New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 4579332 | 51 (1.020) | 3 (0.060) | 3/318 | NT | 6.3% | coding (779/2211 nt) | glgB | 1,4‑alpha‑glucan branching enzyme |
? | AE015451 | = 4579374 | 42 (0.890) | coding (737/2211 nt) | glgB | 1,4‑alpha‑glucan branching enzyme |
TGAACGCGGCGAAATCTTCGGCACTGCCGTAGCGCGAGGTGGGTGCGAACATCGACAGTGGTTGATAGCCCCAGGAGCCGCCGAACGGGTGCTCCATGATCGGCAGCAGTTCGATGTGGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTGCGCCATCCAGTCATGGTCCTGCCAGGCGTGGCTGAGTTCACCGGCTACCTTGGATGCCGTGCTCGGCGGCAGCTCGGTGGCACGGGCCAGCGGGTCGGCCTTCAGCGGCAGTATGCCGTCCTTGCCGAGTACTTCGAACTTGTAGGTTTCGCCCACGCCCAGACGCGGAATGAA > AE015451/4579111‑4579567 | tGAACGCGGCGAAATCTTCGGCACTGCCGTAGCGCGAGGTGGGTGCGAACATCGACAGTGGTTGATAGCCCCAGGAGCCGCCGAACGGGTGCTCCATGATCGGCAGCAGTTCGATGTGGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCa > 2:420758/1‑234 (MQ=255) aCGCGGCGAAATCTTCGGCACTGCCGTAGCGCGAGGTGGGTGCGAACATCGACAGTGGTTGATAGCCCCAGGAGCCGCCGAACGGGTGCTCCATGATCGGCAGCAGTTCGATGTGGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCg < 1:420761/236‑1 (MQ=255) aaTCTTCGGCACTGCCGTAGCGCGAGGTGGGTGCGAACATCGACAGTGGTTGATAGCCCCAGGAGCCGCCGAACGGGTGCTCCATGATCGGCAGCAGTTCGATGTGGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGa > 1:568239/1‑235 (MQ=255) tAGCGCGAGGTGGGTGCGAACATCGACAGTGGTTGATAGCCCCAGGAGCCGCCGAACGGGTGCTCCATGATCGGCAGCAGTTCGATGTGGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGc > 2:568236‑M2/1‑235 (MQ=255) aGGCGGGTGCGAACATCGACAGTGGTTGATAGCCCCAGGAGCCGCCGAACGGGTGCTCCATGATCGGCAGCAGTTCGATGTGGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAAc < 2:654465/215‑1 (MQ=255) aaCATCGACAGTGGTTGATAGCCCCAGGAGCCGCCGAACGGGTGCTCCATGATCGGCAGCAGTTCGATGTGGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACg < 2:754705/205‑1 (MQ=255) cATCGACAGTGGTTGATAGCCCCAGGAGCCGCCGAACGGGTGCTCCATGATCGGCAGCAGTTCGATGTGGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGgcg < 1:475436/206‑1 (MQ=255) tCGACAGTGGTTGATAGCCCCAGGAGCCGCCGAACGGGTGCTCCATGATCGGCAGCAGTTCGATGTGGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGt < 2:325131/180‑1 (MQ=255) gACAGTGGTTGATAGCCCCAGGAGCCGCCGAACGGGTGCTCCATGATCGGCAGCAGTTCGATGTGGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTgcgc < 1:134069/233‑1 (MQ=255) cAGTGGTTGATAGCCCCAGGAGCCGCCGAACGGGTGCTCCATGATCGGCAGCAGTTCGATGTGGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCCGGGTGCAGCTCGTa > 2:755467/1‑186 (MQ=255) tGGTTGATAGCCCCAGGAGCCGCCGAACGGGTGCTCCATGATCGGCAGCAGTTCGATGTGGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCg < 1:436302/181‑1 (MQ=255) gATAGCCCCAGGAGCCGCCGAACGGGTGCTCCATGATCGGCAGCAGTTCGATGTGGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTGCGCCATCCAGTCATg > 1:56517/1‑235 (MQ=255) ccAGGAGCCGCCGAACGGGTGCTCCATGATCGGCAGCAGTTCGATGTGGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTggg < 2:683667/160‑1 (MQ=255) gccgccGAACGGGTGCTCCATGATCGGCAGCAGTTCGCTGTGGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCt > 2:139169/1‑161 (MQ=255) cgAACGGGTGCTCCATGATCGGCAGCAGTTCGATGTGGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGGAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCGGGgcg > 1:137245/1‑197 (MQ=255) tCCATGATCGGCAGCAGTTCGATGTGGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTGCGCCATCCAGTCATGGTCCTGCCAGGCGTGGCTGAGTTCACCgg > 1:291893/1‑235 (MQ=255) cATGAGCGGCAGCAGTTCGATGTGGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATGGGGCCCCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCt < 2:134005/143‑1 (MQ=255) gcagcaGTTCGATGTGGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGcctacaacgcgccgttgtcgatctacgagctgcacccaggatcatggcgc > 1:398174‑M1/1‑120 (MQ=255) gcagcaGTTCGATGTGGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGcctacaacgcgccgttgtcgatctacgagctgcacccaggatcatggcgc < 2:398171‑M1/170‑51 (MQ=255) gcagTTCGATGTGGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAAc < 2:812692/146‑1 (MQ=255) gcagTTCGATGTGGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAAc > 1:812695/1‑146 (MQ=255) agTTCGATGTGGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTgcgc < 2:766146/179‑1 (MQ=255) agTTCGATGTGGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTgcgc > 1:766149/1‑179 (MQ=255) gATGTGGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTGCGCCATCCAGTCATGGTCCTGCCAGGCGTGGCTGAGtt < 2:818594/209‑1 (MQ=255) tgtgGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTGCGCCATCCAGTCATGGTCCTGCCAGGCGTGGCTGAGTTCa > 2:445101/1‑209 (MQ=255) ccTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTGCGCCATCCAGTCATGGTCCTGCCAGGCGGGGCTGAGTTCACCGGCTACCTTg > 2:183592/1‑203 (MQ=255) caTAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTGCGCCa > 2:820497/1‑150 (MQ=255) caTAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTGCGCCATCCAGTCATGGTCCTGCCAGGCGTGGCTGAGTTCACCGGCTACCTTGGATGCCGTGCTCGGCGGCAGCTCGGTGGCACGGGCCa > 1:435181/1‑234 (MQ=255) ccGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTGCGCCATCCAGTCATGGTCCTGCCAGGCGTGGCTGAGTTCACCGGCTACCTTGGATGCCGTGCTCGGCGGCAGCTCGGTGGCACGGGCCAGCGGGTCGGCCTTc > 1:602817/1‑235 (MQ=255) cGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTGCGCCATCCAGTCATGGTCCTGCCAGGCGTGGCTGAGTTCAcc < 2:291890/173‑1 (MQ=255) gcccGGCCAGCTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGCTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTGCGCCATCCAGTCATGGTCCTg > 2:91132/4‑151 (MQ=255) cGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTgg < 1:836312/73‑1 (MQ=255) cGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTgg > 2:836309/1‑73 (MQ=255) cGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTGCGCCATCCAGTCAt < 2:873886/141‑1 (MQ=255) cGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTGCGCCATCCAGTCAt > 1:873889/1‑141 (MQ=255) cGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTGCGCCATCCAGTCATGGTCCTGCCAGGCGTGGCTGAGTTCACCGGCTACCTTGGATGCCGTGCTCGGCGGCAGCTCGGTg > 1:492175/1‑206 (MQ=255) cGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTAGGCGCGTTGCGCCATCCAGTCATGGTCCTGCCAGGCGGGGCTGAGTTCACCGGCTACCTTGGCTGc > 2:235953/1‑184 (MQ=255) cGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGAGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTGCGCCATCCAGTCATGGTCCTGCCAGGCGTGGCTGAGTTCACCGGCTACCTTgg > 2:825938/1‑180 (MQ=255) ccAGTTCCCGCCAATGGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTGCGCCATCCAGTCATGGTCCTGCCAGGCGTGGCTGAGTTCACCGGCTACCTTGGATGCCGTGCTCGGCGGCAGCTCGGTg < 2:463668/203‑1 (MQ=255) cAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTGCGCCATCCAGTCATGGTCCTGCCAGGCGTGGCTGAGTTCACCGGCTACCTTGGATGCCGTGCTCGGCGGCAGCTCGGTGGCACGGGCCAGCGGGTCGGCCTTCAGCGGCAGTa < 1:838923/236‑1 (MQ=255) ccAACTGTAGAAACGCCCGATTCCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCGCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGtt < 2:213607/113‑1 (MQ=255) aaTTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTGCGCCATCCAGTCATGGTCCTGCCAGGCGTGGCTGAGTTCACCGGCTACCTTGGATGCCGTGCTCGGCGGCAGCTCGGTGGCACGGGCCAGCGGGTCGGCCTTCAGCGGCAGTATGCCGTCCTTg > 1:783610/1‑236 (MQ=255) aaTGGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGTTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACg < 2:44661/81‑1 (MQ=255) aTTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGAGCGACAACGGCGCGTTGTAGGcatggcgctgcgagctggacgaagcgggggaaatcgggcgtttcta > 1:808797‑M2/1‑92 (MQ=255) tAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGcctacaacgcgccgttgtcgctctacgagctgcacccaggatcatggcgctgcgagctggacgaagcgggggaaatcgggcgtttctacaat > 1:808797‑M1/1‑46 (MQ=255) tAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTGCGCCATCCAGTCATGGTCCTGCCAGGCGTGGCTGAGTTCACCGGCTACCTTGGATGCCGTGCTCGGCGGCAGCTCGGTGGCACGGGCCAGCGGGTCGGCCTTCAGCGGCAGTATGCCGTcc > 1:50271/1‑228 (MQ=255) 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gcccAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACACCGGCGCGTTGTGGGCATGGCGCTGGGCGCGTTGCGCCATCCAGTCATGGTCCTGCCAGGCGTGGCTGAGTTCACCGGCTACCTTGGATGCCGTGCTcggcgg < 2:934559/148‑1 (MQ=255) ccAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTGCGCCATCCAGTCATGGTCCTGCCAGGCGTGGCTGAGTTCACCGGCTACCTTGGATGCCGTGCTCGGCGGCAGCTCGGTGGCACGGGCCAGCGGGTCGGCCTTCAGCGGCAGTATGCCGTCCTTGCCGAGTACTTCGAACTTGTAGGTTTcgcccacg > 1:574044/1‑236 (MQ=255) aGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTGCGCCATCCAGTCATGGTCCTGCCAGGCGTGGCTGAGTTCACCGGCTACCTTGGATGCCGTGCTCGGCGGCAGCGCGGTGGCACgg > 1:226509/1‑162 (MQ=255) cTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTGCGCCATCCAGTCATGGTCCTGCCAGGCGTGGCTGAGTTCACCGGCTACCTTGGATGCCGTGCTCGGCGGCAGCTCGGTGGCACGGGCCAGCGGGTCGGCCTTCAGCGGCAGTATGCCGTCCTTGCCGAGTACTTCGAACTTGTAGGTTTcgcccacgccca < 1:327011/236‑1 (MQ=255) gCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTGCGCCATCCAGTCATGGTCCTGCCAGGCGTGGCTGAGTTCACCGGCTACCTTGGATGCCGTGCTCGGCGGCAGCTCGGTGGCACGGGCCAGCGGGTCGGCCTTCAGCGGCAGTATGCCGTCCTTGCCGAGTACTTCGAACTTGTAGGTTTCGCCCACGCCCAGa > 1:657302/1‑235 (MQ=255) aGCGCCATGATCCGGGGTGCAGCTCg < 2:41525/26‑1 (MQ=255) gcgcCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGcatggcgctgcgagctggacgaagcgggggaaatcgggcgtttctacaattggcgggaactggccgagcggctggtgccctatgtgcaggagctgggctttacccacatcgaactgctgc > 1:398174‑M2/1‑50 (MQ=255) gcgcCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGcatggcgctgcgagctggacgaagcgggggaaatcgggcgtttctacaattggcgggaactggccgagcggctggtgccctatgtgcaggagctgggctttacccacatcgaactgctgc < 2:398171‑M2/170‑121 (MQ=255) gcctacaacgcgccgttgtcgatctacgagctgcacccaggatcatggcgctgcgagctggacgaagcgggggaaatcgggcgtttctacaattggcgggaactggccgagcggctggtgccctatgtgcaggagctgggctttacccacatcgaactgctgccgatcatggagcacccgttcggcggctcctggggctatcaaccactgtcgatgttcgcacccacctcgcgcta > 2:568236‑M1/1‑1 (MQ=255) | TGAACGCGGCGAAATCTTCGGCACTGCCGTAGCGCGAGGTGGGTGCGAACATCGACAGTGGTTGATAGCCCCAGGAGCCGCCGAACGGGTGCTCCATGATCGGCAGCAGTTCGATGTGGGTAAAGCCCAGCTCCTGCACATAGGGCACCAGCCGCTCGGCCAGTTCCCGCCAATTGTAGAAACGCCCGATTTCCCCCGCTTCGTCCAGCTCGCAGCGCCATGATCCTGGGTGCAGCTCGTAGATCGACAACGGCGCGTTGTAGGCATGGCGCTGGGCGCGTTGCGCCATCCAGTCATGGTCCTGCCAGGCGTGGCTGAGTTCACCGGCTACCTTGGATGCCGTGCTCGGCGGCAGCTCGGTGGCACGGGCCAGCGGGTCGGCCTTCAGCGGCAGTATGCCGTCCTTGCCGAGTACTTCGAACTTGTAGGTTTCGCCCACGCCCAGACGCGGAATGAA > AE015451/4579111‑4579567 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |