New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 967850 = | 37 (0.740) | 6 (0.130) | 6/308 | NT | 17.5% | intergenic (‑29/+139) | PP_0830/PP_0831 | Acetyltransferase, GNAT family/hypothetical protein |
? | AE015451 | 967941 = | 23 (0.500) | intergenic (‑120/+48) | PP_0830/PP_0831 | Acetyltransferase, GNAT family/hypothetical protein |
TGGCTTTGGGGAACATGTAGAACAGTTCGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCTTGTCGATTTCGCTGAACGACATGAACACGCTGATACGGTCCTTGCCGACCAGGTCCGGGCGCTTGCCCGCATTGATCTCGTC > AE015451/967722‑968168 | tGGCTTTGGGGAACATGTAGAACAGTTCGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATa > 1:754541/1‑236 (MQ=255) ggggAACATGTAGAACAGTTCGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCg > 2:566803/1‑234 (MQ=255) cAGTTCGCCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTtcc < 1:135940/225‑1 (MQ=255) cGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGc > 2:61662/1‑198 (MQ=255) cGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCAcat > 1:858342/1‑205 (MQ=255) gTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGccc > 1:761466/1‑235 (MQ=255) gTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCG‑CCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTca > 1:591066/1‑200 (MQ=255) aTAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTgg > 1:78403/1‑225 (MQ=255) aaCGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTggcggc < 1:267130/227‑1 (MQ=255) cGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCa < 2:813010/233‑1 (MQ=255) cttctGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGCACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATACGCCGCTTTCCATCCAACACCTCGCCCCGATTCCCGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTgt > 1:784808/1‑235 (MQ=255) tctGGCGGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGc < 1:261184/174‑1 (MQ=255) agcggggcgcggtgttggatggaaagcggcctatgatgtgaggctgatggcctcgtcgcgggtaaccccgctacagggcctgcacaggatttgtgccttgtgcagtacctgtgggggcgggtccacccgcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCttt < 1:401726‑M2/26‑1 (MQ=255) aaagcggcctatgatgtgaggctgatGGCCTCTTCGCGGGTGGACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCACAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGGTTACCCGCGACGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCccgct < 1:401726‑M1/139‑3 (MQ=255) cTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGAt > 2:731066/1‑159 (MQ=255) cTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCcagca > 2:874601/1‑233 (MQ=255) ctcGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGGTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACCTCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGa > 2:194347/1‑155 (MQ=255) gcgTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCGGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGa < 1:66311/235‑1 (MQ=255) GGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGcc > 2:428543‑M1/1‑209 (MQ=255) CCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAgccttttac < 2:921723‑M1/173‑4 (MQ=255) CTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGATTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTACCCTTTGACCGCAGcc < 1:515059‑M1/177‑1 (MQ=255) CGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCTTGTc < 1:325513‑M1/233‑1 (MQ=255) ccgctacagggcctgcacaggatttgagccttgtgcagtacctgtgggggcgggttcacccgcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGc > 2:680959‑M2/73‑168 (MQ=255) ccgctacagggcctgcacaggatttgagccttgtgcagtacctgtgggggcgggttcacccgcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGc < 1:680962‑M2/96‑1 (MQ=255) tgcacaggatttgagccttgtgcagtacctgtgggggcgggttcacccgcgaagaggccATCAGCCTCAcatc < 2:606232‑M2/14‑1 (MQ=255) tgcacaggatttgagccttgtgcagtacctgtgggggcgggttcacccgcgaagaggccATCAGCCTCAcatc > 1:606235‑M2/60‑73 (MQ=255) gatttgagccttgtgcagtacctgtggtggcgggttcacccgcgaagaggccAGCAGCCTCACATCATAGGCCCCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGcc < 2:562070‑M2/64‑1 (MQ=255) aaGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGGCGTCAGCCTCACATCAGAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGccgc > 2:638653/1‑94 (MQ=39) aaGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCTTGTCGATTTCGCTGAACGACATGAACACGCTGATACGGt > 1:708381/1‑236 (MQ=255) cTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCAACCGCCACGTAGACTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTTGCCCTGTGCGCCAGCAGGTACTGCTa > 1:30037/1‑179 (MQ=255) tCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCTTGTCGATTTCGCTGAACGACATGAACACGCTGATACGGTCCTTg > 1:715745/1‑236 (MQ=255) gCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCTTGTCGATTTCGCTGAACGACATGAACACGCTGATACGGTCCTTGCCGACCAGGTc > 1:461325/1‑236 (MQ=255) cTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAg > 2:772755/1‑117 (MQ=255) cTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAg < 1:772758/117‑1 (MQ=255) tcacccgcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCTTGTCGATTTCGCTGAACGACATGAACACGCTGATACGGTCCTTGCCGACCAGGTCCGGGCGCTTGCCCGc > 2:722363‑M2/18‑233 (MQ=255) tACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCCGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGCTAGCGTCGCCATGccc > 2:217974/1‑161 (MQ=255) tACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCTTGTCGATTTCGCTGAACGACATGAACACGCTGATACGGTCCCTGCCGACCAGGTCCGGGCGCtt > 1:113095/1‑226 (MQ=255) acccgcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCTTGTCGATTTCGCTGAACGACATGAACACGCt < 2:761463‑M2/177‑1 (MQ=255) cgcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCTTGTCGATTTCGCTGAACGACATGAACACGCTGATACGGTCCTTGCCGACCAGGTCCGGGCGCTTGCCCGCATTGAtct > 1:193367‑M2/13‑236 (MQ=255) gcgaagaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCTTGTCGATTTCGCTGAACGACATGAACACGCTGATACGGTCCTTGCCGACCAGGTCCGGGCGCTTGCCCGCATTGAtctc < 1:722366‑M2/225‑1 (MQ=255) agaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTtgt > 1:452797‑M2/8‑120 (MQ=255) agaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTtgt < 2:452794‑M2/113‑1 (MQ=255) agaggccATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCTTGTCGATTTCGCTGAACGACATGAACACGCTGATACGGTCCTTGCCGACCAGGTCCGGGCGcttgcccgcatctgtctctta > 1:224771‑M2/8‑225 (MQ=255) | TGGCTTTGGGGAACATGTAGAACAGTTCGTCCGGGCTCTGCGGGAAGCTGCAGATAACGGGGATGTCTTCTGGCCGGATGGGGCGGTGGGTCAGGTGCATGGCAGGTCCTTCTCGCGTTGGCTGGCAGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCCCCCACAGGTACTGCACAAGGCTCAAATCCTGTGCAGGCCCTGTAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAGCCTCACATCATAGGCCGCTTTCCATCCAACACCGCGCCCCGATTCACGGTTTGGCGGCCACCGCCACGTAGCCTTTGACCGCAGCCGGTGCCTTGGGCTTGGCCTTGTGCGCCAGCAGGTACTGATAGCGTCGCCATTCCTTGTCGATTTCGCTGAACGACATGAACACGCTGATACGGTCCTTGCCGACCAGGTCCGGGCGCTTGCCCGCATTGATCTCGTC > AE015451/967722‑968168 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |