New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 4791752 = | 40 (0.800) | 3 (0.060) | 3/312 | NT | 8.5% | coding (2088/6525 nt) | pvdI | non‑ribosomal peptide synthetase (subunit of ferribactin synthase) |
? | AE015451 | 4791887 = | 28 (0.610) | coding (1953/6525 nt) | pvdI | non‑ribosomal peptide synthetase (subunit of ferribactin synthase) |
GACAGGTAGGCGGCGAAACCGTCGGCATCGAGCACCGCCTCGCGCTGCAGCAGATGTACCGTCTTGCCGGCCCAGAGCGCGCCAAACAGCATGGTATGCCCAAGGTCGGCGGCAGGCGTGGAGACCATGGCGAAGTGTTCCAGATCGCCAAGGGCAATCCGCTCGGACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCTTGATCTGTGCGTCACGCAGCATGAATGCCATTCGCTGCTGCGGCTGACCCGGCTCCAGCGGTACATACGCCCCCCCGGCCTTGAGAA > AE015451/4791660‑4792122 | gACAGGTAGGCGGCGAAACCGTCGGCATCGAGCACCGCCTCGCGCTGCAGCAGATGTACCGTCTTGCCGGCCCAGAGCGCGCCAAACAGCATGGTATGCCCAAGGTCGGCGGCAGGCGTGGAGACCATGGCGAAGTGTTCCAGATCGCCAAGGGCAATCCGCTCGGACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGgtggtg < 2:728897/234‑1 (MQ=255) ggcggcGAAACCGTCGGCATCGAGCACCGCCTCGCGCTGCAGCAGATGTACCGTCTTGCCGGCCCAGAGCGCGCCAAACAGCATGGTATGCCCAAGGTCGGCGGCAGGCGTGGAGACCATGGCGAAGTGTTCCAGATCGCCAAGGGCAATCCGCTCGGACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGgtgt < 1:814067/236‑1 (MQ=255) cGGCATCGAGCACCGCCTCGCGCTGCAGCAGATGTACCGTCTTGCCGGCCCAGAGCGCGCCAAACAGCATGGTATGCCCAAGGTCGGCGGCAGGCGTGGAGACCATGGCGAAGTGTTCCAGATCGCCAAGGGCAATCCGCTCGGACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAg < 2:727196/234‑1 (MQ=255) gCACCGCCTCGCGCTGCAGCAGATGTACCGTCTTGCCGGCCCAGAGCGCGCCAAACAGCATGGTATGCCCAAGGTCGGCGGCAGGCGTGGAGACCATGGCGAAGTGTTCCAGATCGCCAAGGGCAATCCGCTCGGACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCCTGGGCATACCggc > 2:187742/1‑198 (MQ=255) cgcgCTGCAGCAGATGTACCGTCTTGCCGGCCCAGAGCGCGCCAAACAGCATGGTATGCCCAAGGTCGGCGGCAGGCGTGGAGACCATGGCGAAGTGTTCCAGATCGCCAAGGGCAATCCGCTCGGACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCggtg > 2:75572/1‑191 (MQ=255) tGCACCAGATGTACCGTCTTGCCGGCCCAGAGCGCGCCAAACAGCATGGTATGCCCAAGGTCGGCGGCAGGCGTGGAGACCATGGCGAAGTGTTCCAGATCGCCAAGGGCAATCCGCTCGGACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAAcc < 2:353782/231‑1 (MQ=255) ccGTCTTGCCGGCCCAGAGCGCGCCAAACAGCATGGTATGCCCAAGGTCGGCGGCAGGCGTGGAGACCATGGCGAAGTGTTCCAGATCGCCAAGGGCAATCCGCTCGGACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGc < 1:703913/235‑1 (MQ=255) ccGGCCCAGAGCGCGCCAAACAGCATGGTATGCCCAAGGTCGGCGGCAGGCGTGGAGACCATGGCGAAGTGTTCCAGATCGCCAAGGGCAATCCGCTCGGACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGc < 2:762091/169‑1 (MQ=255) gagCGCGCCAAACAGCATGGTATGCCCAAGGTCGGCGGCAGGCGTGGAGACCATGGCGAAGTGTTCCAGATCGCCAAGGGCAATCCGCTCGGACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGt < 1:905376/236‑1 (MQ=255) gcgcgcCAAACAGCATGGTATGCCCAAGGTCGGCGGCAGGCGTGGAGACCATGGCGAAGTGTTCCAGATCGCCAAGGGCAATCCGCTCGGACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGCGGTGCCCGAGGTGGAGAt > 2:311882/1‑172 (MQ=255) aaaCAGCATGGTATGCCCAAGGTCGGCGGCAGGCGTGGAGACCATGGCGAAGTGTTCCAGATCGCCAAGGGCAATCCGCTCGGACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCg > 1:466491/1‑214 (MQ=255) aGCAGGGTATGCCCAAGGTCGGCGGCAGGCGTGGAGACCATGGCGAAGTGTTCTAGATCGCCAAGGGCAATCCGCTCGGACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAg < 2:13668/153‑1 (MQ=255) gCATGGTATGCCCAAGGTCGGCGGCAGGCGTGGAGACCATGGCGAAGTGTTCCAGATCGCCAAGGGCAATCCGCTCGGACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCAc < 1:650531/236‑1 (MQ=255) gggaTGCCCAAGGTCGGCGGCAGGCGTGGAGACCATGGCGAAGTGTTCCAGATCGCCAAGGGCAATCCGCTCGGACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGt < 1:530896/232‑1 (MQ=255) AGGTCGGCGGCAGGCGTGGAGACCATGGCGAAGTGTTCCAGATCGCCAAGGGCAATCCGCTCGGACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGc < 2:597366‑M1/176‑1 (MQ=255) AGGTCGGCGGCAGGCGTGGAGACCATGGCGAAGTGTTCCAGATCGCCAAGGGCAATCCGCTCGGACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGAt > 1:663938‑M1/1‑236 (MQ=255) cggcggCAGGCGTGGAGACCATGGCGAAGTGTTCCAGATCGCCAAGGGCAATCCGCTCGGACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCg > 1:209651/1‑122 (MQ=255) cggcggCAGGCGTGGAGACCATGGCGAAGTGTTCCAGATCGCCAAGGGCAATCCGCTCGGACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGc > 1:759760/1‑235 (MQ=255) agaCCATGCCGAAGTGTTCCAGATCGCCAAGGGCAATCCGCTCGGACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGt < 2:819318/234‑1 (MQ=255) gATCGCCAAGGGCAATCCGCTCGGACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCt > 1:13617/1‑234 (MQ=255) aaggcttgtccgagcggattgcccttggcgatctggaacacttcgccatggtctccacgcctgccgccgaccttgggcataccGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCg > 2:323193‑M2/84‑216 (MQ=255) aaggcttgtccgagcggattgcccttggcgatctggaacacttcgccatggtctccacgcctgccgccgaccttgggcataccGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCg < 1:323196‑M2/133‑1 (MQ=255) gCTCGGACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCTTGATCTGTGCGTCACgcag > 1:806682/1‑235 (MQ=255) gcccttggcgatctggaacacttcgccatggtctccacgcctgccgccgaccttgggcataccGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGAcc > 1:79304‑M2/64‑211 (MQ=255) gACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCTTGATCTGTGCGTCACGCAGCATGaa > 1:753634/1‑236 (MQ=255) gACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCTTGATCTGTGCGTCACGCAGCATGaa > 1:585831/1‑236 (MQ=255) gACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCTTGATCTGTGCGTCACGCAGCATGa > 1:334158/1‑235 (MQ=255) tCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCTTGATCTGTGCGTCACGCAGCAt > 1:515234/1‑224 (MQ=255) gTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGa < 2:759757/188‑1 (MQ=255) cgcCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGt < 2:381437/164‑1 (MQ=255) cgcCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGt > 1:381440/1‑164 (MQ=255) cgcCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCTTGATCTGTGCGTCACGCAGCATGAATGCCATTCGCTGCTGCGGCTGAccc < 1:77058/235‑1 (MQ=255) ccccATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATcacg > 2:797337/1‑58 (MQ=255) acacCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCtt < 2:742999/175‑1 (MQ=255) cgcgACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCTTGATCTGTGCGTCACGCAGCATGAATGCCATTCGCTGCTGCGGCTGa < 1:485112/217‑1 (MQ=255) gcgACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCTTGATCTGTGCGTCACGCAGCATGAATGCCATTCGCTGCTGCGGCTGACCCGGCTCCAGCGGTACATa > 1:905676/1‑236 (MQ=255) gccccccTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCCCATAGGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGt < 1:144661/144‑1 (MQ=255) gACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCtt < 1:493829/168‑1 (MQ=255) gACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCTTGATCTGTGCGTCACGCAGCATGAATGCCATTc > 2:631918/1‑200 (MQ=255) gACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGAGCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCtt > 2:493826/1‑168 (MQ=255) cGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCTTGATCTGTGCGTCACGCAGCATGAATGCCATTCGCTGCTGCGGCTGACCCGGCTCCAGCGGTACATACGCCCCCCCGGCCTTgaga > 1:440573‑M2/2‑236 (MQ=255) ggtggtGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCTTGATCTGTGCGTCACGCAGCATGAATGCCATTCGCTGCTGCGGCTGACCCGGCTCCAGCGGTACATACGCCCCCCCGGCCTTGAGaa > 1:249597/1‑236 (MQ=255) ggtggtGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCAGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGccccc > 2:299400/1‑108 (MQ=255) | GACAGGTAGGCGGCGAAACCGTCGGCATCGAGCACCGCCTCGCGCTGCAGCAGATGTACCGTCTTGCCGGCCCAGAGCGCGCCAAACAGCATGGTATGCCCAAGGTCGGCGGCAGGCGTGGAGACCATGGCGAAGTGTTCCAGATCGCCAAGGGCAATCCGCTCGGACAAGCCTTCAAGGTAATTGGCCAGCGCCCCATGAGACACCGCGACCCCCTTGGGCATACCGGTGGTGCCCGAGGTGTAGATCACATAAGCCAGGTTGCCGGAGTGAACCGCCACGGGCACCCCTGCCTCGCCACCTGCCGCGTTCAGCGCCAGGCACTGTACGCCCCCGATGGCCGGGCCAGGCTCGTCCTCGGCCCTGAGCAAGACCTTGATCTGTGCGTCACGCAGCATGAATGCCATTCGCTGCTGCGGCTGACCCGGCTCCAGCGGTACATACGCCCCCCCGGCCTTGAGAA > AE015451/4791660‑4792122 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |