| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 2716261 = | 90 (1.050) | 5 (0.060) | 5/336 | NT | 6.0% | coding (976/2301 nt) | cti | Esterified fatty acid cis/trans isomerase |
| ? | AE015451 | 2716372 = | 73 (0.900) | coding (1087/2301 nt) | cti | Esterified fatty acid cis/trans isomerase | |||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
CAGTGGGTGCGCTCGCGCACGCCAAGTGGCAAGCCGGTCGATATCATTGCCACCCGCCGCCCCAACGACCCACCGGGCACGGACTTCTACTACCGGTTGATCCCGGTGCAGGGCGTGATCGTGCACAAGACGCACATCACCTACCCGATGGGGCCGCAGAAGCTCAAGCGCGTGAAGCAGCTGTTCTATGCCGGTGACTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCACCGATGCCAAGTACCGCGGCGAGGCTACCCCGCTGCT > AE015451/2716027‑2716490 | cggcatttcggcataggcttcacggcgcagtttctcgtagtcgttgcgcttgtcacgataggcgtgccacaggctcagcacactgcccacgtcatcgatctgaccaggcatggccagcagcggggtagcctcgccgcggtacttggcatcggtgatgtagcgatcgaaggccggctcctggaacagcgcccagaagttgtcgcggatcacgtcggtggcaatctgcccgcggcaca < 1:703361‑M1/2‑1 (MQ=255) aGTGGGTGCGCTCGCGCACGCCAAGTGGCAAGCCGGTCGATATCATTGCCACCCGCCGCCCCAACGACCCACCGGGCACGGACTTCTACTACCGGTTGATCCCGGTGCAGGGCGTGATCGTGCACAAGACGCACATCACCTACCCGATGGGGCCGCAGAAGCTCAAGCGCGTGAAGCAGCTGTTCTATGCCGGTGACTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCAc > 1:260691/1‑236 (MQ=255) gcatttcggcataggcttcacggcgcagtttctcgtagtcgttgcgcttgtcacgataggcgtgccacaggctcagcacactgcccacgtcatcgatctgaccaggcatggccagcagcggggtagcctcgccgcggtacttggcatcggtgatgtagcgatcgaaggccggctcctggaacagcgcccagaagttgtcgcggatcacgtcggtggcaatctgcccgcggcaca > 2:703359‑M1/233‑234 (MQ=255) atttcggcataggcttcacggcgcagtttctcgtagtcgttgcgcttgtcacgataggcgtgccacaggctcagcacactgcccacgtcatcgatctgaccaggcatggccagcagcggggtagcctcgccgcggtacttggcatcggtgatgtagcgatcgaaggccggctcctggaacagcgcccagaagttgtcgcggatcacgtcggtggcaatctgcccgcggcaCACCgg < 1:1155651‑M1/6‑1 (MQ=255) tttcggcataggcttcacggcgcagtttctcgtagtcgttgcgcttgtcacgataggcgtgccacaggctcagcacactgcccacgtcatcgatctgaccaggcatggccagcagcggggtagcctcgccgcggtacttggcatcggtgatgtagcgatcgaaggccggctcctggaacagcgcccagaagttgtcgcggatcacgtcggtggcaatctgcccgcggcaCACCgg > 1:221662‑M1/230‑235 (MQ=255) tGCGCTCGCGCACGCCAAGTGGCAAGCCGGTCGATATCATTGCCACCCGCCGCCCCAACGACCCACCGGGCACGGACTTCTACTACCGGTTGATCCCGGTGCAGGGCGTGATCGTGCACAAGACGCACATCACCTACCCGATGGGGCCGCAGAAGCTCAAGCGCGTGAAGCAGCTGTTCTATGCCGGTGACTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGc > 1:781308/1‑235 (MQ=255) gcgcACGCCAAGTGGCAAGCCGGTCGATATCATTGCCACCCGCCGCCCCAACGACCCACCGGGCACGGACTTCTACTACCGGTTGATCCCGGTGCAGGGCGTGATCGTGCACAAGACGCACATCACCTACCCGATGGGGCCGCAGAAGCTCAAGCGCGTGAAGCAGCTGTTCTATGCCGGTGACTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGt < 1:420559/236‑1 (MQ=255) cttcacggcgcagtttctcgtagtcgttgcgcttgtcacgataggcgtgccacaggctcagcacactgcccacgtcatcgatctgaccaggcatggccagcagcggggtagcctcgccgcggtacttggcatcggtgatgtagcgatcgaaggccggctcctggaacagcgcccagaagttgtcgcggatcacgtcggtggcaatctgcccgcggcacaccggaggcgtcggtg < 2:1423110‑M1/17‑12 (MQ=255) 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< 2:919663/208‑1 (MQ=255) aCGGACTTCTACTACCGGTTGATCCCGGTGCAGGGCGTGATCGTGCACAAGACGCACATCACCTACCCGATGGGGCCGCAGAAGCTCAAGCGCGTGAAGCAGCTGTTCTATGCCGGTGACTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTAcc < 1:211701/211‑1 (MQ=255) cGGACTTCTACTACCGGTTGATCCCGGTGCAGGGCGTGATCGTGCACAAGACGCACATCACCTACCCGATGGGGCCGCAGAAGCTCAAGCGCGTGAAGCAGCTGTTCTATGCCGGTGACTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCcggcgggg > 1:357095/1‑198 (MQ=255) gACTTCTACTACCGGTTGATCCCGGTGCAGGGCGTGATCGTGCACAAGACGCACATCACCTACCCGATGGGGCCGCAGAAGCTCAAGCGCGTGAAGCAGCTGTTCTATGCCGGTGACTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAgg > 1:270835/1‑184 (MQ=255) cTTCTACTACCGGTTGATCCCGGTGCAGGGCGTGATCGTGCACAAGACGCACATCACCTACCCGATGGGGCCGCAGAAGCTCAAGCGCGTGAAGCAGCTGTTCTATGCCGGTGACTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCg < 1:1035309/236‑1 (MQ=255) 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cctggaacagcgcccagaagttgtcgcggatcacgtcggtggcaatctgcccgcggcaCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCAt > 2:1424604‑M1/59‑156 (MQ=255) ggcTGTTCTATGCCGGTGACTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGcc < 2:217337/161‑1 (MQ=255) ttCTATGCCGGTGACTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAACCCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCcgc > 1:726275/1‑195 (MQ=255) ttCTATGCCGGTGACTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGc < 2:1316537/227‑1 (MQ=255) tATGCCGGTGACTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCcggcgg > 2:155429/1‑91 (MQ=255) ccGGTGACTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACAt < 1:777432/235‑1 (MQ=255) cGGTGACTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTg > 2:1186225/1‑198 (MQ=255) agaagttgtcgcggatcacgtcggtggcaatctgcccgcggcaCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCAGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTGCTTCGTGCGCACCTTCCTCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGAc < 1:66990‑M1/135‑1 (MQ=255) tGACTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTGCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATcc < 2:373052/140‑1 (MQ=255) aCTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCACCGa > 1:1077590/1‑235 (MQ=255) gCATGCTGCCGCGCTGCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCa < 1:231862/227‑1 (MQ=255) cATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGc > 2:1152725/1‑209 (MQ=255) cATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCa > 1:549413/1‑226 (MQ=255) aTGCAGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTgg < 1:1082235/188‑1 (MQ=255) tgcCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGa < 1:135306/57‑1 (MQ=255) gcCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAAc > 2:567176/1‑177 (MQ=255) gcCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTc < 1:79585/207‑1 (MQ=255) cTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAgg < 1:603504/190‑1 (MQ=255) ttCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCcggcgggg > 2:260911/1‑63 (MQ=255) ttCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCACCGATGCCAAGTACCgcggca < 2:1402511/234‑2 (MQ=255) cGGGCTACGGCCCCAGCCACCGTGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTc < 1:454078/197‑1 (MQ=255) cgaCGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCAcc < 1:285590/206‑1 (MQ=255) tgcccgcggcaCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCAGCGACGTGATCCGCGAc < 2:1522424‑M1/147‑1 (MQ=255) cGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCACCGATGCCAAGTACCGCGGCGAGGCTACCCCg < 1:775310/235‑1 (MQ=255) cgcgCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCACCGATGCCAAGTACCGCGGCGa < 1:703391/220‑1 (MQ=255) gcCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCcgc > 1:227674/1‑146 (MQ=255) ccACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCACCGATGCCAAGTACCgcgg < 1:1009276/213‑1 (MQ=255) ccACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCACCGATGCCAAGTACCgcgg > 2:1009274/1‑213 (MQ=255) ccACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCACCGATGCCAAGTACCGCGGCGAGGCTACCCCgctgct < 2:1308856/231‑1 (MQ=255) ccACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCAGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACAt < 1:62161/192‑1 (MQ=255) CACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCCTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGc < 2:213255‑M1/128‑1 (MQ=255) | CAGTGGGTGCGCTCGCGCACGCCAAGTGGCAAGCCGGTCGATATCATTGCCACCCGCCGCCCCAACGACCCACCGGGCACGGACTTCTACTACCGGTTGATCCCGGTGCAGGGCGTGATCGTGCACAAGACGCACATCACCTACCCGATGGGGCCGCAGAAGCTCAAGCGCGTGAAGCAGCTGTTCTATGCCGGTGACTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCACCGATGCCAAGTACCGCGGCGAGGCTACCCCGCTGCT > AE015451/2716027‑2716490 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |