New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 2716261 = | 90 (1.050) | 5 (0.060) | 5/336 | NT | 6.0% | coding (976/2301 nt) | cti | Esterified fatty acid cis/trans isomerase |
? | AE015451 | 2716372 = | 73 (0.900) | coding (1087/2301 nt) | cti | Esterified fatty acid cis/trans isomerase |
GTGCACAAGACGCACATCACCTACCCGATGGGGCCGCAGAAGCTCAAGCGCGTGAAGCAGCTGTTCTATGCCGGTGACTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCACCGATGCCAAGTACCGCGGCGAGGCTACCCCGCTGCTGGCCATGCCTGGTCAGATCGATGACGTGGGCAGTGTGCTGAGCCTGTGGCACGCCTATCGTGACAAGCGCAACGACTACGAGAAACTGCGCCGTGAAGCCTATGCCGAAATGCCG > AE015451/2716147‑2716605 | gTGCACAAGACGCACATCACCTACCCGATGGGGCCGCAGAAGCTCAAGCGCGTGAAGCAGCTGTTCTATGCCGGTGCCTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCa < 1:294527/236‑1 (MQ=255) aaGACGCACATCACCTACCCGATGGGGCCGCAGAAGCTCAAGCGCGTGAAGCAGCTGTTCTATGCCGGTGACTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGtgtg < 2:1176370/221‑1 (MQ=255) aaGACGCACATCACCTACCCGATGGGGCCGCAGAAGCTCAAGCGCGTGAAGCAGCTGTTCTATGCCGGTGACTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGtgtg > 1:1176373/1‑221 (MQ=255) tACCCGATGGGGCCGCAGAAGCTCAAGCGCGTGAAGCAGCTGTTCTATGCCGGTGACTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGa < 1:517486/232‑1 (MQ=255) ccGAGGGGCCCGCAGACGCTCAAGCGCGTGAAGCAGCTGTTCTAGGCCGGTGACTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTGCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGcc < 1:216244/205‑1 (MQ=255) gATGGGGCCGCAGAAGCTCAAGCGCGTGAAGCAGCTGTTCTATGCCGGTGACTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGGACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGgggt > 1:167786/1‑200 (MQ=255) gggCCGCAGAAGCTCCAGCGCGTGAAGCAGCTGTTCTATGCCGGTGACTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACt < 1:603595/235‑1 (MQ=255) gggCCGCAGAAGCTCAAGCGCGTGAAGCAGCTGTTCTATGCCGGTGACTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACt > 1:1308859/1‑235 (MQ=255) ccGCAGAAGCTCAAGCGCGTGAAGCAGCTGTTCTATGCCGGTGACTGGCATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAATCCCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCt < 1:845066/236‑1 (MQ=255) 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gtcgcggatcacgtcgctggcaatctgcccgcggcacaccgggccacggatgaaggtgcgcacgaagtactcggcgttatccagcatgaactggtagcgcgccaccgccgggatcgcctcgaaggtttcaaacggattggcccggtgTGCCGCGGGCa < 2:1522424‑M2/11‑1 (MQ=255) gCATGCTGCCGCGCTGCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCa < 1:231862/227‑1 (MQ=255) cATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGc > 2:1152725/1‑209 (MQ=255) cATGCTGCCGCGCTTCCGGGCTACGGCCCGCGCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCa > 1:549413/1‑226 (MQ=255) 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cgcgCCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCACCGATGCCAAGTACCGCGGCGa < 1:703391/220‑1 (MQ=255) gcCACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCcgc > 1:227674/1‑146 (MQ=255) ccACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCACCGATGCCAAGTACCgcgg < 1:1009276/213‑1 (MQ=255) ccACCGGGCCAAT‑CCGTTTGAAACCTTCGAGGCGATCCCGGCGGTGGCGCGCTACCAGTTCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCACCGATGCCAAGTACCgcgg > 2:1009274/1‑213 (MQ=255) 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ttCATGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCACCGATGCCAAGTACCGCGGCGAGGCTACCCCGCTGCTGGCCATGCCTGGTCAGATCGATGACGTGGGCAGTGTGCTGAGCCTGTGGCACGCCTATCGTg < 1:1351598/235‑1 (MQ=255) ttCATGCTGGATAACGCCGAGTACGTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCACGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAgg < 2:182633/112‑1 (MQ=255) tGCTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCACCGATGCCAAGTACCGCGCCCAGGCTACCCCgctgct < 2:829196/169‑1 (MQ=255) cgcgccaccgccgggatcgcctcgaaggtttcaaacggattggcccggtgTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCACCGATGCCAAGTACCgcggc > 1:1117075‑M2/51‑152 (MQ=255) cTGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCACCGATGCCAAGTACCGCGGCGAGGCTACCCCGCTGCTGGCCATGCCTGGTCAGATCGATGACGTGGGCAGTGTGCTGAGCCTGTGGCACGCCTATCg < 1:561627/227‑1 (MQ=255) tGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCAc > 2:296064/1‑130 (MQ=255) tGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCACCGATGCCAAGTACCGCGGCGAGGCTACCCCGCTGCTGGCCATGCCTGGTCAGATCGATGACGTGGGCAGTGTGCTGAGc > 2:408331/1‑209 (MQ=255) tGGATAACGCCGAGTACTTCGTGCGCACCTTCATCCGTGGCCCGGTGTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCACCGATGCCAAGTACCGCGGCGAGGCTACCCCGCTGCTGGCCATGCCTGGTCAGATCGATGACGTGGGCAGTGTGCTGAGCCTGTGGCACGCCTATCGTGACAAgcgc > 1:1293275/1‑236 (MQ=255) 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ccggtgTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCACCGATGCCAAGTACCGCGGCGAGGCTACCCCGCTGCTGGCCATGCCTGGTCAGATCGATGACGTGGGCAGTGTGCTGAGCCTGTGGCACGCCTATCGTGACAAGCGCAACGACTACGAGAAACTGCGCCGTGAAGCCTATGCCGaaa > 1:221662‑M2/7‑235 (MQ=255) ccggtgTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCACCGATGCCAAGTACCGCGGCGAGGCTACCCCGCTGCTGGCCATGCCTGGTCAGATCGATGACGTGGGCAGTGTGCTGAGCCTGTGGCACGCCTATCGTGACAAGCGCAACGACTACGAGAAACTGCGCCGTGAAGCCTATGCCGAAAt < 1:1155651‑M2/230‑1 (MQ=255) cggtgTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCACCGATGCCAAGTACCGCGGCGAGGCTACCCCGCTGCTGGCCATGCCTGGTCAGATCGATGACGTGGGCAGTGTGCTGAGCCTGTGGCACGCCTATCGTGACAAGCGCAACGACTAc > 2:1248816‑M2/6‑203 (MQ=255) ggtgTGCCGCGGGCAGATTGCCACCGACGTGATCCGCGACAACTTCTGGGCGCTGTTCCAGGAGCCGGCCTTCGATCGCTACATCACCGATGCCAAGTACCGCGGCGAGGCTACCCCGCTGCTGGCCATGCCTGGTCAGATCGATGACGTgg < 2:1117072‑M2/148‑1 (MQ=255) 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AE015451/2716147‑2716605 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |