| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 3799802 | 51 (1.020) | 3 (0.060) | 3/326 | NT | 5.7% | coding (137/1125 nt) | PP_3360 | conserved membrane protein of unknown function |
| ? | AE015451 | = 3799806 | 50 (1.040) | coding (141/1125 nt) | PP_3360 | conserved membrane protein of unknown function | |||||
AGCGTGGTGAAATCCGATCGACCTGTTGCGCCTCTTTGACGTCCCAAGAAAGCACCTTGGCAAATCAACCCAGAGGCGAGGTACTCATGAACGACCGCATCATCGCGTTTTTCACCGAAACCACCGTATTCGGCATCTCCATTCTCAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCG > AE015451/3799580‑3800011 | aGCGTGGTGAAATCCGATCGACCTGTTGCGCCTCTTTGACGTCCCAAGAAAGCACCTTGGCAAATCAACCCAGAGGCGAGGTACTCATGAACGACCGCATCATCGCGTTTTTCACCGAAACCACCGTATTCGGCATCTCCATTCTCAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTg > 1:896822/1‑235 (MQ=255)aGCGTGGTGAAATCCGATCGACCTGTTGCGCCTCTTTGACGTCCCAAGAAAGCACCTTGGCAAATCAACCCAGAGGCGAGGTACTCATGAACGACCGCATCATCGCGTTTTTCACCGAAACCACCGTATTCGGCATCTCCATTCTCAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTg > 1:229772/1‑235 (MQ=255) aCGTCCCAAGAAAGCACCTTGGCAAATCAACCCAGAGGCGAGGTACTCATGAACGACCGCATCATCGCGTTTTTCACCGAAACCACCGTATTCGGCATCTCCATTCTCAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCa < 1:581166/235‑1 (MQ=255) gTCCCAAGAAAGCACCTTGGCAAATCAACCCAGAGGCGAGGTACTCATGAACGACCGCATCATCGCGTTTTTCACCGAAACCACCGTATTCGGCATCTCCATTCTCAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAg < 1:462785/235‑1 (MQ=255) aGAAAGCACCTTGGCAAATCAACCCAGAGGCGAGGTACTCATGAACGACCGCATCATCGCGTTTTTCACCGAAACCACCGTATTCGGCATCTCCATTCTCAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCtt > 1:618881/1‑235 (MQ=255) aaaTCAACCCAGAGGCGAGGTACTCATGAACGACCGCATCATCGCGTTTTTCACCGAAACCACCGTATTCGGCATCTCCATTCTCAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACt > 1:659324/1‑236 (MQ=255) cGAGGTACTCATGAACGACCGCATCATCGCGTTTTTCACCGAAACCACCGTATTCGGCATCTCCATTCTCAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTgg > 1:787287/1‑236 (MQ=255) cTCATGAACGACCGCATCATCGCGTTTTTCACCGAAACCACCGTATTCGGCATCTCCATTCTCAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCt < 2:618878/227‑1 (MQ=255) aTGAACGACCGCATCATCGCGTTTTTCACCGAAACCACCGTATTCGGCATCTCCATTCTCAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGc < 1:663539/235‑1 (MQ=255) aTGAACGACCGCATCATCGCGTTTTTCACCGAAACCACCGTATTCGGCATCTCCATTCTCAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCt < 1:299163/236‑1 (MQ=255) aCCGCATCATCGCGTTTTTCACCGAAACCACCGTATTCGGCATCTCCATTCTCAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGa < 2:827393/154‑1 (MQ=255) ccGCATCATCGCGTTTTTCACCGAAACCACCGTATTCGGCATCTCCATTCTCAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGc < 2:722182/227‑1 (MQ=255) ccGCATCATCGCGTTTTTCACCGAAACCACCGTATTCGGCATCTCCATTCTCAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGcc > 1:205441/1‑236 (MQ=255) gCATCATCGCGTTTTTCACCGAAACCACCGTATTCGGCATCTCCATTCTCAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCt > 1:365530/1‑235 (MQ=255) tcatcGCGTTTTTCACCGAAACCACCGTATTCGGCATCTCCATTCTCAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACt > 2:208310/1‑198 (MQ=255) cgcgTTTTTCACCGAAACCACCGTATTCGGCATCTCCATTCTCAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTAcg > 2:229770‑M2/1‑124 (MQ=255) tttCACCGAAACCACCGTATTCGGCATCTCCATTCTCAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCtg < 2:624633/193‑1 (MQ=255) ttCACCCAAACCACCGTATTCGGCATCTCCATTCTCAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGa < 1:864852/137‑1 (MQ=255) accaccGTATTCGGCATCTCCATTCTCAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCCCCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCt < 1:204530/191‑1 (MQ=255) ggCATCTCCATTCTCAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAg < 2:659321/236‑1 (MQ=255) aTCTCCATTCTCAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCgctggctg > 1:30115/1‑228 (MQ=255) aTCTCCATTCTCAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGACAATGGCCCAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACCTTCTGTTGTTGCTTGCCTCCTTGCt > 2:252402/1‑188 (MQ=255) ctcCATTCTCAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTca > 1:843777/1‑236 (MQ=255) tctcAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCt < 2:491045/180‑1 (MQ=255) tcAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGTTGGGc > 2:258278/1‑185 (MQ=255) tcAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCt > 1:616908/1‑235 (MQ=255) aaTCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCcgcgcg > 2:220037/1‑209 (MQ=255) tgctgGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAgg > 1:128248/1‑218 (MQ=255) gtggCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTgg > 1:324099/1‑235 (MQ=255) gtggCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCGTg > 2:249482/1‑165 (MQ=255) gtggCGCTGACAGTCGCCACCTTGCTCTTCCTGCTCGCCCGTGCCGCCATCAGTCTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGCACACgc > 2:50631/1‑91 (MQ=255) cgcTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTcgcg > 1:725111/1‑236 (MQ=255) cgcTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGCTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGCGCCTGCTCGACCTGCCCGAGCgctggcc > 2:305788/1‑201 (MQ=255) tGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGc < 1:567016/235‑1 (MQ=255) tGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTACCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAAACGCCAAGGTGCTTTCCCGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGcc < 1:643314/168‑1 (MQ=255) cAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCtg < 1:370670/137‑1 (MQ=255) taagagacagggtcttcctggtCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTAcggcgcatcaggaaactgatggcggcacgggcgaccaggaagaccaaggtggcgactgtcagcgccaccagcagattgagaatggagatgccgaatacggtggtttcggtgaaaaacgcgatgatgcggtcgttcatgagtacctcgcctctgggttgatttgccaaggtgctttct > 1:334621‑M2/11‑59 (MQ=255) aCCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTg > 2:839081/1‑228 (MQ=255) cTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTg < 2:843774/233‑1 (MQ=255) gTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAgg < 1:136526/189‑1 (MQ=255) cTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTAcggcgcatcaggaaactgatggcggcacgggc < 1:581574‑M2/78‑33 (MQ=255) ggTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGTCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGCGGTc > 1:228595/1‑205 (MQ=255) ggTCGCCCGTGCCGCCATCAGCTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCCGAAAAGGGCCAAGGTGCTTTCAGGCGCCCGc > 2:552803/1‑106 (MQ=255) gTCGGCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCCCCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTg < 2:194787/123‑1 (MQ=255) tCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACcgc > 1:302371/1‑236 (MQ=255) cccGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTAcggcgcatcaggaaactgatggcggcacgggcgaccaggaagaccaaggtggcgactgtcagcgccaccagcagattgagaatggagatgccgaatacggtggtttcg < 2:334618‑M2/143‑109 (MQ=255) cccGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAgcgcc > 2:210770/1‑164 (MQ=255) cccGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGAccgg > 2:202556/1‑173 (MQ=255) cGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTgg < 2:478118/196‑1 (MQ=255) gTGCCGCCATCCGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGt < 2:189199/189‑1 (MQ=255) ccgccATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCg < 1:143514/234‑1 (MQ=255) cATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGcc < 2:116748/128‑1 (MQ=255) gTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCgcgc < 1:593510/220‑1 (MQ=255) tgtCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTgg < 2:677098/180‑1 (MQ=255) cTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGc < 1:758496/39‑1 (MQ=255) cGGGTACGGCGCTGGTCCGAAGACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCAACAGCAACTGTCTGTTGGTGCTGGCCTCCTTGGTGGTGGGCCTGAGCATGCTc > 2:600869/1‑120 (MQ=255) ggTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCtgtg > 2:308466/1‑159 (MQ=255) ggTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACcgcg > 1:365232/1‑203 (MQ=255) ggTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACcgcg < 2:365229/203‑1 (MQ=255) tACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGa > 2:758493/1‑39 (MQ=255) | AGCGTGGTGAAATCCGATCGACCTGTTGCGCCTCTTTGACGTCCCAAGAAAGCACCTTGGCAAATCAACCCAGAGGCGAGGTACTCATGAACGACCGCATCATCGCGTTTTTCACCGAAACCACCGTATTCGGCATCTCCATTCTCAATCTGCTGGTGGCGCTGACAGTCGCCACCTTGGTCTTCCTGGTCGCCCGTGCCGCCATCAGTTTCCTGATGCGCCGGGTACGGCGCTGGTCCGAACACGAAGGCCCACTGAGCCAGATAATGGCCAAGGTGCTTTCCGGCACCAGCAACTTTCTGTTGTTGCTGGCCTCCTTGCTGGTGGGCCTGAGCATGCTCGACCTGCCCGAGCGCTGGCTGACCAGGGTCAGCAGCCTGTGGTTCGTGGTCGCGGCCTTGCAGATTGGCCTGTGGGCCAACCGCGCCATCG > AE015451/3799580‑3800011 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |