New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 208966 = | NA (NA) | 9 (0.110) | 9/340 | NT | 11.0% | coding (14472/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
? | AE015451 | 208967 = | 76 (0.880) | coding (14473/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
ACGTCCGCACCTCCAACGGTTGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGGCAGTGCCGGTTGTACCGTTAGCCGGGATGGTGATGGTGGTTTTGCCATCGTCCAGGGTAAAGGTCAGCGCCGCATGCTTGTCGATAGGCAGACCATCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTTaccgaagg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AE015451/209193‑208966 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGTACAACCGGCACTGCCACCGTGACTGCCCCGGACAACGTCTACGTCGGCACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGGAGGTGCGGACGTCGGTAAGTT > AE015451/208967‑209202 ACGTCCGCACCTCCAACGGTTGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGGCAGTGCCGGTTGTACCGTTAGCCGGGATGGTGATGGTGGTTTTGCCATCGTCCAGGGTAAAGGTCAGCGCCGCATGCTTGTCGATAGGCAGACCATCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTTACCGAAGG > 1:1392117/1‑236 gCAGGGTCGGTGGTGCCGGCGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGGCAGTGCCGGTTGTACCGTTAGCCGGGATGGTGATGGTGGTTTTGCCATCGTCCAGGGTAAAGGTCAGCGCCGCATGCTTGTCGATAGGCAGACCATCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTTACCG < 2:153922/195‑1 TTGGTGCCGACGTAGACGGTGTCCGGGGCAGTCACGGTGGCAGTGCCGGTTGTACCGTTAGCCGGGATGGTGATGGTGGTTTTGCCATCGTCCAGGGTAAAGGTCAGCGCCGCATGCTTGTCGATAGGCAGACCATCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTTACCG < 1:21256/187‑1 GACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGGCAGTGCCGGTTGTACCGTTAGCCGGGATGGTGATGGTGGTTTTGCCATCGTCCAGGGTAAAGGTCAGCGCCGCATGCTTGTCGATAGGCAGACCATCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTTACCGAAGGCGGCG > 2:598696/1‑188 ACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGGCAGTGCCGGTTGTACCGTTAGCCGGGATGGTGATGGTGGTTTTGCCATCGTCCAGGGTAAAGGTCAGCGCCGCATGCTTGTCGATAGGCAGACCATCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTTACCGAAGGCGGC < 2:1303494/180‑1 ACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGGCAGTGCCGGTTGTACCGTTAGCCGGGATGGTGATGGTGGTTTTGCCATCGTCCAGGGTAAAGGTCAGCGCCGCATGCTTGTCGATAGGCAGACCATCTTTGTTGGTCAGCGTAATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTTACCG < 1:210153/172‑1 CGGGGCAGTCACGGTGGCAGTGCCGGTTGTACCGTTAGCCGGGATGGTGATGGTGGTTTTGCCATCGTCCAGGGTAAAGGTCAGCGCCGCATGCTTGTCGATAGGCAGGCCATCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGGGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTTAtc > 2:264120/1‑161 GTCACGGTGGCAGTGCCGGTTGTACCGTTAGCCGGGATGGTGATGGTGGTTTTGCCATCGTCCAGGGTAAAGGTCAGCGCCGCATGCTTGTCGATAGGCAGACCATCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTTACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTG < 1:598698/189‑1 CGTTAGCCCGGATGGTGATGGTGGTTTTGCCCTCGTCCAGGGTAAAGGTCAGCGCCGCATGCTTGTCGATAGGCAGACCATCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTTACCGAAGG < 2:186911/136‑1 CGGGATGGTGATGGTGGTTTGGCCATCGTCCAGGGTAAAGGTCAGAGCCTTATGCTTGTCGATAGGCAGACCATCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTTACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGC < 1:798391/195‑1 GGTGGTTTTGCCATCGTCCAGGGTAAAGGTCAGCGCCGCATGCTTGTCGATAGGCAGACCATCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTTACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGA < 1:300258/171‑1 TCGTCCAGGGTAAAGGTGAGCGCCGCATGCTTGTCGATAGGCAGACCATCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTTACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCT < 2:1107334/153‑1 TCCAGGGTAAAGGTCAGCGCCGCATGCTTGTCGATAGGCAGACCATCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTTACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATC < 1:3586/123‑1 GTCAGCGCCGCAGTCTTGTCGATCGGCAGACCATCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTTACCGAAGGCGGCGAGATC < 2:45005/99‑1 attGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTTACCGAACGCGGCGAGATCACGGACACTATCACGCTCGCCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGAGAAGCATGCGGCGCTGACCTTTTCCCTGGACGATGGCAAAAC < 2:1278128/131‑1 CTCGCCGCCTTCGGTTACCGAAGGCGGCGAGATCAACTACACCATCACACTGACCAACAAAGATGGTCTGC < 1:50352/71‑1 GCCTTCGGTTACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCG < 2:889824/130‑1 ACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGTACAACCGGCACTGCCACCGTGACTGCCCCGGACAACGTCTACGTCGGCACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGGAGGTGCGGACGTCGGTAA > 2:513036/1‑233 CGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGTACAACCGGCACTGCCACCGTGACTGCCCCGGACAACGTCTACGTCGGCACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGGAGGT > 2:1232261/1‑217 CGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGTACAACCGGCACTGCCACCGTGACTGCCCCGGACAACGTCTACGTCGGCACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGGAGGT < 1:1232264/217‑1 GAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGTACAACCGGCACTGCCACCGTGACTGCCCCGGACAACGTCTACGTCGGCACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGGAGGTGCGGACGTCGGTAAGTT > 2:868750/1‑233 GAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGTACAACCGGCACTGCCACCGTGACTGCCCCGGACAACGTCTACGTCGGCACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGGAGGTGCGGACGTCGGGAA > 1:464203/1‑230 AAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGAACAACCGGCACTGCCA > 2:306376/1‑141 AGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGCTGGTCTGCCTATCGACAAGAATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAA > 1:701129/1‑120 GCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAA > 1:800237/1‑118 GCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAA < 2:800235/118‑1 ACGTCCGCACCTCCAACGGTTGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGGTGCCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGGCAGTGCCGGTTGTACCGTTAGCCGGGATGGTGATGGTGGTTTTGCCATCGTCCAGGGTAAAGGTCAGCGCCGCATGCTTGTCGATAGGCAGACCATCTTTGTTGGTCAGCGTGATGGTGTAGGTGATCTCGCCGCCTTCGGTTaccgaagg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AE015451/209193‑208966 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGTACAACCGGCACTGCCACCGTGACTGCCCCGGACAACGTCTACGTCGGCACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGGAGGTGCGGACGTCGGTAAGTT > AE015451/208967‑209202 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |