccaggtaactggccagccgctcgctgtcggcccggcgccgcgcatcgaacatcggctg > 2:371760‑M1/1‑5 (MQ=255) gcTGCaccgagtcatcgcgcgaggcattgtcgaccaccaggtaactggccagccgctcgctgtcggcccggcgcagcgcatcgaacatcggctgcaacagtccagcggtattgaagttgaccaccatgccatccacaggtttgctagccatttcagctgtccccgaagaaatactgacgactttgcgccatcagtaa > 2:286511‑M1/1‑5 (MQ=255) gcTGCaccgagtcatcgcgcgaggcattgtcgaccaccaggtaactggccagccgctcgctgtcggcccggcgcagcgcatcgaacatcggctgcaacagtccagcggtattgaagttgaccaccatgacatccacaggtttgctagccatttcagctgtccccgaagaaatactgacgtctttgcgccatcagtaacggttccacttccgggtcgtaggcaccgttgcgctg > 2:563625‑M1/1‑5 (MQ=255) gcTGCaccgagtcatcgcgcgaggcattgtcgaccaccaggtaactggccagccgctcgctgtcggcccggcgcagcgcatcgaacatcggctgcaacagtccagcggtattgaagttgaccaccatgacatcca > 1:739491‑M1/1‑5 (MQ=255) gcTGCaccgagtcatcgcgcgaggcattgtcgaccaccaggtaactggccagccgctcgctgtcggcccggcgcagcgcatcgaacatcggctgcaacagtccagcggtattgaagttgaccaccatgacatcca < 2:739488‑M1/135‑131 (MQ=255) gcTGCaccgagtcatcgcgcgaggcattgtcgaccaccaggtaactggccagccgctcgctgtcggcccggcgcagcgcatcgaacatcggctgcaacagtccagcggtattgaagttgaccaccatg > 2:65407‑M1/1‑5 (MQ=255) gcTGCaccgagtcatcgcgcgaggcattgtcgaccaccaggtaactggccagccgctcgctgtcggcccggcgcagcgcatcgaacatcggctgcaacagtccagcgg > 2:231622‑M1/1‑5 (MQ=255) gcTGCaccgagtcatcgcgcgaggcattgtcgaccaccaggtaactggccagccgctcgctgtcggcccggcgcagcgcatcgaacatcggctgcaacagtccagcgg < 1:231624‑M1/108‑104 (MQ=255) gcTGCaccgagtcatcgcgcgaggcattgtcgaccaccaggtaactggccagccgctcgctgtcggcccggcgcagcgcatcgaacatcggctgcaacagtc > 2:440252‑M1/1‑5 (MQ=255) gcTGCaccgagtcatcgcgcgaggcattgtcgaccaccaggtaactggccagccgctcgctgtcggcccggcgcagcgcatcgaacatcggctgcaacagtc < 1:440255‑M1/102‑98 (MQ=255) gcTGCaccgagtcatcgcgcgaggcattgtcgacc < 2:673821‑M1/35‑31 (MQ=255) gcTGCaccgagtcatcgcgcgaggcattgtcgacc > 1:673824‑M1/1‑5 (MQ=255) tgcgcCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTgcagcgcatcgaacatcggctgcaacagtccagcggtattgaagtt > 2:524816‑M2/1‑70 (MQ=255) gcgcCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCCACAAGCAGat > 2:118026/1‑122 (MQ=255) gcgcCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGcc < 2:529244/181‑1 (MQ=255) gCaccgagtcatcgcgcgaggcattgtcgaccaccaggtaactggccagccgctcgctgtcggcccggcgcagcgcatcgaacatcggctgcaaccgtccagcggtattgaagttga > 2:140111‑M1/1‑2 (MQ=255) | CCGAACAGTTGATCAAGCGGGTCGAGGCACGTTGCGAAGCCTACCCATGGATCGATCTGGTGAAGCAGCGCAACGGTGCCTACGACCCGGAAGTGGAACCGTTACTGATGGCGCAAAGACGTCAGTATTTCTTCGGGGACAGCTGAAATGGCTAGCAAACCTGTGGATGTCATGGTGGTCAACTTCAATACCGCTGGACTGTTGCAGCCGATGTTCGATGCGCTGCGCCGGGCCGACAGCGAGCGGCTGGCCAGTTACCTGGTGGTCGACAATGCCTCGCGCGATGACTCGGTGCAGCGCATGGCCCAGGTGTGCCCCGAGGCACTGCTGCTGAGCAACAAGCAGAACGTGGGTTTCGGCCGGGCCAACAACCAGTTGTTGGCGCACCTCAAGGGCAAGTATGCCTTGCTGCTCAATACCGATGCCTTCGTTGCCGCCGACTCGCTGCAAAAAA > AE015451/3550702‑3551155 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |