New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 208966 = | NA (NA) | 9 (0.110) | 9/340 | NT | 11.0% | coding (14472/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
? | AE015451 | 208967 = | 76 (0.880) | coding (14473/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
AACGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGTACAACCGGCACTGCCACCGTGACTGCCCCGGACAACGTCTACGTCGGCACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGGAGGTGCGGACGTCGGTAA > AE015451/208739‑209199 | acgtccgcacctccaacggttgcgatcgacatcacgacagggtcgttggtgccgacgtagacgttgtccggggcagtcacggtggcagtgccggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttttgccatcgtccagggtaaaggtcagcgccgcatgcttgtcgataggcagaccatctttgttggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgccttcggttACCGAAgg > 1:1392117‑M2/229‑236 (MQ=255) gCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACg < 1:1149074/236‑1 (MQ=11) gCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACg < 1:1118175/236‑1 (MQ=11) gAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCt > 1:663352/1‑236 (MQ=31) aaCCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGa > 1:335123/1‑236 (MQ=31) gcagggtcggtggtgccggcgtagacgttgtccggggcagtcacggtggcagtgccggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttttgccatcgtccagggtaaaggtcagcgccgcatgcttgtcgataggcagaccatctttgttggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgccttcggttACCg < 2:153922‑M2/4‑1 (MQ=255) cgcCGTACACCCACGCTGCGCAGGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGAc < 2:1295005/229‑1 (MQ=31) gcCGTACACCCACGCTGCGCAGGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACcaaca < 1:979311/233‑1 (MQ=31) cGTACACCCACGCTGCGCAGGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGAt < 1:1123507/236‑1 (MQ=31) cGTACACCCACGCTGCGCAGGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGAt < 1:746727/236‑1 (MQ=31) cGTACACCCACGCTGCGCAGGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGAt < 1:898314/236‑1 (MQ=31) tACACCCACGCTGCGCAGGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATgg < 1:1286637/236‑1 (MQ=31) ttggtgccgacgtagacggtgtccggggcagtcacggtggcagtgccggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttttgccatcgtccagggtaaaggtcagcgccgcatgcttgtcgataggcagaccatctttgttggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgccttcggttACCg < 1:21256‑M2/4‑1 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tGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATgcg < 1:1080159/235‑1 (MQ=39) gACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATgcggc < 1:636214/236‑1 (MQ=38) cggggcagtcacggtggcagtgccggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttttgccatcgtccagggtaaaggtcagcgccgcatgcttgtcgataggcaggccatctttgttggtcagcgtgatggggtaggtgatctcgccgccttcggttatc > 2:264120‑M2/161‑161 (MQ=255) cGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACcaaca < 2:502457/203‑1 (MQ=31) 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cAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCACCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCt < 1:311794/236‑1 (MQ=255) gtcacggtggcagtgccggttgtaccgttagccgggatggtgatggtggttttgccatcgtccagggtaaaggtcagcgccgcatgcttgtcgataggcagaccatctttgttggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgccttcggttACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTg < 1:598698‑M2/36‑1 (MQ=255) gCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCt > 1:1463746/1‑236 (MQ=255) tGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTgg < 1:1284328/236‑1 (MQ=255) tGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTgg > 1:1281925/1‑236 (MQ=255) ggCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATgcggc > 1:1284695/1‑218 (MQ=39) aTCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGTCCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATg < 1:552725/235‑1 (MQ=255) aGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCaa > 1:1314580/1‑236 (MQ=255) gggCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTg > 2:934554/1‑184 (MQ=31) gggCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCg > 2:1001411/1‑191 (MQ=33) cgttagcccggatggtgatggtggttttgccctcgtccagggtaaaggtcagcgccgcatgcttgtcgataggcagaccatctttgttggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgccttcggttACCGAAgg < 2:186911‑M2/8‑1 (MQ=255) aTCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGAcc > 2:756506/1‑207 (MQ=255) aaCTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACcaccatca < 1:978596/235‑1 (MQ=255) cgggatggtgatggtggtttggccatcgtccagggtaaaggtcagagccttatgcttgtcgataggcagaccatctttgttggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgccttcggttACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATgcggc < 1:798391‑M2/74‑1 (MQ=255) cTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACTTACACCCTGACGCTGAcacac > 1:728965/1‑159 (MQ=9) 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ggcggTGGACGCCACTGGTGCGACCGTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCa < 1:418269/218‑1 (MQ=255) cggTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACTATGGGAAAaccaccc > 1:361545/1‑224 (MQ=255) cggTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCg < 1:330806/236‑1 (MQ=255) cggTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCg > 1:1445643/1‑236 (MQ=255) ggtggttttgccatcgtccagggtaaaggtcagcgccgcatgcttgtcgataggcagaccatctttgttggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgccttcggttACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGa < 1:300258‑M2/62‑1 (MQ=255) cACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGa < 1:119093/185‑1 (MQ=255) tGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAacca > 2:672683/1‑209 (MQ=255) gTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACcaccatcacc < 2:1147293/215‑1 (MQ=255) gTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCaccatcaccatc < 2:1160447/218‑1 (MQ=255) tcgtccagggtaaaggtgagcgccgcatgcttgtcgataggcagaccatctttgttggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgccttcggttACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCt < 2:1107334‑M2/57‑1 (MQ=255) ttCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGAc < 1:1288177/131‑1 (MQ=33) ttCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGAc > 2:1288174/1‑131 (MQ=33) ttCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAg > 2:119092/1‑159 (MQ=37) tccagggtaaaggtcagcgccgcatgcttgtcgataggcagaccatctttgttggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgccttcggttACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATc < 1:3586‑M2/30‑1 (MQ=255) gaACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGTACAACCGGCACTGCCACCg > 1:1048173/1‑236 (MQ=255) gaACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCAAgcggcg > 2:331067/1‑163 (MQ=255) gaACCTCGAGCTGGACGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACATCATCATGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGTACAACCGGCACTGCCACCg < 1:812058/236‑1 (MQ=255) aaCCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGTACAACCGGCACTGCCACCg < 1:1336193/235‑1 (MQ=255) cTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGTACAACCGGCACTGCCACCg < 2:1314577/232‑1 (MQ=255) gcGAGCTGGGCGGTGCCGCGCAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTg < 2:177686/118‑1 (MQ=17) cGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGTACAACCGGCACTGCCACCGTGACTg > 1:489953/1‑236 (MQ=255) cGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGTACAACCGGCACTGCCACCGTGACTg > 1:885960/1‑236 (MQ=255) gtcagcgccgcagtcttgtcgatcggcagaccatctttgttggtcagcgtgatggtgtaggtgatctcgccgccttcggttACCGAAGGCGGCGAGATc < 2:45005‑M2/18‑1 (MQ=255) gAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGTACAACCGGCACTGCCACCg < 1:35497/229‑1 (MQ=255) gCTGGGCGGTGCCGCTACCGTGCAAGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCt < 2:779886/161‑1 (MQ=255) gCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTg > 2:1004270/1‑133 (MQ=33) gCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTg < 1:1004272/133‑1 (MQ=33) cTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGTACAACCGGcc > 2:440407/1‑216 (MQ=255) cTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGTACAACCGGCACTGCCACCGTGACTGcccc < 1:700478/236‑1 (MQ=255) gCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGTACAACCGGCACTGCCACCGTGACTGCCCCGGACAAc < 2:1281922/234‑1 (MQ=40) cgcgAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACcaccatcacc < 2:796609/181‑1 (MQ=255) cgcgAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGTACAACCGGCACTGCCACCGTGACTGCCCCGGACAACGt > 1:1155395/1‑234 (MQ=39) gcgAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGa < 1:70732/145‑1 (MQ=255) aaGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGTACAACCGGCACTGCCACCGTGACTGCCCCGGACAACGTCTACg < 1:995889/235‑1 (MQ=37) aGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCCAACGGTACAACCGGCACTGCCa > 2:1496801/1‑207 (MQ=38) gTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGTACAACCGGCACTGCCACCGTGACTGCCCCGGACAACGTCTACGTCGGCACCaa < 1:946760/236‑1 (MQ=32) cACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGTACAACCGGCACTGCCACCGTGACTGCCCCGGACAACGTCTACGTCGGCACCa < 2:1392601/233‑1 (MQ=31) gacgaAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCGTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGTACAACCGGCACTGCCACCGTGACTGCCCCGGACAACGTCTACGTCGGCACCaa < 2:78622/221‑1 (MQ=14) ggtggCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGTACAACCGGCACTGCCACCGTGACTGCCCCGGACAACGTCTACGTCGGCACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATc < 2:1414101/235‑1 (MQ=11) attgtgtaggtgatctcgccgccttcggttACCGAACGCGGCGAGATCACGGACACTATCACGCTCGCCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGAGAAGCATGCGGCGCTGACCTTTTCCCTGGACGATGGCAAAac < 2:1278128‑M2/104‑1 (MQ=255) ctcgccgccttcggttACCGAAGGCGGCGAGATCAACTACACCATCACACTGACCAACAAAGATGGTCTGc < 1:50352‑M2/55‑1 (MQ=255) gccttcggttACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCg < 2:889824‑M2/120‑1 (MQ=255) ACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGTACAACCGGCACTGCCACCGTGACTGCCCCGGACAACGTCTACGTCGGCACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGGAGGTGCGGACGTCGGTaa > 2:513036‑M2/1‑233 (MQ=255) | AACGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCTTCGGTAACCGAAGGCGGCGAGATCACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGATGGTCTGCCTATCGACAAGCATGCGGCGCTGACCTTTACCCTGGACGATGGCAAAACCACCATCACCATCCCGGCTAACGGTACAACCGGCACTGCCACCGTGACTGCCCCGGACAACGTCTACGTCGGCACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGGAGGTGCGGACGTCGGTAA > AE015451/208739‑209199 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |