| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | AE015451 | = 4385743 | 60 (1.200) | 4 (0.080) | 4/318 | NT | 6.7% | coding (169/387 nt) | PP_3861 | Phage FluMu protein gp46 |
| ? | AE015451 | = 4385845 | 55 (1.170) | coding (67/387 nt) | PP_3861 | Phage FluMu protein gp46 | |||||
TCGGCATCTCATACGGCATTGATCAGACTCCAGGTATCTTCAAAAGCAAGCTTGAGGGTTTCACCGTTCAGCTCTGTCAGTAGCACCATCAGGTTGAGCCGGTCATTGCCCAAGCGCTCCGCCGTTACGGTAACGGTGGTAACAATCTCGTCATCGATCATCCAGCGCAGGGCCTCTTCGGCGTACTCCCGCGCATCGCGCAGGGTGTCATCGGTCAGCGCGCGGCGGTGCAGCAGCCACAGCCGTGAACCGATCTGATCGCCGGCCTCGCTCGGCGCACAGTCGCCCCACCACCCCTGCCGGTCGGCATCGTCCAAAGCATCGTCAGACGCCGCGCGCCGCCAGCTGAACAGGCTGATGGTCACTGCGCGGCGCAGCAGGGGTTCGCGGCTCATTCGCCACCCCCGACAGGAGGGCCGGACTGGCCTAGCCCCGACAGAACCTTGTCGTGGATGTG > AE015451/4385517‑4385973 | tCGGCATCTCATACGGCATTGATCAGACTCCAGGTATCTTCAAAAGCAAGCTTGAGGGTTTCACCGTTCAGCTCTGTCAGTAGCACCATCAGGTTGAGCCGGTCATTGCCCAAGCGCTCCGCCGTTACGGTAACGGTGGTAACAATCTCGTCATCGATCATCCAGCGCAGGGCCTCTTCGGCGTACTCCCGCGCATCGCGCAGGGTGTCATCGGTCAGCGCGCGGCGGTGcagcag < 1:475140/236‑1 (MQ=255) aCGGCATTGATCAGACTCCAGGTATCTTCAAAAGCAAGCTTGAGGGTTTCACCGTTCAGCTCTGTCAGTAGCACCATCAGGTTGAGCCGGTCATTGCCCAAGCGCTCCGCCGTTACGGTAACGGTGGTAACAATCTCGTCATCGATCATCCAGCGCAGGGCCTCTTCGGCGTACTCCCGCGCATCGCGCAGGGTGTCATCGGTCAGCGCGCGGCGGt < 1:799154/217‑1 (MQ=255) aTTGATCAGACTCCAGGTATCTTCAAAAGCAAGCTTGAGGGTTTCACCGTTCAGCTCTGTCAGTAGCACCATCAGGTTGAGCCGGTCATTGCCCAAGCGCTCCGCCGTTACGGTAACGGTGGTAACAATCTCGTCATCGATCATCCAGCGCAGGGCCTCTTCGGCGTACTCCCGCGCATCGCGCAGGGTGTCATCGGTCAGCGCGCGGCGGTGCAGCAGCCACAGCCGTGAACCg > 1:365462/1‑235 (MQ=255) tGATCAGACTCCAGGTATCTTCAAAAGCAAGCTTGAGGGTTTCACCGTTCAGCTCTGTCAGTAGCACCATCAGGTTGAGCCGGTCATTGCCCAAGCGCTCCGCCGTTACGGTAACGGTGGTAACAATCTCGTCATCGATCATCCAGCGCAGGGCCTCTTCGGCGTACTCCCGCGCATCGCGCAGGGTGTCATCGGTCAGCGCGCGGCGGTGCAGCAGCCACAGCCGTGCACCGAt > 1:256411/1‑235 (MQ=255) tGATCAGACTCCAGGTATCTTCAAAAGCAAGCTTGAGGGTTTCACCGTTCAGCTCTGTCAGTAGCACCATCAGGTTGAGCCGGTCATTGCCCAAGCGCTCCGCCGTTACGGTAACGGTGGTAACAATCTCGTCATCGATCATCCAGCGCAGGGCCTCTTCGGCGTACTCCCGCGCATCGCGCAGGGTGTCATCGGTCAGCGCGCGGCGGTGCAGCAGCCACAGCCGTGAACCGAt > 1:716170/1‑235 (MQ=255) aTCAGACTCCAGGTATCTTCAAAAGCAAGCTTGAGGGTTTCACCGTTCAGCTCTGTCAGTAGCACCATCAGGTTGAGCCGGTCATTGCCCAAGCGCTCCGCCGTTACGGTAACGGTGGTAACAATCTCGTCATCGATCATCCAGCGCAGGGCCTCTTCGGCGTACTCCCGCGCATCGCGCAGGGTGTCATCGGTCAGCGCGCGGCGGTGCAGCAGCCACAGCCGTGAACCGATCTg > 1:165981/1‑236 (MQ=255) cAGACTCCAGGTATCTTCAAAAGCAAGCTTGAGGGTTTCACCGTTCAGCTCTGTCAGTAGCACCATCAGGTTGAGCCGGTCATTGCCCAAGCGCTCCGCCGTTACGGTAACGGTGGTAACAATCTCGTCATCGATCATCCAGCGCAGGGCCTCTTCGGCGTACTCCCGCGCATCGCGCAGGGTGTCATCGGTCAGCGCGCGGCGGTGCAGCAGCCACAGCCGTGAACCGATCTGAt > 1:640760/1‑236 (MQ=255) cAGACTCCAGGTATCTTCAAAAGCAAGCTTGAGGGTTTCACCGTTCAGCTCTGTCAGTAGCACCATCAGGTTGAGCCGGTCATTGCCCAAGCGCTCCGCCGTTACGGTAACGGTGGTAACAATCTCGTCATCGATCATCCAGCGCAGGGCCTCTTCGGCGTACTCCCGCGCATCGCGCAGGGTGTCATCGGTCAGCCCGCGGCGGTGCAGCAGCCACAGCCGTGAAc > 1:460422/1‑227 (MQ=255) aGACTCCAGGTATCTTCAAAAGCAAGCTTGAGGGTTTCACCGTTCAGCTCTGTCAGTAGCACCATCAGGTTGAGCCGGTCATTGCCCAAGCGCTCCGCCGTTACGGTAACGGTGGTAACAATCTCGTCATCGATCATCCAGCGCAGGGCCTCTTCGGCGTACTCCCGCGCATCGCGCAGGGTGTCATCGGTCAGCGCGCGGCGGTGCAGCAGCCACAGCCGTGAACCGCTCTg > 1:679386/1‑233 (MQ=255) aGACTCCAGGTATCTTCAAAAGCAAGCTTGAGGGTTTCACCGTTCAGCTCTGTCAGTAGCACCATCAGGTTGAGCCGGTCATTGCCCAAGCGCTCCGCCGTTACGGTAACGGTGGTAACAATCTCGTCATCGATCATCCAGCGCAGGGCCTCTTCGGCGTACTCCCGCGCATCGCGCAGGGTGTCATCGGTCAGCGCGCGGCGGTGCAGCAGCCACAGCCGTGAACCGATCTGATc > 1:241528/1‑236 (MQ=255) ccAGGTATCTTCAAAAGCAAGCTTGAGGGTTTCACCGTTCAGCTCTGTCAGTAGCACCATCAGGTTGAGCCGGTCATTGCCCAAGCGCTCCGCCGTTACGGTAACGGTGGTAACACTCTCGTCATCGATCATCCAGCGCAGGGCCTCTTCGGCGTACTCCCGCGCATCGCGCAGGGTGTCATCGGTCAGCGCGCGGCGGTGCCGCCGCCCCACCCggg > 2:146827/1‑216 (MQ=255) ccAGGTATCTTCAAAAGCAAGCTTGAGGGTTTCACCGTTCAGCTCTGTCAGTAGCACCATCAGGTTGAGCCGGTCATTGCCCAAGCGCTCCGCCGTTACGGTAACGGTGGTAACAATCTCGTCATCGATCATCCAGCGCAGGGCCTCTTCGGCGTACTCCCGCGCATCGCGCAGGGTGTCATCGGTCAGCGCGCGGCGGTgca > 1:90173/1‑203 (MQ=255) 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ccGCGCATCGCGCAGGGTGTCATCGGTCAGCGCGCGGCGGTGCAGCAGCCACAGCCGTGAACCGATCTGATCGCCGGCCTCGCTCGGCGCACAGTCGCCCCACCACCCCTGCCGGTCGGCATCGTCCAAAGCATCGTCAGACGCCGCGCGCCGCCAGCTGAACAGGCTGATGGTCACTGCgcggcgtctga > 1:588159/1‑186 (MQ=255) ccGCGCATCGCGCAGGGTGTCATCGGTCAGCGCGCGGCGGTGCAGCAGCCACAGCCGTGAACCGATCTGATCGCCGGCCTCGCTCGGCGCACAGTCGCCCCACCACCCCTGCCGGTCGGCATCGTCCAAAGCATCGTCAGACGCCGCGCGCCGCCAGCTGAACAGGCTGATGGTCACTGCGCGGCGCAGCAGGGGTTCGCGGCTCATTCGCCACCCCCGACAGGAGGGCCGGAc > 2:785590/1‑234 (MQ=255) cgcgCATCGCGCAGGGTGTCATCGGTCAGCGCGCGGCGtctgacgatgctttggacgatgccgaccggcaggggtggtggggcgactgtgcgccgagcgaggccggcgatcagatcggttcacggctgtggctgctgcaccgccgcgcgctgaccgatgacaccctgcgcgatgcgcgggagtacgccgaagaggccctgcgctggatgatcgatgacgagattgttacca > 2:862514‑M1/1‑38 (MQ=255) cgcATCGCGCAGGGTGTCATCGGTCAGCGCGCGGCGGTGCAGCAGCCACAGCCGTGAACCGATCTGATCGCCGGCCTCGCTCGGCGCACAGTCGCCCCACCACCCCTGCCGGTCGGCATCGTCCAAAGCATCGTCAGACGCCGCGCGCCGCCAGCTGAACAGGCTGATGGTCACTGCGCGGCGCAGCAGGGGTTcgcc > 2:338150/1‑197 (MQ=255) aTCGCGCAGGGTGTCATCGGTCAGCGCGCGGCGGTGCAGCAGCCACAGCCGTGAACCGATCTGATCGCCGGCCTCGCTCGGCGCACAGTCGCCCCACCACCCCTGCCGGTCGGCATCGTCCAAAGCATCGTCAGACGCCGCGCGCCGCCAGCTGAACAGGCTGATGGTCACTGCGCGGCGCAGCAGGGGTTCGCGGCTCATTCGCCACCCCCGACAGGAGGGCCGGACTGGCCTa < 1:595846/235‑1 (MQ=255) cgcgCAGGGTGTCATCGGTCAGCGCGCGGCGtctgacgatgctttggacgatgccgaccggcagggggggtggggggactgtgcgccgg > 2:85742‑M1/1‑31 (MQ=255) cgcgCAGGGTGTCATCGGTCAGCGCGCGGCGGTGCAGCAGCCACAGCCGTGAACCGATCTGATCGCCGGCCTCGCTCGGCGCACAGTCGCCCCACCACCCCTGCCGGTCGGCATCGTCCAAAGCATCGTCAGACGCCGCGCGCCGCCAGCTGAACAGGCTGATGGTCACTGCGCGGCGCAGCAGGGGTTCGCGGCt > 1:130930/1‑196 (MQ=255) gcgcAGGGTGTCATCGGTCAGCGCGCGGCGGTGCAGCAGCCACAGCCGTGAACCGATCTGATCGCCGGCCTCGCTCGGCGCACAGTCGCCCCACCACCCCTGCCGGTCGGCATCGTCCAAAGCATCGTCAGACGCCGCGCGCCGCCAGCTGAACAGGCTGATGGTc < 2:664358/166‑1 (MQ=255) aGGGTGTCATCGGTCAGCGCGCGGCGGTGCAGCAGCCACAGCCGTGAACCGATCTGATCGCCGGCCTCGCTCGGCGCACAGTCGCCCCACCACCCCTGCCGGTCGGCATCGTCCAAAGCATCGTCAGACGCCGCGcgccgc > 2:201146/1‑141 (MQ=255) aGGGTGTCATCGGTCAGCGCGCGGCGGTGCAGCAGCCACAGCCGTGAACCGACCTGATCGCCGGCCTCGCTCGGCGCACAGTCGCCCCACCACCCCTGCCGGTCGGCATCGTCCAAAGCATCGTCAGACGCCGCGCGCCGCCAGCTGAACAGGCTGATGGTCACTGCGCGGCGCAGCAGGGGTTCGCGGCTCATTCGCCACCCCCGACaggag < 1:654194/213‑1 (MQ=255) aGCGCGCGGCGGTGCAGCAGCCACAGCCGTGAACCGATCTGATCGCCGGCCTCGCTCGGCGCACAGCCGCCCCACCACCCCTGCCGGTCGGCATCGTCCAAAGCATCGTCAGACGCCGCGCGCCGCCAGCTGaa > 1:548543/1‑134 (MQ=255) gcgcgGCGtctgacgatgctttggacgatgccgaccggcaggggtggtggggcgactgtgcgccgagcgaggccggcgatcagatcggttcacggctgtggctgctgcaccgccgcgcgctgaccgatgacaccctgcgcgatgcgcgggagtacgccgaagaggccctgcgctggatgatcgatgacgagattgttaccaccgttaccgtaacggcggagcgcttgggcaatgac > 1:620197‑M1/1‑8 (MQ=255) cgcgGCGGTGCAGCAGCCACAGCCGTGAACCGATCTGATCGCCGGCCTCGCTCGGCGCACAGTCGCCCCACCACCCCTGCCGGTCGGCATCGTCCAAAGCATCGTCAGACGCCGCGCGCCGCCAGCTGAACAGGCTGATGGTCACTGCGCGGCGCAGCAGGGGTTCGCGGCTCATTCGCCACCCCCGACAGGAGGGCCGGACTGGCCTAGCCCCGACAGAACCTTGTCGTGGAtgt > 1:151745/1‑236 (MQ=255) gcggcgGTGCAGCAGCCACAGCCGTGAACCGATCTGATCGCCGGCCTCGCTCGGCGCACAGTCGCCCCACCACCCCTGCCGGTCGGCATCGTCCAAAGCATCGTCAGACGCCGCGCGCCGCCAGCTGAACAGGCTGATGGTCACTGCGCGGCGCAGCAGGGGTTCGCGGCTCATTCGCCACCCCCGa > 2:704177/1‑187 (MQ=255) gcggcgGTGCAGCAGCCACAGCCGTGAACCGATCTGATCGCCGGCCCCGCTCGGCGCACAGTCGCCCCACCACCCCTGCCGGt > 2:111399/1‑83 (MQ=255) cggcgtctgacgatgctttggacgatgccgaccggcaggggtggtggggcgactgtgcgccgagcgaggccggcgatcagatcggttcacggctgtggctgctgcaccgccgcgcgctgaccgatgacaccctgcgcgatgcgcgggagtacgccgaagaggccctgcgctggatgatcgatgacga < 2:844131‑M1/187‑183 (MQ=255) cggcgtctgacgatgctttggacgatgccgaccggcaggggtggtggggcgactgtgcgccgagcgaggccggcgatcagatcggttcacggctgtggctgctgcaccgccgcgcgctgaccgatgacaccctgcgcgatgcgcgggagtacgccgaagaggccctgcgctggatgatcgatgacga < 2:939202‑M1/187‑183 (MQ=255) ggcgtctgacgatgctttggacgatgccgaccggcaggggtggtggggcgactgtgcgccgagcgaggccggcgatcagatcggttcacggctgtggctgctgcaccgccgcgcgctgaccgatgacaccctgcgcgatgcgcgggagtacgccgaagaggccctgcgctggatgatcgatgacgagattgttaccaccgttaccgtaacggcggagcgcttgggcaatgaccg > 2:337238‑M1/1‑4 (MQ=255) ggcggTGCAGCAGCCACAGCCGTGAACCGATCTGATCGCCGGCCTCGCTCGGCGCACAGTCGCCCCACCACCCCTGCCGGTCGGCATCGTCCAAAGCATCGTCAGACGCCGCGCGCCGCCAGCTGAACAGGCTGATGGTCACTGCGCGGCGCAGCAGGGGTTCGCGGCTCATTCGCCACCCCCGACAGGAGGGCCGGACTGGCCTAGCCCCGACAGAACCTTGTCGTGGAt < 2:321410/231‑1 (MQ=255) | TCGGCATCTCATACGGCATTGATCAGACTCCAGGTATCTTCAAAAGCAAGCTTGAGGGTTTCACCGTTCAGCTCTGTCAGTAGCACCATCAGGTTGAGCCGGTCATTGCCCAAGCGCTCCGCCGTTACGGTAACGGTGGTAACAATCTCGTCATCGATCATCCAGCGCAGGGCCTCTTCGGCGTACTCCCGCGCATCGCGCAGGGTGTCATCGGTCAGCGCGCGGCGGTGCAGCAGCCACAGCCGTGAACCGATCTGATCGCCGGCCTCGCTCGGCGCACAGTCGCCCCACCACCCCTGCCGGTCGGCATCGTCCAAAGCATCGTCAGACGCCGCGCGCCGCCAGCTGAACAGGCTGATGGTCACTGCGCGGCGCAGCAGGGGTTCGCGGCTCATTCGCCACCCCCGACAGGAGGGCCGGACTGGCCTAGCCCCGACAGAACCTTGTCGTGGATGTG > AE015451/4385517‑4385973 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |