New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 1167535 | 35 (0.700) | 6 (0.130) | 5/322 | NT | 14.6% | coding (479/729 nt) | pgl | 6‑phosphogluconolactonase |
? | AE015451 | = 1167560 | 37 (0.780) | coding (504/729 nt) | pgl | 6‑phosphogluconolactonase |
GTCACCTGTTGAAGGGCGAAGCGGCCAAGGCCCGTTTCGTTGGCCTGTACCAGCAGGCGGAGAACCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATCGCGCTGTCTGTGCAAGGCCAGGGCAAACTCGCTACCCTGCGCGCCGCGCTGGCGGGCAACGACCTTACTGAAATGCCGATTCGCGCTTTTCTTCACGACCCCC > AE015451/1167358‑1167762 | ggcACCTGTTGAAGGGCGAAGCGGCCAAGGCCCGTTTCGTTGGCCTGTACCAGCAGGCGGAGAACCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCAcg < 2:913354/215‑1 (MQ=255) cGAAGCGGCCAAGGCCCGTTTCGTTGGCCTGTACCAGCAGGCGGAGAACCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACctgg < 2:650552‑M2/191‑5 (MQ=255) aaGCGGCCAAGGCCCGTTTCGTTGGCCTGTACCAGCAGGCGGAGAACCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCCCGCCCCGGCCTGCCg > 2:220016/1‑212 (MQ=255) aGGCCCGTTTCGTTGGCCTGTACCAGCAGGCGGAGAACCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGgcgc > 2:428636/1‑213 (MQ=255) cGTTGGCCTGTACCAGCAGGCGGAGAACCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCAcgccg > 1:316826/1‑183 (MQ=255) tACCAGCAGGCGGAGAACCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCAcgcc > 2:413177/1‑172 (MQ=255) cagcagGCGGAGAACCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTCTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACctcgcgg < 2:163988‑M2/160‑8 (MQ=255) gCGGAGAACCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGAccc < 1:428639/217‑1 (MQ=255) cGGAGAACCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAg > 2:319781/1‑187 (MQ=255) agaACCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGAcc > 1:396425/1‑212 (MQ=255) agaACCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAg > 2:515158/1‑229 (MQ=255) agaACCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAg < 1:515161/229‑1 (MQ=255) agaACCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGc > 1:604897/1‑235 (MQ=255) tGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACctggc < 2:273144‑M2/138‑6 (MQ=255) aGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGc > 2:7638/1‑172 (MQ=255) tCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCAc < 1:394579/173‑1 (MQ=255) ggCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCa > 2:807914/1‑206 (MQ=255) ccTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATCGCGCTGTCTGTGCAAGGCCAGGGCAAACTc < 1:478086/236‑1 (MQ=255) cGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACctggcggggaacagcgaggcggtatggccatcgtcgccc < 1:753325‑M2/139‑40 (MQ=255) tcccgccgATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAgcgc < 2:428730/182‑1 (MQ=255) tACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGTAGCAGGCCTGGACctggcggg < 1:756641‑M2/103‑9 (MQ=255) tACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACctggcggg > 2:756638‑M2/1‑95 (MQ=255) aCCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTTCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATCGCGCTGTCTGTGCAAGGCCAGGGCAAACTCGCTACCCTgcgcg > 1:48562/1‑236 (MQ=255) aCGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATCGCGCTGTCTGTGCAAGGCCAg < 2:443088/203‑1 (MQ=255) tgctggtgctggGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGcc > 2:284271/1‑138 (MQ=255) gctggtgctggGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGAt < 2:559905/144‑1 (MQ=255) gtgctggGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCgctgc < 2:887172/154‑1 (MQ=255) aTGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCCCGCCGctgcctgc > 2:133591/1‑91 (MQ=255) ccgacgctGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACctggcggggaacagcgaggcggtatggcc > 2:753322‑M2/2‑62 (MQ=255) acgaTGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATCGCGCTGTCTGTGCAAGGCCAGGGCAAACTCGCTACCCTGCGCGCCGCGCTGGCGGGCAACGACCTTACTGAAATGcc < 1:635431/235‑1 (MQ=255) gaTGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATCGCGCTGTCTGTGCAAGGCCAGGGCAAACTCGCTACCCTGcgcgcc < 1:319784/201‑1 (MQ=255) aCCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATCGCGCTGTCTGTGCAAGGCCAGGGCAAACTCGCTACCCTGCGCGCCGCGCTGGCGGGCaa < 1:750710/206‑1 (MQ=255) ccGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGccagca < 2:426557/103‑5 (MQ=255) gCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACctggcggggaacagcgaggc > 1:185544‑M2/1‑40 (MQ=255) tGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGGGCCGCACCAGCGCCTGGCg > 2:98124/1‑101 (MQ=255) cccccGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCAt < 1:175918/132‑1 (MQ=255) gcccgCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACctggcggggaacagcgaggcggtatggccatcgtcgcccat > 1:737286‑M2/2‑34 (MQ=255) gcccgCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACctggcggggaacagcgaggcggtatggccatcgtcgcccat < 2:737283‑M2/74‑42 (MQ=255) ccccGCCAGTCCCACCCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATCGCGCTGTCTGTGCAAGGCCAGGGCAAACTCGCTACCCTGCGCGCCGCGCTGGCGGGCAACGACCTTACTGAAATGCCGATTCGCGCTTttctt < 1:275889/226‑1 (MQ=255) ccccGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGGCCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATCGCGct < 2:128470/138‑1 (MQ=255) cccGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACctggcggggaacagcgaggcggtatggccatcgtcgcccatgcccagcaccagcacgtcgatcggcggtagctcggccaaggcctggtcagctttgagcgcagctgcatc < 2:725327‑M2/143‑111 (MQ=255) cccGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATCGCGCTGTCTGTGCAAGGCCAGGGCAAACTCGCTACCCTGCGCGCCGCGCTGGCGGGCAACGACCTTACTGAAATGCCGATTCGCGCTTTTCTTCACGAccccc < 1:612373/235‑1 (MQ=255) ccAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATCGCGCTGTCTGTGCAAGGCCAGGGCAAACTCGCTACCCTgc > 2:791242/1‑162 (MQ=255) cAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATCGCGCTGTCTGTGCAAGGCCAGGGCAAACTCGCTACCCTg > 2:775799/1‑160 (MQ=255) aCCGGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATCGCGCTGTCTGTGCAAGGCCAGGGCAAACTCGCTACCCTGCGCGCCGCGCTGGCGGGc < 1:275974/176‑1 (MQ=255) gaagaaGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCagc < 2:71776/114‑3 (MQ=255) aGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATCGCGCTGTCTGTGCAAGGCCAGGGCaaa < 1:719727/136‑1 (MQ=255) aGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATCGCGCTGTCTGTGCAAGGCCAGGGCAAACTCGCTACCCTGcgcgcc < 1:88703/154‑1 (MQ=255) gtGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGGGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATCGCGCTGTCTGTGCAAGGCCAGGGCAAACTCGCTACCCTGCGCGCCGCGCTGGCGGGCAACGACCTTACTGAAATGCCGATTCGCGCTTttcttc < 2:624449/198‑1 (MQ=255) cccTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATCGCGCTGTCTGTGCAAGGCCAGGGCAAACTCGCTACCCTGCGCGCCGCGCTGGCGGGCAACGACCTTACTGAAATGCCGATTCGCGCTTttcttc < 1:366403/194‑1 (MQ=255) | GTCACCTGTTGAAGGGCGAAGCGGCCAAGGCCCGTTTCGTTGGCCTGTACCAGCAGGCGGAGAACCTTGATGCAGCTGCGCTCAAAGCTGACCAGGCCTTGGCCGAGCTACCGCCGATCGACGTGCTGGTGCTGGGCATGGGCGACGATGGCCATACCGCCTCGCTGTTCCCCGCCAGTCCCAACCTGGAAGCAGGCCTGGACCTGGCGGGCCCACGCCGCTGCCTGCCGATGCTGGCGCCGAGCGTGCCGCACCAGCGCCTGTCGATGACCCGTTCGCTGCTGGCCAGCGCGGCCTTCATCGCGCTGTCTGTGCAAGGCCAGGGCAAACTCGCTACCCTGCGCGCCGCGCTGGCGGGCAACGACCTTACTGAAATGCCGATTCGCGCTTTTCTTCACGACCCCC > AE015451/1167358‑1167762 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |