| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 4399867 = | 78 (1.560) | 4 (0.080) | 4/322 | NT | 5.3% | coding (23/972 nt) | PP_3878 | putative Phage minor capsid protein C |
| ? | AE015451 | 4399923 = | 68 (1.430) | coding (1235/1272 nt) | PP_3879 | Phage portal protein, HK97 family | |||||
CATGGACGGGGATCACCTCCACACCCGTCTGGGCGATGGCGGCGCGGCGCTGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGCCACCCCCACTGCCGGCCAATTGCAT > AE015451/4399634‑4400091 | cATGGACGGGGATCACCTCCACACCCGTCTGGGCGATGGCGGCGCGGCGCTGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCa > 1:636021/1‑236 (MQ=255)cATGGACGGGGATCACCTCCACACCCGTCTGGGCGATGGCGGCGCGGCGCTGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCa > 1:459334/1‑236 (MQ=255) aCGGGGATCACCTCCACACCCGTCTGGGCGATGGTGGCGCGGCGCTGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAgcgc > 2:685746/1‑235 (MQ=255) acctctctggcctgctgcgcggcgaccagaaaagccgctacgacgcctatgcaattggccggcagtgggggtggctgtcgatcaacgacatccggcgcctggaaaacatgccgcccgttgccaacggcgacagttatctgcagccgctcaacatgaccgacgtagccaatgacctgcccgacatgactaaccccaacgtccgcgcccagctggaacagcag < 1:51960‑M1/4‑1 (MQ=255) tCCACACCCGTCTGGGCGATGGCGGCGCGGCGCTGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCaaa > 1:31663/1‑228 (MQ=255) tCTGGGCGATGGCGGCGCGGCGCTGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCaa > 1:379055/1‑236 (MQ=255) tCTGGGCGATGGCGGCGCGGCGCTGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCaa > 1:371750/1‑236 (MQ=255) gcTGGGCGATGGCGGCGCGGCGCTGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCa < 2:197463/234‑1 (MQ=255) ggCGATGGCGGCGCGGCGCTGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGc < 2:519443/234‑1 (MQ=255) gcgcggcgaccagaaaagccgctacgacgcctatgcaattggccggcagtgggggtggctgtcgatcaacgacatccggcgcctggaaaacatgccgcccgttgccaacggcgacagttatctgcagccgctcaacatgaccgacgtagccaatgacctgcccgacatgactaaccccaacgtccgcgcccagctggaacagca < 2:459331‑M1/3‑1 (MQ=255) gCGATGGCGGCGCGGCGCTGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATc > 1:442360/1‑236 (MQ=255) ggcggcGCGGCGCTGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTgg < 2:371263/197‑1 (MQ=255) ggcgcggcgcTGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAg > 1:928960/1‑233 (MQ=255) CGGCGCTGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAg < 2:846015‑M1/193‑1 (MQ=255) TGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGc > 2:670250‑M1/1‑215 (MQ=255) gcgATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATgtcg < 1:275580/219‑1 (MQ=255) cTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGgc < 1:71238/236‑1 (MQ=255) tCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCgg < 1:348148/236‑1 (MQ=255) cAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGa < 1:668705/236‑1 (MQ=255) cggcagtgggggtggctgtcgatcaacgacatccggcgcctggaaaacatgccgcccgttgccaacggcgacagttatctgcagccgctcaacatgaccgacgtagccaatgacctgcccgacatgactaaccccaacgtccgcgcccagctggaacagca < 1:490839‑M1/3‑1 (MQ=255) cggcagtgggggtggctgtcgatcaacgacatccggcgcctggaaaacatgccgcccgttgccaacggcgacagttatctgcagccgctcaacatgaccgacgtagccaatgacctgcccgacatgactaaccccaacgtccgcgcccagctggaacagca > 2:490836‑M1/159‑161 (MQ=255) ggcagtgggggtggctgtcgatcaacgacatccggcgcctggaaaacatgccgcccgttgccaacggcgacagttatctgcagccgctcaacatgaccgacgtagccaatgacctgcccgacatgactaaccccaacgtccgcgcccagctggaacaGCAgcgc > 2:912209‑M1/158‑164 (MQ=255) ggTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTcc > 2:919581/1‑217 (MQ=255) ggTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGtt > 2:566486/1‑234 (MQ=255) cagtgggggtggctgtcgatcaacgacatccggcgcctggaaaacatgccgcccgttgccaacggcgacagttatctgcagccgctcaacatgaccgacgtagccaatgacctgcccgacatgactaaccccaacgtccgcgcccagctggaacag < 1:552844‑M1/1‑1 (MQ=255) tCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGt < 2:442357/234‑1 (MQ=255) tCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTc < 1:685749/236‑1 (MQ=255) cATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAg < 2:786642/233‑1 (MQ=255) aTCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTGGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCa > 1:837711/1‑235 (MQ=255) aTCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATgtcg < 2:323789/192‑1 (MQ=255) ccaggctgagcaggatcgccgcgaagaacagcgccgcCCATGTTCAGATTGACGAGGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGtt < 2:38394‑M2/126‑1 (MQ=255) gTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTc < 1:91403/236‑1 (MQ=255) tCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCg > 1:404221/1‑236 (MQ=255) cATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGtcgtcgg > 2:554780/1‑190 (MQ=255) cATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCg < 1:566489/235‑1 (MQ=255) aTAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCg < 2:636018/234‑1 (MQ=255) tAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCg < 2:809355/233‑1 (MQ=255) cgacatccggcgcctggaaaacatgccgcccgttgccaacggcgacagttatctgcagccgctcaacatgaccgacgtagccaatgacctgcccgacatgactaaccccaacgtccgcgcccagctggaacaGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTcgcg > 1:598396‑M1/133‑184 (MQ=255) aTCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTgg > 1:43114/1‑200 (MQ=255) aTGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCAtt > 1:347871/1‑234 (MQ=255) 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tCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGCTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGTCTGCAGATAACTGTCTCCGTTGGCAACGggcg > 1:44452/1‑236 (MQ=255) ttCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCg < 2:123811/164‑1 (MQ=255) cgacgtagccaatgacctgcccgacatgactaaccccaacgtccgcgcccagctggaacaGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGggcggc < 1:76228‑M1/164‑1 (MQ=255) aCTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCCAGCTGGCAGCGCGCAAAt > 2:113482/1‑70 (MQ=255) gccaatgacctgcccgacatgactaaccccaacgtccgcgcccagctggaacaGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGa < 1:507255‑M1/183‑1 (MQ=255) ccAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGc < 2:459315/75‑1 (MQ=255) ccAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGc > 1:459318/1‑75 (MQ=255) ccAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCg > 1:545165/1‑235 (MQ=255) ggTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGcc > 2:613256/1‑216 (MQ=255) gtgtAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACg > 1:185759/1‑148 (MQ=255) gtgtAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAg > 2:826046/1‑210 (MQ=255) gtgtAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAg < 1:826049/210‑1 (MQ=255) gtgtAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGgcgc > 2:718419/1‑214 (MQ=255) gtgtAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGc > 1:64134/1‑235 (MQ=255) tCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGCCAcccc > 1:876107/1‑235 (MQ=255) tAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGCCACCCCCa < 2:824479/233‑1 (MQ=255) 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cGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTATCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGCCACCCCCACTGCCg > 1:523862/1‑236 (MQ=255) gCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGAc < 2:374636/217‑1 (MQ=255) ggTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCCAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTccg > 2:26652/1‑79 (MQ=255) ggTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCgg > 2:828702/1‑134 (MQ=255) ggTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGAGAGCCACCCCCACTGCCGGCCa > 1:503925/1‑235 (MQ=255) tGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCgctgct < 1:672237/71‑1 (MQ=255) tGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCgctgct > 2:672234/1‑71 (MQ=255) cccagctggaacaGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGCTCGACATCCACCCCCACTGc < 2:746779‑M1/212‑1 (MQ=255) aaCAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGATAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTc > 1:226340/1‑131 (MQ=255) aCAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGCCACCCCCACTGCCGGCCAATTGCAt < 1:140756/236‑1 (MQ=255) cAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACa < 1:679843/208‑1 (MQ=255) tGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACa < 2:765644/200‑1 (MQ=255) tGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACa > 1:765647/1‑200 (MQ=255) | CATGGACGGGGATCACCTCCACACCCGTCTGGGCGATGGCGGCGCGGCGCTGTTCTTCGCGGCGATCCTGCTCAGCCTGGTAGTCTTCATCGTCATAGAACATCGATGGATTGGCTGCAGCGCCGCCCATGTTCAGATTGACGATGTTCAGGCTCATGGTCTGGTTCGCCCAGCGCACTGCCAGGTCCAGCATGTCGGGTGTAGTCAGTAGCGGCTGGTTGAACAGCAAGCTGGCAGCGCGCAAATGTCGTTTCATGCGGCAAGCATCCTCAGGATGTCGTCGCGCTGCTGTTCCAGCTGGGCGCGGACGTTGGGGTTAGTCATGTCGGGCAGGTCATTGGCTACGTCGGTCATGTTGAGCGGCTGCAGATAACTGTCGCCGTTGGCAACGGGCGGCATGTTTTCCAGGCGCCGGATGTCGTTGATCGACAGCCACCCCCACTGCCGGCCAATTGCAT > AE015451/4399634‑4400091 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |