New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 729633 = | 48 (0.960) | 3 (0.060) | 3/318 | NT | 7.1% | coding (163/741 nt) | yfiH | Uncharacterized protein YfiH |
? | AE015451 | 729840 = | 33 (0.700) | coding (370/741 nt) | yfiH | Uncharacterized protein YfiH |
CCTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGGTGTGGTTGGGGCCTGCCATCGGCCCGCAAGCATTCGAAGTGGGGCTGGAAGTGCGTGATGCCTTTACCGCCGTGCACCCGCAAGCAGCTCGGGCATTCGTCGACGGCGAACGGCCAGGCAAGCTGTTGGCGGATATCTATGAGCT > AE015451/729612‑730066 | ccTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGgcgc > 1:618860/1‑229 (MQ=255) tCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGt < 1:922289/212‑1 (MQ=255) aTCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGc > 1:72207/1‑235 (MQ=255) gCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCag < 1:803577/236‑1 (MQ=255) aGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGt > 1:336527/1‑190 (MQ=255) cATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCACCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGt > 1:135751/1‑185 (MQ=255) tggCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTggctggcgggggctggcggggg > 1:203018/1‑166 (MQ=255) cgacccgaccGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGGTGTGGTTGGGGCCTGCCATCGGcc > 1:451552/1‑236 (MQ=255) cgaccGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCACGCGGGTGCCCGCGCGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGc > 1:280344/1‑155 (MQ=255) gtggCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCATTGCCTGCCTCGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGTGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGGTGTGGTTGGGGCCTGCCATCGGCCCGCAAGCATTCGa < 1:885143/236‑1 (MQ=255) gccgaggccgaTGCCAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGGTGTGGTTGGGGCCTGCCATCGGCCCGCAAGCATTCGAAg < 1:612121/235‑1 (MQ=255) ggccgaTGCCAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGGTGTGGTTGGGGCCTGCCATCGGCCCGCAAGCATTCGAAGTgggg > 1:7188/1‑235 (MQ=255) aTGCCAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCACGCGGGTGCCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCAc > 2:794356/1‑148 (MQ=255) ccAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGGTGTGGtt > 2:494611/1‑190 (MQ=255) ccAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGGTGTGGtt < 1:494614/190‑1 (MQ=255) ggccccGCCAGCCTGGCATTGCCTGCCCCGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGgc < 1:249085/151‑1 (MQ=255) ggACCCGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGGTGTGGTTGGGGCCTGCCATCGGCCCGCAAGCATTCGAAGTGGGGCTGGAAGTGCGTGa > 1:814377/1‑235 (MQ=255) gccccGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGTGATGCCCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGGTGTGGTTGGGGCCTGCCATCGGCCCGCAAGCATTCGa < 1:111547/211‑1 (MQ=255) gccccGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTgccgcc < 1:92766/160‑1 (MQ=255) cccGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCACGCGGGTGCCCGCGCGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAagag < 2:280341/167‑1 (MQ=255) cGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGGTGTGGTTGGGGCCTGCCATCGGCCCGCAAGCATTCGAAGTGGGGCTGGAAGTGCGt < 1:772281/228‑1 (MQ=255) cGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGGTGTGGTTGGGGCCTGCCATCGGCCCGCAAGCATTCGAAGTGGGGCTGGAAGTGCGt < 1:829160/228‑1 (MQ=255) cAGCCTGGCATTGCCTGCGCCGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGGTGTGGTTGGGGCCTGCCATCg < 1:309576/190‑1 (MQ=255) ggCATTGCCTGCACCGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGGGGc > 2:308094/1‑111 (MQ=255) ggcatccgccaccacccgcccatgcacctgcttgagccaggccggttggatggtgaactgttcgctcaggcggcggcgCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTgc > 2:456738‑M2/79‑142 (MQ=255) ggcatccgccaccacccgcccatgcacctgcttgagccaggccggttggatggtgaactgttcgctcaggcggcggcgCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTgc < 1:456741‑M2/64‑1 (MQ=255) gCCTGCACCGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGGTGTGGTTGGGGCCTGCCATCGGCCCGCAAGCATTCGa < 1:236516/194‑1 (MQ=255) tGCACCGTGATGACCGCCGATGGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGGTGTGGTTGGGGCCTGCCATCGGCCCGCAAGCATTCGAAGTGGGGCTGGAAGTGCGTGATGCCt < 1:510160/217‑1 (MQ=255) aCCGTGTGGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGGTGTGGTTGGGGCCTGCCATCGGCCCGCAAGCATTCGAAGTGGGGCTGGAAGTGCGt < 1:257583/207‑1 (MQ=255) cGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTgg > 2:203538/1‑84 (MQ=255) gcccatgcacctgcttgagccaggccggttggatggtgaactgttcgctcaggcggcggcgCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGgcggggg > 2:186661‑M2/62‑87 (MQ=255) gaCCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAagag > 2:403810/1‑136 (MQ=255) cgccgATTGCCTGCCTGCGCTGTGCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGGTGTGGTTGGGGCCTGCCATCGGCCCGCAAGCATTCGAAGTGGGGCTGGAAGTGCGTGATGCCTTTAccgcc < 1:267422/211‑1 (MQ=255) ttGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGGGGc > 2:264991/1‑82 (MQ=255) tGCGACCGCCCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGGTGTGGTTGGGGCCTGc < 2:520648/131‑1 (MQ=255) cgcgcgGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGGTGTGGTTGGGGCCTGCCATCGGCCCGCAAGCATTCGAAGTGGGGCTGGAAGTGCGTGATGCCTTTACCGCCGTGCACCCGCAAGCAGCTCGGGCATTCGTCGACGGCGAACGGCCAGGCAAGCTGtt < 1:409199/236‑1 (MQ=255) ccGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGGTGTGGTTGGGGCCTGCCATCGGCCCGCAAGCATTCGAAGTGGGGCTGGAAGTGCGTGATGc < 1:185895/159‑1 (MQ=255) gcgcggcggcggcgCATGCTGGCTGGCGTGGGGTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGgtgt < 1:688250‑M2/85‑1 (MQ=255) tcaggcggcggcgCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGGTGTGGTTGGGGCCTGCCATCGGCCCGCAAGCATTCGAAGTGGGGCTGGAAGTGCGTGATGCCTTTACCGCCGTGCACCCGCAAGCAGCTCGGGCATTCGTCGACGGCGAACGGCCAGGCAAGCTGTTGGcggg > 1:74369‑M2/14‑227 (MQ=255) tgggggcggcgCATGGTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAGGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGGTGTGGTTGGGGCCTGCCATCGGCCCGCAAGCATTCGAAGTGGGGCTGGAAGTGCGTGa < 2:300608‑M2/140‑1 (MQ=255) gcggcggcgCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGGTGTGGTTGGGGCCTGCCATCGGCCCGCAAGCATTCGAAGTGGGGCTGGAAGTGCGTGATGCCTTTACCGCCGTGCACCCGCAAGCAGCTCGGGCATTCGTCGACGGCGAACGGCCAGGCAAGCTGTTGGCg > 1:665641‑M2/10‑222 (MQ=255) gcggcggcgCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGGTGTGGTTGGGGCCTGCCATCGGCCCGCAAGCATTCGAAGTGGGGCTGGAAGTGCGTGATGCCTTTACCGCCGTGCACCCGCAAGCAGCTCGGGCATTCGTCGACGGCGAACGGCCAGGCAAGCTGTTGGCg < 2:665638‑M2/213‑1 (MQ=255) gcggcggcgCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGGTGTGGTTGGGGCCTGCCATCGGCCCGCAAGCATTCGAAGTGGGGCTGGAAGTGCGTGATGCCTTTACCGCCGTGCACCCGCAAGCAGCTCGGGCATTCGTCGACGGCGAACGGCCAGGCAAGCTGTTGGCGGATATCTATGAGCt < 1:361692‑M2/227‑1 (MQ=255) cggcggcgCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGGTGTGGTTGGGGCCTGCCATCGGCCCGCAAGCATTCGATGTGGGGCTGGAAGTGCGTGATGCCTTTACCGCCGTGCACCCGCAAGCAGCTCGGGCAt > 2:534291‑M2/9‑186 (MQ=255) gcgCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGGAGAGGTGCTGGTGTGGTTGGGGCCTGCCATCGGCCCGCAAGCATTCGAAGTGGGGCTGGAAGTGCGTGATGCCTTTAccgccg > 2:599626‑M2/4‑157 (MQ=255) | CCTGCCGCGGTCGCCGAGAACCGCCGCCGCCTGAGCGAACAGTTCACCATCCAACCGGCCTGGCTCAAGCAGGTGCATGGGCGGGTGGTGGCGGATGCCGACCCGACCGTGGTGGCCGAGGCCGATGCCAGCTGGACCCGCCAGCCTGGCATTGCCTGCACCGTGATGACCGCCGATTGCCTGCCTGCGCTGTTCTGCGACCGCGCGGGCACCCGCGTGGCGGCGGCGCATGCTGGCTGGCGTGGGCTGGCGGGTGGCGTGCTGGAAGCCACGCTGGACCGGCTGGCGCTGCCGCCAGAAGAGGTGCTGGTGTGGTTGGGGCCTGCCATCGGCCCGCAAGCATTCGAAGTGGGGCTGGAAGTGCGTGATGCCTTTACCGCCGTGCACCCGCAAGCAGCTCGGGCATTCGTCGACGGCGAACGGCCAGGCAAGCTGTTGGCGGATATCTATGAGCT > AE015451/729612‑730066 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |