New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 261582 | 75 (0.870) | 5 (0.060) | 5/342 | NT | 6.4% | coding (64/966 nt) | PP_0210 | putative Phycobiliprotein |
? | AE015451 | = 261583 | 75 (0.910) | coding (65/966 nt) | PP_0210 | putative Phycobiliprotein |
CTTTGCGCGCCCACGCCGCGCCAGCCTGCTGACCAGCCCTGAATTCACTCACCTTAAGCGTCACTGCCTGGCGTTGCTGCGCCACGAGGAAGGCCGCGAACTGCCGCGTCTGACTCCGCTGGGCCTGCCGGACACTGACCACCCACCGCTACGGATCGCGCTATGACTGACCGAACGACCGACAACCCCGACATTCTTGCCCTGTTACCTCGCCTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGCCGACCTGGAAGACCCGGATGGCTTGCCTTGGCTCACCGATGCCCTGCTGGCGGACGCCGCCGCCGAGGTGCGTGCCGAGGCCGCGCGCCTGCTTGAGGCCTGGGAAGAACCCGAAGTTGTGCAAGCCCTGTGCGCTGCGCTGGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGC > AE015451/261357‑261809 | cTTTGCGCGCCCACGCCGCGCCAGCCTGCTGACCAGCCCTGAATTCACTCACCTTAAGCGTCACTGCCTGGCGTTGCTGCGCCACGAGGAAGGCCGCGAACTGCCGCGTCTGACTCCGCTGGGCCTGCCGGACACTGACCACCCACCGCTACGGATCGCGCTATGACTGACCGAACGACCGACAACCCCGACATTCTTGCCCTGTTACCTCGCCTTGATGCCAGCGAcg < 2:1342697‑M2/229‑3 (MQ=255) ccACGCCGCGCCAGCCTGCTGACCAGCCCTGAATTCACTCACCTTAAGCGTCACTGCCTGGCGTTGCTGCGCCACGAGGAAGGCCGCGAACTGCCGCGTCTGACTCCGCTGGGCCTGCCGGACACTGACCACCCACCGCTACGGATCGCGCTATGACTGACCGAACGACCGACAACCCCGACATTCTTGCCCTGTTACCTCGCCTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCAt < 1:1038149/235‑1 (MQ=255) aCGCCGCGCCAGCCTGCTGACCAGCCCTGAATTCACTCACCTTAAGCGTCACTGCCTGGCGTTGCTGCGCCACGAGGAAGGCCGCGAACTGCCGCGTCTGACTCCGCTGGGCCTGCCGGACACTGACCACCCACCGCTACGGATCGCGCTATGACTGACCGAACGACCGACAACCCCGACATTCTTGCCCTGTTACCTCGCCTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGc > 1:1104752/1‑236 (MQ=255) ccTGCTGACCAGCCCTGAATTCACTCACCTTAAGCGTCACTGCCTGGCGTTGCTGCGCCACGAGGAAGGCCGCGAACTGCCGCGTCTGACTCCGCTGGGCCTGCCGGACACTGACCACCCACCGCTACGGATCGCGCTATGACTGACCGAACGACCGACAACCCCGACATTCTTGCCCTGTTACCTCGCCTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCt < 1:1128432/236‑1 (MQ=255) gctgACCAGCCCTGAATTCACTCACCTTAAGCGTCACTGCCTGGCGTTGCTGCGCCACGAGGAAGGCCGCGAACTGCCGCGTCTGACTCCGCTGGGCCTGCCGGACACTGACCACCCACCGCTACGGATCGCGCTATGACTGACCGAACGACCGACAACCCCGACATTCTTGCCCTGTTACCTCGCCTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGc > 1:1477124/1‑236 (MQ=255) aaTTCACTCACCTTAAGCGTCACTGCCTGGCGTTGCTGCGCCACGAGGAAGGCCGCGAACTGCCGCGTCTGACTCCGCTGGGCCTGCCGGACACTGACCACCCACCGCTACGGATCGCGCTATGACTGACCGAACGACCGACAACCCCGACATTCTTGCCCTGTTACCTCGCCTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGCCGACCTg > 2:809254/1‑229 (MQ=255) actcacCTTAAGCGTCACTGCCTGGCGTTGCTGCGCCACGAGGAAGGCCGCGAACTGCCGCGTCTGACTCCGCTGGGCCTGCCGGACACTGACCACCCACCGCTACGGATCGCGCTATGACTGACCGAACGACCGACAACCCCGACATTCTTGCCCTGTTACCTCGCCTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGCCGACCTGGAAGACCCGGAt < 1:834034/236‑1 (MQ=255) actcacCTTAAGCGTCACTGCCTGGCGTTGCTGCGCCACGAGGAAGGCCGCGAACTGCCGCGTCTGACTCCGCTGGGCCTGCCGGACACTGACCACCCACCGCTACGGATCGCGCTATGACTGACCGAACGACCGACAACCCCGACATTCTTGCCCTGTTACCTCGCCTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGCCGACCTGGAAGACCCGGAt < 1:820355/236‑1 (MQ=255) cacCTTAAGCGTCACTGCCTGGCGTTGCTGCGCCACGAGGAAGGCCGCGAACTGCCGCGTCTGACTCCGCTGGGCCTGCCGGACACTGACCACCCACCGCTACGGATCGCGCTATGACTGACCGAACGACCGACAACCCCGACATTCTTGCCCTGTTACCTCGCCTTGATGCCAGCGtcgctgg > 2:1154940‑M1/1‑177 (MQ=255) cacCTTAAGCGTCACTGCCTGGCGTTGCTGCGCCACGAGGAAGGCCGCGAACTGCCGCGTCTGACTCCGCTGGGCCTGCCGGACACTGACCACCCACCGCTACGGATCGCGCTATGACTGACCGAACGACCGACAACCCCGACATTCTTGCCCTGTTACCTCGCCTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGCCGAcc > 1:681148/1‑219 (MQ=255) cacCTTAAGCGTCACTGCCTGGCGTTGCTGCGCCACGAGGAAGGCCGCGAACTGCCGCGTCTGACTCCGCTGGGCCTGCCGGACACTGACCACCCACCGCTACGGATCGCGCTATGACTGACCGAACGACCGACAACCCCGACATTCTTGCCCTGTTACCTCGCCTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGCCGACCTGGAAGACCCGGATgg > 1:43041/1‑235 (MQ=255) cacCTTAAGCGTCACTGCCTGGCGTTGCTGCGCCACGAGGAAGGCCGCGAACTGCCGCGTCTGACTCCGCTGGGCCTGCCGGACACTGACCACCCACCGCTACGGATCGCGCTATGACTGACCGAACGACCGACAACCCCGACATTCTTGCCCTGTTACCTCGCCTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGCCGACCTGGAAGACCCGGATGGc > 1:779035/1‑236 (MQ=255) 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gacAACCCCGACATTCTTGCCCTGTTACCTCGCCTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGCCGACCTGGAAGACCCGGATGGCTTGCCTTGGCTCACCGATGCCCTGCTGGCGGACGCCGCCGCCGAGGTGCGTGCCGAGGCCGCGCGCCTGCTTGAGGCCTGGGAAGAACCCGAAGTTGTGCAAGCCCTGTGCGCTGCGCTGGCCGATgccgc < 1:1014836/236‑1 (MQ=255) gtacaTTCTTGCCCTGTTACCGCGCCTTGATGCCAGCGAcgctggcatcaaggcgaggtaacagggcaagaatggcggggttgtcggtcgttcggtcagtcatagcgcgatccgtagcggtgggt > 2:100621‑M2/3‑39 (MQ=255) cATTCTTGCCCTGTTACCTCGCCTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGCCGACCTGGAAGACCCGGATGGCTTGCCTTGGCTCACCGATGCCCTGCTGGCGGACGCCGCCGCCGAGGTGCGTGCCGAGGCCGCGCGCCTGCTTGAGGCCTggg > 2:1072068/1‑176 (MQ=255) cATTCTTGCCCTGTTACCTCGCCTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGCCGACCTGGAAGACCCGGATGGCTTGCCTTGGCTCACCGATGCCCTGCTGGCGGACGCCGCCGCCGAGGTGCGTGCCGAGGCCGCGCGCCTGCTTGAGGCCTGGGAAGAACCCGAAGTTGTGCAAGCCCTGTGCGCTGCGCTGGc > 1:392832/1‑216 (MQ=255) tCTTGCCCTGTTACCTCGCCTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGCCGACCTGGAAGACCCGGATGGCTTGCCTTGGCTCACCGATGCCCTGCTGGCGGACGCCGCCGCCGAGGTGCGTGCCGAGGCCGCGCGCCTGCTTGAGGCCTGGGAAGAACCCGAAGTTGTGCAAGCCCTGggcg > 1:303526/1‑203 (MQ=255) cccTGTTACCTCGCCTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGCCGACCTGGAAGACCCGGATGGCTTGCCTTGGCTCACCGATGCCCTGCTGGCGGACGCCGCCGCCGAGGTGCGTGCCGAGGCCGCGCGCCTGCTTGAGGCCTGGGAAGAACCCGAAGTTGTGCAAGCCCTGTGCGCTGCGCTGGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGc < 1:878384/235‑1 (MQ=255) cccTGTTACCTCGCCTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGCCGACCTGGAAGACCCGGATGGCTTGCCTTGGCTCACCGATGCCCTGCTGGCGGACGCCGCCGCCGAGGTGCGTGCCGAGGCCGCGCGCCTGCTTGAGGCCTGGGAAGAACCCGAAGTTGTGCAAGCCCTGTGCGCTGCGCTGGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGc > 1:792134/1‑235 (MQ=255) cTGTTACCTCGCCTTGATGCCAGCGtcgctggcatcaaggcgaggtaacagggcaagaatgtcggggttgtcggtcgttcggtcagtcatagcgcgatccgtagcggtgggtggtcagtgtccggcaggcccagcggagtcagacgcggcagttcgcggccttcctcgtgg > 1:386013‑M1/1‑25 (MQ=255) tGTTACCTCGCCTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGCCGACCTGGAAGACCCGGATGGCTTGCCTTGGCTCACCGATGCCCTGCTGGCGGACGCCGCCGCCGAGGTGCGTGCCGAGGCCGCGCGCCTGCTTGAGGCCTGGGAAGAACCCGAAGTTGTGCAAGCCCTGTGCGCTGCGCTGGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCg > 1:563928/1‑234 (MQ=255) ttACCTCGCCTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGCCGACCTGGAAGACCCGGATGGCTTGCCTTGGCTCACCGATGCCCTGCTGGCGGACGCCGCCGCCGAGGTGCGTGCCGAGGCCGCGCGCCTGCTTGAGGCCTgg > 2:452021/1‑162 (MQ=255) tACCTCGCCTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGCCGACCTGGAAGACCCGGATGGCTTGCCTTGGCTCACCGATGCCCTGCTGGCGGACGCCGCCGCCGAGGTGCGTGCCGAGGCCGCGCGCCTGCTTGAGGCCTGGGAAGAACCCGAAGTTGTGCAAGCCCTGTGCGCTGCGCTGGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGc < 1:1342700/235‑1 (MQ=255) ccTCGGCTTGATGCCAGCGCCGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGGGCt < 2:308/53‑1 (MQ=255) ccTCGCCTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGCCGACCTGGAAGACCCGGATGGCTTGCCTTGGCTCACCGATGCCCTGCTGGCGGACGCCGCCGCCGAGGTGCGTGCCGAGGCCGCGCGCCTGCTTGAGGCCTGGGAAGAACCCGAAGTTGTGCAAGcc > 2:1015072/1‑183 (MQ=255) ccTCGCCTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGCCGACCTGGAAGACCCGGATGGCTTGCCTTGGCTCACCGATGCCCTGCTGGCGGACGCCGCCGCCGAGGTGCGTGCCGAGGCCGCGCGCCTGCTTGAGGCCTGGGAAGAACCCGAAGTTGTGCAAGCCCTGTGCGCTGCGCTGGCCGATgccg < 2:1230795/208‑1 (MQ=255) ccTCGCCTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGCCGACCTGGAAGACCCGGATGGCTTGCCTTGGCTCACCGATGCCCTGCTGGCGGACGCCGCCGCCGAGGTGCGTGCCGAGGCCGCGCGCCTGCTTGAGGCCTGGGAAGAACCCGAAGTTGTGCAAGCCCTGTGCGCTGCGCTGGCCGATgccg > 1:1230798/1‑208 (MQ=255) ccTCGCCTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGCCGACCTGGAAGACCCGGATGGCTTGCCTTGGCTCACCGATGCCCTGCTGGCGGACGCCGCCGCCGAGGTGCGTGCCGAGGCCCCGCGCCTGCTTGAGGCCTGGGGAGCAccc > 2:373267/1‑168 (MQ=255) cTCGCCTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGCCGACCTGGAAGCCCCGGATGGCTTGCCTTGGCTCACCGATGCCCTGCTGGCGGACGCCGCCGCCGAGGTGCGTGCCGAGGCCGCGCGCCTGCTTGAGGCCTGGGAAGAACCCGAAGTTGTGCAAGCCCTGTGCGCTGCGCTGGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACg < 2:500485/220‑1 (MQ=255) cTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGCCGACCTGGAAGACCCGGATGGCTTGCCTTGGCTCACCGATGCCCTGCTGGCGGACGCCGCCGCCGAGGTGCGTGCCGAGGCCGCGCGCCTGCTTGAGGCCTGGGAAGAACCCGAAGTTGTGCAAGCCCTGTGCGCTGCGCTGGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGc > 2:1185633/1‑234 (MQ=255) tGATGCCAGCGtcgctggcatcaaggcgaggtaacagggcaagaatgtcggggttgtcgggcgttcggtcagtcatagcgcgatccgtagcggtgggtggtcagtgtccggcaggcccagcggagtaagacgcggcagtt > 2:625060‑M1/1‑11 (MQ=255) tGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGCCGACCTGGCAGACCCGGATGGCTTGCCTTGGCTCACCGATGCCCTGCTGGCGGACGCCGCCGCCGAGGTGCGTGCCGAGGCCTCGCGCCTGCTTGAGGc > 2:67470/1‑147 (MQ=255) gATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGCCGACCTGGAAGACCCGGATGGCTTGCCTTGGCTCACCGATGCCCTGCTGGCGGACGCCGCCGCCGAGGTGCGTGCCGAGGCCGCGCGCCTGCTTGAGGCCTGGGAAGAACCCGAAGTTGTGCAAGCCCTGTGCGCTGCGCTGGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCa < 2:792132/235‑1 (MQ=255) aTGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGCCGACCTGGAAGACCCGGATGGCTTGCCTTGGCTCACCGATGCCCTGCTGGCGGACGCCGCCGCCGAGGTGCGTGCCGAGGCCGCGCGCCTGCTTGAGGCCTGGGAAGAACCCGAAGTTGTGCAAGCCCTGTGCGCTGCGCTGGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGc > 2:1468842/1‑230 (MQ=255) ccAGCGAcgctggcatcaaggcgaggtaacagggcaagaatgtcggggttgtcggtcgttcggtcagtcatagcgcgatccgtagcggtgggtggtcagtgtccggcaggcccagcggagtcagacgcggcagttcgcggccttcctcgtggcgcagcaacgccaggcagtgacgcttaaggtg > 2:1154940‑M2/1‑7 (MQ=255) cGtcgctggcatcaaggcgaggtaacagggcaagaatgtcggggttgtcggtcgttcggtcagtcatagcgcgatccgtagcggtgggtggtcagtgtccggcaggcccagcggagtcagacgcggcagttcgcggccttcctcgtggcgcagcaacgccaggcagtgacgcttaaggtgagtgaattcagggctggtcagcaggctggcgcggcgtgggcgcgcaaag < 2:1342697‑M1/229‑228 (MQ=255) | CTTTGCGCGCCCACGCCGCGCCAGCCTGCTGACCAGCCCTGAATTCACTCACCTTAAGCGTCACTGCCTGGCGTTGCTGCGCCACGAGGAAGGCCGCGAACTGCCGCGTCTGACTCCGCTGGGCCTGCCGGACACTGACCACCCACCGCTACGGATCGCGCTATGACTGACCGAACGACCGACAACCCCGACATTCTTGCCCTGTTACCTCGCCTTGATGCCAGCGACGCTGGCGTGCGCCGCATCGCCCTGATCGAGCTGGCCGACCTGGAAGACCCGGATGGCTTGCCTTGGCTCACCGATGCCCTGCTGGCGGACGCCGCCGCCGAGGTGCGTGCCGAGGCCGCGCGCCTGCTTGAGGCCTGGGAAGAACCCGAAGTTGTGCAAGCCCTGTGCGCTGCGCTGGCCGATGCCGCCGAGCCTGTACGCCTGGCCGCTGCACAGAGCCTCAGC > AE015451/261357‑261809 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |