| New junction evidence | |||||||||||
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AAAGAGCGTGCGCAGATTACCCTGCAGGCCATCGGGGATGCGGTGATTACAACCGATGTCGAGGGCAATATCGGCTACATGAACCCGGCCGCCGAGC‑AGTTGACCCACTGGCAATCCGGCCAGGCCCAGGGCCTGCCGCTGTCGGCACTGTTCAGCCTGGTGGATGAGCACGCCGAGGAGGATGGTCGCAGCTTGGTCGAGCAGGTGCTCAGCGGCAGCCTCAAGGGCGGCTCCGAGCATGCCCGGCTGATCCAGCGCCTGGACGGCAGTACCGTGTCGATCAACCTGGTAGGCTCGCCGATCCTCAATGATGGCCAGGTCAGTGGCATCGTACTGGTGCTGCACGACATGACCCAGGAACGCCAGTACATCGCCAACCTGTCCTGGCAAGCAACCCACGATGCGCTGACCGGGCTGGCCAACCGCCGCGAGTTCGAATACCGCCTGG > AE015451/1964587‑1965034 | aaaGAGCGTGCGCAGATTACCCTGCAGGCCATCGGGGATGCGGTGATTACAACCGATGTCGAGGGCAATATCGGCTACATGAACCCGGCCGCCGAGC‑AGTTGACCCACTGGCAATCCGGCCAGGCCCAGGGCCTGCCGCTGTCGGCACTGTTCAGCCTGGTGGATGAGCACGCCGAGGAGGATGGTCGCAGCTTGGTCGAGCAGGTGCTCAGCGGCAGCCTCAAGGGCGGCTcc > 2:865152/1‑234 (MQ=255) gcgcAGATTACCCTGCAGGCCATCGGGGATGCGGTGATTACAACCGATGTCGAGGGCAATATCGGCTACATGAACCCGGCCGCCGAGC‑AGTTGACCCACTGGCAATCCGGCCAGGCCCAGGGCCTGCCGCTGTCGGCACTGTTCAGCCTGGTGGATGAGCACGCCGAGGAGGATGGTCGCAGCTTGGTCGAGCAGGTGCTCAGCGGCAGCCTCAAGGGCGGCTCCGAGCCTgtct > 1:935672/1‑232 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aTGAGCACGCCGAGGAGGATGGTCGCAGCTTGGTCGAGCAGGTGCTCAGCGGCAGCCTCAAGGGCGGCTCCGAGCATGCCCGGCTGATCCAGCGCCTGGACGGCAGTACCGTGTCGATCAACCTGGTAGGCTCGCCGATCCTCAATGATGGCCAGGTCAGTGGCATCGTACTGGTGCTGCACGACATGACCCAGGAACGCCAGTACATCGCCAACCTGTCCTgg > 2:452090/1‑224 (MQ=255) aTGAGCACGCCGAGGAGGATGGTCGCAGCTTGGTCGAGCAGGTGCTCAGCGGCAGCCTCAAGGGCGGCTCCGAGCATGCCCGGCTGATCCAGCGCCTGGACGGCAGTACCGTGTCGATCAACCTGGTAGGCTCGCCGATCCTCAATGATGGCCAGGTCAGTGGCATCGTACTGGTGCTGCACGACATGACCCAGGAACGCCAGTACATCGCCAACCTGTCCTGGCAAGCAACCCa > 1:344372/1‑235 (MQ=255) aTGAGCACGCCGAGGAGGATGGTCGCAGCTTGGTCGAGCAGGTGCTCAGCGGCAGCCTCAAGGGCGGCTCCGAGCATGCCCGGCTGATCCAGCGCCTGGACGGCAGTACCGTGTCGATCAACCTGGTAGGCTCGCCGATCCTCAATGATGGCCAGGTCAGTGGCATCGTACTGGTGCTGCACGACATGACCCAGGAACGCCAGTACATCGCCAACCTGTCCTGGCAAGCAACCCa > 1:581058/1‑235 (MQ=255) catcctcctcggcgtgctcgtccaccaggctgaccagtgccgacagcggcagCCTCAGGGGCGGCTCCGAGCATGCCCGGCTGATCCAGCGCCTGGa < 2:586933‑M2/45‑1 (MQ=255) cgcGCCGAGGAGGATGGTCGCAGCTTGGTCGCGCAGGTGCTCAGCGGCGGCCTCAAGGGCGGCTCCGAGCATGCCCGGCTGATCCAGCGCCTGGACGGCAGTACCGTGTCGATCAACCTGGTAGGCTCGCCGATCCTCAATGATGGCCAGGt < 2:152162/150‑1 (MQ=255) gcGCCGAGGAGGATGGTCGCAGCTTGGTCGAGCAGGTGCTCAGCGGCAGCCGCAAGGGCGGCTCCGAGCATGCCCGGCTGATCCAGCGCCTGGACGGCAGTACCGTGTCGATCAACCTGGTAGGCTCGCCGATCCTCa < 2:440582/137‑1 (MQ=255) cGAGGAGGATGGTCGCAGCTTGGTCGAGCAGGTGCTCAGCGGCAGCCTCAAGGGCGGCTCCGAGCATGCCCGGCTGATCCAGCGCCTGGACGGCAGTACCGTGTCGATCAACCTGGTAGGCTCGCCGATCCTCAATGATGGCCAGGTCAGTGGCATCg < 1:713033/158‑1 (MQ=255) cGAGGAGGATGGTCGCAGCTTGGTCGAGCAGGTGCTCAGCGGCAGCCTCAAGGGCGGCTCCGAGCATGCCCGGCTGATCCAGCGCCTGGACGGCAGTACCGTGTCGATCAACCTGGTAGGCTCGCCGATCCTCAATGATGGCCAGGTCAGTGGCATCg > 2:713030/1‑158 (MQ=255) ggaggaTGGTCGCAGCTTGGTCGAGCAGGTGCTCAGCGGCAGCCTCAAGGGCGGCTCCGAGCATGCCCGGCTGATCCAGCGCCTGGACGGCAGTACCGTGTCGATCAACCTGGTAGGCTCGCCGATCCTCAATGATGGCCAGGTCAGTGGCATCGTACTGGTGCTGCACGACATGACCCAGGAACGCCAg > 2:583757/1‑190 (MQ=255) ggaggaTGGTCGCAGCTTGGTCGAGCAGGTGCTCAGCGGCAGCCTCAAGGGCGGCTCCGAGCATGCCCGGCTGATCCAGCGCCTGGACGGCAGTACCGTGTCGATCAACCTGGTAGGCTCGCCGATCCTCAATGATGGCCAGGTCAGTGGCATCGTACTGGTGCTGCACGACATGACCCAGGAACGCCAGTACATCGCCAACCTGTCCTGGCAAGCAACCCACGATGCGCTGACCg > 1:614064/1‑236 (MQ=255) ttgCAGCTTGGTCGAGCAGGTGCTCAGCGGCAGCCTCAAGGGCGGCTCCGAGCATGCCCGGCTGGGCCAGCGCCTGGACGGCAGTACCGTGTCGATCAACCTGGTAGGCTCGCCGATCCTCAATGATGGCCAGGt < 2:418287/133‑1 (MQ=255) ggTCGAGCAGGTGCTCAGCGGCAGCCTCAAGGGCGGCTCCGAGCATGCCCGGCTGATCCAGCGCCTGGACGGCAGTACCGTGTCGATCAACCTGGTAGGCTCGCCGATCCTCAATGATGGCCAGGTCAGTGGCATCGTACTGGTGCTGCACGACATGACCCAGGAACGCCAGTACATCGCCAACCTGTCCTg > 1:237175/1‑192 (MQ=255) gTCGAGCAGGTGCTCAGCGGCAGCCTCAAGGGCGGCTCCGAGCATGCCCGGCTGATCCAGCGCCTGGACGGCAGTACCGTGTCGATCAACCTGGTAGGCTCGCCGATCCTCAATGATGGCCAGGTCAGTGGCATCGTACTGGTGCTGCACGACATGACCCAGGAACGCCAGTACATCGCCAACCTGTCCTGGCAAGCAACCCACGATGCGCTGACCGGGCTGGCCAACCGCcgcg < 1:921244/235‑1 (MQ=255) cGAGCAGGTGCTCAGCGGCAGCCTCAAGGGCGGCTCCGAGCATGCCCGGCTGATCCAGCGCCTGGACGGCAGTACCGTGTCGATCAACCTGGTAGGCTCGCCGATCCTCAATGATGGCCAGGTCAGTGGCATCGTACTGGTGCTGCACGACATGACCCAGGAACGCCAGTACATCGCCAACCTGTCCTGGCAAGCAACCCACGATGCGCTGACCGGGCTGGCCAAccgcc > 2:514625/1‑230 (MQ=255) gAGCAGGTGCTCAGCGGCAGCCTCAAGGGCGGCTCCGAGCATGCCCGGCTGATCCAGCGCCTGGACGGCAGTACCGTGTCGATCAACCTGGTAGGCTCGCCGATCCTCAATGATGGCCAGGTCAGTGGCCTCGTACTGGTGCTGCACGACATGACCCAGGAACGCCAGTACATCGCCAAcc > 1:59116/1‑181 (MQ=255) cTCAGCGGCAGCCTCAAGGGCGGCTCCGAGCATGCCCGGCTGATCCAGCGCCTGGACGGCAGTACCGTGTCGATCAACCTGGTAGGCTCGCCGATCCTCAATGATGGCCAGGTCAGTGGCATCGTACTGGTGCTGCACGACATGACCCAGGAACGCCAGTACATCGCCAACCTGTCCTGGCAAGCAACCCACGATGCGCTGACCGGGCTGGCCAACCGCCGCGAGTTCGAATAcc < 1:514628/235‑1 (MQ=255) tCAGCGGCAGCCTCAAGGGCGGCTCCGAGCATGCCCGGCTGATCCAGCGCCTGGACGGCAGTACCGTGTCGATCAACCTGGTAGGCTCGCCGATCCTCAATGATGGCCAGGTCAGTGGCATCGTACTGGTGCTGCACGACATGACCCAGGAACGCCAGTACATCGCCAACCTGTCCTGGCAAGCAACCCACGATGCGCTGACCGGGCTGGCCAACCGCCGCGAGTTCGAATa > 1:114258/1‑232 (MQ=255) gccgCCTCAAGGTCGGCTCCGAGCATGCCCGGCTGATCCGGCGCCTGGACGGCAGTACCGTGTCGATCAACCTGGTAGGCTCGCCGATCCTCAATGATGGCCAGGTCAGTGGCATCGTACTg < 2:393665‑M2/118‑1 (MQ=255) cagCCTCAAGGGCGGCTCCGAGCATGCCCGGCTGATCGAGCGCCTGGACGGCAGTACCGTGTCGATCAACCTGGTAGGCTCGCCGATCCTCAATGATGGCCAGGTCAGTGGCATCGTACTGGTGCTGCACGACATGACCCAGGAACGCCAGTACATCGCCAACCTGTCCTGGCAAGCAACCCACGATGCGCTGACCGGGCTGGCCAAccg > 2:882491‑M2/4‑210 (MQ=255) cagCCTCAAGGGCGGCTCCGAGCATGCCCGGCTGATCCAGCGCCTGGACGGCAGTACCGTGTCGATCAACCTGGTAGGCTCGCCGATCCTCAATGATGGCCAGGTCAGTGGCATCGTACTGGTGCTGCACGACATGACCCAGGAACGCCAGTACATCGCCAACCTGTCCTGGCAAGCAACCCACGATGCGCTGACCGGGCTGGCCAAccg < 1:882494‑M2/207‑1 (MQ=255) gCCTCAAGGGCGGCTCCGAGCATGCCCGGCTGATCCAGCGCCTGGACGGCAGTACCGTGTCGATCAACCTGGTAGGCTCGCCGATCCTCAATGATGGCCAGGTCAGTGGCATCGTACTGGTGCTGCACGACATGACCCAGGAACGCCAGTACATCGCCAACCTGTCCTGGCAAGCAACCCACGATGCGCTGACCGGGCTGGCCAACCGCCGCGAGTTCGAATACCGCCTgg > 1:717146‑M2/2‑231 (MQ=255) | AAAGAGCGTGCGCAGATTACCCTGCAGGCCATCGGGGATGCGGTGATTACAACCGATGTCGAGGGCAATATCGGCTACATGAACCCGGCCGCCGAGC‑AGTTGACCCACTGGCAATCCGGCCAGGCCCAGGGCCTGCCGCTGTCGGCACTGTTCAGCCTGGTGGATGAGCACGCCGAGGAGGATGGTCGCAGCTTGGTCGAGCAGGTGCTCAGCGGCAGCCTCAAGGGCGGCTCCGAGCATGCCCGGCTGATCCAGCGCCTGGACGGCAGTACCGTGTCGATCAACCTGGTAGGCTCGCCGATCCTCAATGATGGCCAGGTCAGTGGCATCGTACTGGTGCTGCACGACATGACCCAGGAACGCCAGTACATCGCCAACCTGTCCTGGCAAGCAACCCACGATGCGCTGACCGGGCTGGCCAACCGCCGCGAGTTCGAATACCGCCTGG > AE015451/1964587‑1965034 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |